Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
4926 |
296.4 |
4517418 |
96.8% |
4372860 |
264.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,974,603 |
3 bp→CGA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,974,603 | 0 | G | C | 99.1%
| 750.5
/ NA
| 328 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); major base C (161/161); minor base A (2/1); total (163/165) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,974,604 | 0 | C | G | 99.7%
| 763.6
/ NA
| 328 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (162/164); total (163/165) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,974,605 | 0 | T | A | 99.4%
| 764.4
/ NA
| 328 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/0); new base A (161/163); total (163/165) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 328 total aligned reads displayed.
TACGGTCAGTATACGGAATGTAGCTGTGCCAGGACTGGCGTTCGCCCATTTTCTCCGCACCACGGTGGTGGTAACCGATGTCTGGTACGCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCGCTCGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGGCTGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTACGATCGATAGAAATCAGATGGTAGAAAACGGAAAAATCCGCGGCAGGTAACCCTTCGCG > CP042583/1974323‑1974884
|||
taCGGAATGTAGCTGTGCCAGGACTGGCGTTCGCCCATTTTCTCCGCACCACGGTGGTGGTAACCGATGTCTGGTACGCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAgcgcgcg < 2:273062/289‑1 (MQ=255)
attaaGCTGTTCCAGGACTTGGTTTCGGCCAGTTTCTCCGCGCCATGGGGGTGGTAACGGATGTCTGGTACACAGGCTACGATCTCTGCGCCAGCGAGTTGCAAAGCGGTACGGAAGACCCCGTGCGCGGGGGGGGGGGTCGGACCGAGGTTGAGTAACATGAAGGTCTCGTTTTCGGTTCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCAGCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGAt < 2:2037106/285‑1 (MQ=255)
gTAGCTGTGCCAGGACTGGCGTTCGCCCATTTTCTCCGCACCACGGTGGTGGTAACCGATGTCTGGTACGCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGCGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGACCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCCCAAACGCAGAGAATTCGTTAGCGCGCGCCGGATaa > 2:2108840/1‑289 (MQ=255)
gTAGCTGTGCCAGGACTGGCGTTCGCCCATTTTCTCCGCACCACGGTGGTGGTAACCGATGTCTGGTACGCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATaa > 1:2151539/1‑289 (MQ=255)
gTAGCTGTGCCAGGACTGGCGTTCGCCCATTTTCTCCGCACCACGGTGGTGGTAACCGATGTCTGGTACGCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATaa > 1:682507/1‑289 (MQ=255)
gTAGCTGTGCCAGGACTGGCGTTCGCCCATTTTCTCCGCACCACGGTGGTGGTAACCGATGTCTGGTACGCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATaa > 1:1853642/1‑289 (MQ=255)
tgCCAGGACTGGCGTTCGCCCATTTTCTCCGCACCACGGTGGTGGTAACCGATGTCTGGTACGCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCTCGCCGGATAATCCTTAc > 1:417946/1‑289 (MQ=255)
ggCGTTCGCCCATTTTCTCCGCACCACGGTGGTGGTAACCGATGTCTGGTACGCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAACCGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACTCAGGGGGTg > 2:1368981/1‑289 (MQ=255)
ggCGTTCGCCCATTTTCTCCGCACCACGGTGGTGGTAACCGATGTCTGGTACGCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTg < 1:657647/289‑1 (MQ=255)
gCGTTCGCCCATTTTCTCCGCACCACGGTGGTGGTAACCGATGTCTGGTACGCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTg > 1:932560/1‑288 (MQ=255)
cGTTCGCCCATTTTCTCCGCACCACGGTGGTGGTAACCGATGTCTGGTACGCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGa > 1:36592/1‑288 (MQ=255)
tctcCGCACCACGGTGGTGGTAACCGATGTCTGGTACGCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTg < 1:1737831/289‑1 (MQ=255)
cGCACCACGGTGGTGGTAACCGATGTCTGGTACGCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATTAGCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGctg > 2:460139/1‑286 (MQ=255)
tAACCGATGTCTGGTACGCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGc < 1:528425/288‑1 (MQ=255)
aCCGATGTCTGGTACGCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGGACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGca < 2:254456/272‑1 (MQ=255)
aCCGATGTCTGGTACGCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAgg > 1:1539712/1‑289 (MQ=255)
cGATGTCTGGTACGCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGAc < 2:308214/252‑1 (MQ=255)
gATGTCTGGTACGCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTc < 2:618023/289‑1 (MQ=255)
gCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCg < 1:837882/289‑1 (MQ=255)
aGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGaa > 1:1794896/1‑289 (MQ=255)
tCGACCATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAACTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTCGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTTCCCTTTTCAGGTTTGCGGCATCatg > 2:683402/1‑258 (MQ=255)
tCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCCTGATGCGTCGCAGGGCCGGGGGAACCTCGagca > 2:658587/1‑286 (MQ=255)
gaagaTCTCATTGGCATCGAGTTGCAAAACGCTACGGAAAGCGCCGTGCGCCGACGTGTGGTTCGGACCGATGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCACCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTa < 2:1521135/285‑1 (MQ=255)
gACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAgc > 1:1671856/1‑201 (MQ=255)
ctTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCaa > 1:1324103/1‑288 (MQ=255)
tgcGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGGGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAAc < 1:905127/287‑1 (MQ=255)
aGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAgg > 2:17555/1‑289 (MQ=255)
ttGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGGCGAAAGTACTGCCAAACAGATCCCAGGtt > 1:727514/1‑289 (MQ=255)
gCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGc > 2:1910987/1‑200 (MQ=255)
gCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTc < 1:460139/289‑1 (MQ=255)
gCAAAACGAGACGGACAGCCACGGGCGCCGACTGGTGGTGAGGACCGAGGTTGGGGAACCTGAAGTCCTCGTTTTCGGGGCCGGGCGTCATCCCCCTCTCTGCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGGTGGGCTTGGGTCAGCTCAAACGGAGAGAATTCGGTAGCGCGCGACGGATAATCTTGACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTGGCGGCATCATGAGGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGttt < 2:2075547/288‑1 (MQ=255)
cAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTc < 2:970058/288‑1 (MQ=255)
aaaCGATACGGAAAGCCCCGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACg < 1:1475435/289‑1 (MQ=255)
ccccGTGCGCCGACGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGc > 2:1452140/1‑289 (MQ=255)
cccGTGCGCCGCCGGGTGGTTCGGGCCGAGGTTGAGGACCATGAGGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGt < 2:1002426/284‑1 (MQ=255)
tgcgccgacGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGACTTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGCTGCGTCCCAGGTTCGGGTGACCTGCGAAAGTAGTGCCAAACAAGTCCAAGGTTTCACGTCCATACCGGTTACCGTTCg > 2:905553/9‑289 (MQ=255)
tgcgccgacGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAgg > 2:1261694/9‑222 (MQ=255)
tgcgccgacGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAg > 2:470883/9‑283 (MQ=255)
cgacGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGaa < 2:932560/285‑1 (MQ=255)
cgacGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGaa < 1:2213281/285‑1 (MQ=255)
cgacGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGaa < 2:162209/285‑1 (MQ=255)
cgacGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGaa < 1:609729/285‑1 (MQ=255)
gggTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGt < 1:1597471/288‑1 (MQ=255)
agttgttgcGGACGGCGGTTGAGGGACATGAATGCCTCGTTTTCGGTACCGCTCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGTGCTTCCATCTCCAGGTCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTGCGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGt < 2:229813/280‑1 (MQ=255)
ttCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTg < 1:1015638/288‑1 (MQ=255)
ggACCGAGGTTGATGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTGGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAgg < 2:2151539/289‑1 (MQ=255)
ggACCGAGGTTGAGGACCATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAgg < 1:40898/289‑1 (MQ=255)
ggACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAgg < 1:1368981/289‑1 (MQ=255)
aCCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGGTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGtg > 1:1268168/1‑288 (MQ=255)
aCCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCCTCCGGTTTGAAGGTCAGGGTTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGGTAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCGAGGTTTGCGGCATCATGATGCAGCCAAGGTTCGGGTTCCCGTAGAAAGGAATGCCAAACAGATTCCAGGTTTCACGCTCATGCCAGTTCGCGCTCGGGCACAGttgtgtcacgggc > 2:1062133/1‑278 (MQ=255)
ccGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTc < 1:757431/288‑1 (MQ=255)
ccGAGGGTGGGGAACATGACGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTCCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTc < 2:1730813/288‑1 (MQ=255)
ggTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAg > 2:1656094/1‑216 (MQ=255)
ggTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAAGGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTAc > 2:2230671/1‑289 (MQ=255)
tGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTg < 1:2066101/289‑1 (MQ=255)
tGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTc > 1:1702054/1‑229 (MQ=255)
tGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGACCCCAGGTTTCACGCTCCTACCGGTTACCGTTCGGGAACTGTTTGGTCAAGGCCGTCACGtcccggctcgt > 2:1977698/1‑279 (MQ=255)
gTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCa > 1:2247169/1‑232 (MQ=255)
tCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTCCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGCTCCCAGGTTTCCCGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAAAAGTTTGGTGACGGTCGGTCCGTGCAGGTCGTTTTCt > 2:1346836/1‑288 (MQ=255)
ccTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCCCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGaa < 2:849782/250‑1 (MQ=255)
cTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGcc > 1:433016/1‑289 (MQ=255)
tCGTTTTCGGGTACGCCCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCGTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCa < 2:1932588/289‑1 (MQ=255)
cGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCa > 1:993676/1‑288 (MQ=255)
ttCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAgcgc > 1:1119455/1‑288 (MQ=255)
ttCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGcc < 2:1119455/289‑1 (MQ=255)
ttCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGcc < 1:1972644/289‑1 (MQ=255)
ttCGGTGCCCCCCTTCACCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGATCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGcc < 2:1324103/289‑1 (MQ=255)
tccgggaccGCGCTTCAACCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCGTCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGcc < 2:36592/282‑1 (MQ=255)
gtgcgcgggttCATCCCCCACCTTTCCGGTTGGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGTTCCTGGTTGGCTTTGGTCAGCTCAACCGGCGCGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTTCGCGGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGACAAACAGGTCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAATAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCgccgcc < 2:583890/279‑1 (MQ=255)
gggCCGCGCTTCAGCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGTGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCAcc < 2:738327/286‑1 (MQ=255)
gCCGCGCTTCATCCCCCCCCCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGGTCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCtt < 1:2085855/288‑1 (MQ=255)
gcgcTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCg > 1:271412/1‑143 (MQ=255)
gcTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCa < 1:79471/288‑1 (MQ=255)
tCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTc < 2:422748/289‑1 (MQ=255)
tCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTc < 1:17555/289‑1 (MQ=255)
aCTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAgcg > 2:1081718/1‑264 (MQ=255)
aCTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAgcg < 1:1081718/264‑1 (MQ=255)
aCTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGtt > 1:2119515/1‑289 (MQ=255)
ctTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTTGTCAGCTCAAACGGCGAGAAGTCGGTAGCGCGAGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTAGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTAcg < 1:1256004/289‑1 (MQ=255)
ctTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTAcg < 1:2230671/289‑1 (MQ=255)
ttCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTAcga > 1:555910/1‑289 (MQ=255)
cGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGca < 1:1633418/125‑1 (MQ=255)
cGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTAcgatc > 2:1204366/1‑288 (MQ=255)
tttGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTAcgatcgat < 2:772120/288‑1 (MQ=255)
tttGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTAcgatcgat < 1:32614/288‑1 (MQ=255)
tGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTACGATCGATAGa > 1:1503732/1‑289 (MQ=255)
cAGGGGTTCCATTTCCAGATCCGGTTTGGCTTTGGGCAGCTCAAGCGGGTAGAAGTCGGTAGCGCGCGTCGAATAATCTTTACGTAGCGGGTGACCTTTCCAAGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTACGATCGATAGAAATCAg < 1:1062133/288‑1 (MQ=255)
ccATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCCTGATGTCGCGGTTACGATCGATAGAAATCAGATGGTAGaa > 2:1794190/1‑289 (MQ=255)
tcCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTACGATCGATAGAAATCAGATGGTAGAAAACgg > 1:1937911/1‑289 (MQ=255)
ccAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTACGATCGATAGAAATCAGATGGTAGAAAACGGa > 1:2040921/1‑289 (MQ=255)
gATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTACGATCGATAGAAATCAGATGGTAGAAAACGGaaaa > 2:797449/1‑289 (MQ=255)
aTCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTAcgat > 2:1850553/1‑257 (MQ=255)
aTCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTACGATCGATAGAAATCAGATGGTAGAAAACGGaaaaa > 1:1422607/1‑289 (MQ=255)
tGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTACGATCGATAGAAATCAGATGGTAGAAAACGGAAAAATcc > 2:1547650/1‑288 (MQ=255)
tttGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCCTCAGCATGATGTCGCGGTTACGATCGATAGAAATCAGATGGTAGAAAACGGAAAAATCcgcg > 2:1683401/1‑289 (MQ=255)
ttGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCatga > 1:1201450/1‑235 (MQ=255)
ttGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTACGATCGATAGAAATCAGATGGTAGAAAACGGAAAAATCcgcg > 1:1460666/1‑288 (MQ=255)
cTTTGGTCAGCTCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCGACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTACGTTCGATAGAAACCAGATGGTAGAAAACGGAAAAATCCGCGGCatg > 2:116147/1‑287 (MQ=255)
tCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGGTAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATTCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGAAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTACGATCGATAGAAATCAGATGGTAGAAAACGGAAAAATCCGCGGCAGGTAACCCTTcg < 1:98125/288‑1 (MQ=255)
tCAAACGGCGAGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTACGATCGATAGAAATCAGATGGTAGAAAACGGAAAAATCCGCGGCAGGTAACCCTTcgc < 1:1346836/289‑1 (MQ=255)
|||
TACGGTCAGTATACGGAATGTAGCTGTGCCAGGACTGGCGTTCGCCCATTTTCTCCGCACCACGGTGGTGGTAACCGATGTCTGGTACGCAGTCGACAATCTCTTCGCCATCGAGTTGCAAAACGATACGGAAAGCCCCGTGCGCGCTCGGGTGGTTCGGACCGAGGTTGAGGAACATGAAGTCCTCGTTTTCGGTGCCGCGCTTCATCCCCCACTCTTCCGGTTTGAAGGTCAGGGCTTCCATCTCCAGATCCTGTTTGGCTTTGGTCAGCTCAAACGGGCTGAATTCGGTAGCGCGCGCCGGATAATCTTTACGCAGCGGGTGACCTTTCCAGGTTTGCGGCATCATGATGCGTCGCAGGTTCGGGTGACCGTCGAAAGTAATGCCAAACAGATCCCAGGTTTCACGCTCATACCAGTTAGCGTTCGGGAACAGTTTGGTGAAGGTCGGTACGTGCAGGTCGTTTTCTGCCAGCGCCACCTTCAGCATGATGTCGCGGTTACGATCGATAGAAATCAGATGGTAGAAAACGGAAAAATCCGCGGCAGGTAACCCTTCGCG > CP042583/1974323‑1974884
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A