Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,671,963 |
T→A |
S66S (TCA→TCT) |
pntA ← |
pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,671,963 | 0 | T | A | 100.0%
| 671.2
/ NA
| 200 | S66S (TCA→TCT) | pntA | pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (107/93); total (107/93) |
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
ATCGCCATCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGC > CP009273/1671817‑1672109
|
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aTCGCCATCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGAc > 1:242990/1‑150 (MQ=255)
aTCGCCATCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGAc < 1:3420184/150‑1 (MQ=255)
aTCGCCATCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGAc > 1:929949/1‑150 (MQ=255)
cGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGc > 2:1622144/1‑150 (MQ=255)
ggTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCt > 2:471069/1‑150 (MQ=255)
ggTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCt > 1:3239026/1‑150 (MQ=255)
ggTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCt > 1:2143569/1‑150 (MQ=255)
ggTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAAGTTCAGCATCTAACGGCGCCTTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCt > 2:2535048/1‑150 (MQ=255)
acgttacgttCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTc < 1:3009768/150‑1 (MQ=255)
cgttacgttCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTcc < 1:1382704/150‑1 (MQ=255)
gttacgttCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTccc > 2:515522/1‑150 (MQ=255)
gttacgttCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTccc > 2:1533866/1‑150 (MQ=255)
tacgttCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCtt < 2:632898/150‑1 (MQ=255)
tacgttCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCtt < 2:632982/150‑1 (MQ=255)
ttCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATGGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTAc < 1:2481470/150‑1 (MQ=255)
tCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACa > 2:418862/1‑150 (MQ=255)
ccGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACaa > 2:3075062/1‑150 (MQ=255)
ccGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACaa > 1:2714292/1‑150 (MQ=255)
cAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAAttt < 2:1444014/150‑1 (MQ=255)
cAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAAttt > 2:3595913/1‑150 (MQ=255)
tttttGCATTAATTCCGGAGTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAgc < 2:704287/150‑1 (MQ=255)
tttGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAgcgc > 1:2796098/1‑150 (MQ=255)
tttGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAgcgc < 1:2884138/150‑1 (MQ=255)
ttGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGcc > 2:758207/1‑150 (MQ=255)
tGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGccc < 1:3541669/150‑1 (MQ=255)
gCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCATAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCg < 2:250885/150‑1 (MQ=255)
gCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCg > 2:1716242/1‑150 (MQ=255)
cATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGc > 1:193738/1‑150 (MQ=255)
aTTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCt > 1:958157/1‑150 (MQ=255)
aTTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCAACATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATAAACTCAAACTGCCAGACGCTATACCCTTCTACAATTACAGCGCCCGCt > 1:2860629/1‑150 (MQ=255)
tAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTg > 2:1829657/1‑150 (MQ=255)
aaTTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGc > 1:3688797/1‑150 (MQ=255)
aaTTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGc > 2:2166388/1‑150 (MQ=255)
aTTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGca > 2:3111806/1‑150 (MQ=255)
ttCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGcac > 2:1451553/1‑150 (MQ=255)
gATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACg > 2:1221743/1‑150 (MQ=255)
tCTGCGCAGGCCAGTTAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCtt < 1:1875066/150‑1 (MQ=255)
tCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCtt < 2:10133/150‑1 (MQ=255)
tCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCtt > 1:2568358/1‑150 (MQ=255)
tCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGAACAAACGCtt > 2:3220632/1‑150 (MQ=255)
cTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTACAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTACAGCGCCCGCTTGCACAAACGCttt > 1:1571984/1‑150 (MQ=255)
tGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTa > 2:172973/1‑150 (MQ=255)
cAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGt > 1:1594350/1‑150 (MQ=255)
cAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATGGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGt < 1:1093408/150‑1 (MQ=255)
aGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTc > 1:2639039/1‑150 (MQ=255)
ccAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCaaa > 2:291571/1‑150 (MQ=255)
cAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCaaaa > 1:1560368/1‑150 (MQ=255)
cAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCaaaa > 1:1560352/1‑150 (MQ=255)
aGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAAc > 2:103160/1‑150 (MQ=255)
aaCTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCa > 1:3271393/1‑150 (MQ=255)
aaCTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTAGTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCa < 2:1324485/150‑1 (MQ=255)
tCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGtt < 2:2344924/150‑1 (MQ=255)
aCCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGa > 2:1802395/1‑150 (MQ=255)
aCCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGa < 2:2772935/150‑1 (MQ=255)
aCCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGa > 1:2772935/1‑150 (MQ=255)
ccAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGAc < 1:1007600/150‑1 (MQ=255)
aGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGAccc > 2:3534509/1‑150 (MQ=255)
aGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGAccc > 1:2039794/1‑150 (MQ=255)
aGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGAccc < 1:1829657/150‑1 (MQ=255)
gCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCcg < 1:1254191/150‑1 (MQ=255)
gTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCcgcg > 1:1173207/1‑150 (MQ=255)
gTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCcgcg < 2:3321876/150‑1 (MQ=255)
tCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGcgccgc < 2:2647704/150‑1 (MQ=255)
gATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTa < 1:3092135/150‑1 (MQ=255)
gATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCAGCTCTCTa < 1:667923/150‑1 (MQ=255)
tAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGAc < 1:103160/150‑1 (MQ=255)
aaCGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACg > 1:802804/1‑150 (MQ=255)
cGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGt < 1:1741497/150‑1 (MQ=255)
cAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTaa < 2:681162/150‑1 (MQ=255)
aaTTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTaaa > 1:2251223/1‑150 (MQ=255)
tttCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAAc < 2:1934929/150‑1 (MQ=255)
tcatcaTCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAAccc > 1:3670286/1‑150 (MQ=255)
atcatcTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAg > 1:707486/1‑150 (MQ=255)
tcatcTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGt > 2:579626/1‑150 (MQ=255)
tcatcTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGt > 2:304883/1‑150 (MQ=255)
catcTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGtt < 1:1211983/150‑1 (MQ=255)
tcTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTc < 2:2391994/150‑1 (MQ=255)
cTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTca > 2:1845959/1‑150 (MQ=255)
tAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTcag < 2:3367978/150‑1 (MQ=255)
tAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTcag < 2:1370880/150‑1 (MQ=255)
aaCGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTcagc < 1:1533866/150‑1 (MQ=255)
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GCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCG < SRR19973061.1483992/150‑1 (MQ=60)
CGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGC > SRR19973061.1572063/1‑150 (MQ=60)
GTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCG > SRR19973061.1176175/1‑150 (MQ=60)
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AGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTC > SRR19973061.2642536/1‑150 (MQ=60)
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AATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAA > SRR19973061.344104/1‑150 (MQ=60)
TTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACC < SRR19973061.911893/150‑1 (MQ=60)
TCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCC > SRR19973061.3679670/1‑150 (MQ=60)
ATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAG > SRR19973061.709331/1‑150 (MQ=60)
CATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTT < SRR19973061.1215021/150‑1 (MQ=60)
ATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTT > SRR19973061.2792921/1‑150 (MQ=60)
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CATTGACCTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTT > SRR19973061.2326814/1‑150 (MQ=60)
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CTTCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGT > SRR19973061.3602970/1‑150 (MQ=60)
TCAGAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTT < SRR19973061.419998/150‑1 (MQ=60)
GAATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTG > SRR19973061.1131631/1‑150 (MQ=60)
AATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGG > SRR19973061.2082336/1‑150 (MQ=60)
AATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGG > SRR19973061.162433/1‑150 (MQ=60)
ATGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGC < SRR19973061.1401579/150‑1 (MQ=60)
TGATCTCAGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCG < SRR19973061.2171827/150‑1 (MQ=60)
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CCATCGCCATCACGGTCACGTTACGTTCCGCAAGTTTTTGCATTAATTCCGGATTCTGCGCAGGCCAGATAAAACTCACCAGCGTTGTCCCAGGATTCAGTAACGCAATTTCATCATCTAACGGCGCATTGACCTTCAGAATGATCTCTGACTGCCAGACGCTATTCCCTTCTACAATTTCAGCGCCCGCTTGCACAAACGCTTTATCGTCAAAACTTGCCAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCG > CP009273/1671815‑1672105
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
