Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,836,192 |
T→A |
I67I (ATA→ATT) |
ynjH ← |
DUF1496 family protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,836,192 | 0 | T | A | 100.0%
| 721.4
/ NA
| 214 | I67I (ATA→ATT) | ynjH | DUF1496 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (108/106); total (108/106) |
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
CGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGCGGGTT > CP009273/1836045‑1836338
|
cgcTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAAGGTTTTGTAATCACACTAGCATTGCAGCAGAAt > 1:101436/1‑150 (MQ=255)
gtctggtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCtt < 1:1421429/150‑1 (MQ=255)
tctggtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTc < 2:2604481/150‑1 (MQ=255)
tggtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCgg < 1:414793/150‑1 (MQ=255)
tGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCtt < 2:119532/150‑1 (MQ=255)
gCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCttt < 1:420752/150‑1 (MQ=255)
gCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCttt < 2:2989646/150‑1 (MQ=255)
cTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTa < 2:1134533/150‑1 (MQ=255)
cTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTa > 1:3705092/1‑150 (MQ=255)
tCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCATAATTCCTTCGGCTTTaa > 1:2069369/1‑150 (MQ=255)
tCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTaa > 2:1362107/1‑150 (MQ=255)
tCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATAGCAATAAGAGCCCCCAGACCAACGGAATATATCTAAAAGTTTTTTCAACACGCTAACAATGCAACAAAATTACTACGGCTTTaa > 1:79596/1‑150 (MQ=255)
tGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTAcc > 2:1628896/1‑150 (MQ=255)
gAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCg > 2:1126391/1‑150 (MQ=255)
gAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCg > 2:493501/1‑150 (MQ=255)
aaGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGc > 1:774281/1‑150 (MQ=255)
aaGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTAACGc > 1:1327721/1‑150 (MQ=255)
gagGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCCGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTAACGccc > 1:1657010/1‑150 (MQ=255)
ggCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCt < 2:468571/150‑1 (MQ=255)
gcgcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCtt < 1:3247630/150‑1 (MQ=255)
gcgcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCtt < 1:2850888/150‑1 (MQ=255)
gcgcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCtt < 1:2419918/150‑1 (MQ=255)
gcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCa < 1:3754881/150‑1 (MQ=255)
cTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAg < 2:1603534/150‑1 (MQ=255)
gCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGaa < 2:1543632/150‑1 (MQ=255)
tatCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGaataat < 1:3544807/150‑1 (MQ=255)
tatCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGaataat > 2:1896812/1‑150 (MQ=255)
tatCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTAACGCCCCATCAGaataat > 1:2616635/1‑150 (MQ=255)
cGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTg < 1:2739075/150‑1 (MQ=255)
cTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGAt < 1:3103368/150‑1 (MQ=255)
gCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCt < 1:3474854/150‑1 (MQ=255)
gCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCt < 1:2044395/150‑1 (MQ=255)
gCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCACAAATCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCATCAGAAAAAATTTGATCCt > 1:1111372/1‑150 (MQ=255)
ccccTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTg > 2:3660910/1‑150 (MQ=255)
cccTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATTGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAATGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCATCAAAATAATTTTGATCCTGa > 1:706569/1‑150 (MQ=255)
ctgctgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATa < 1:2925777/150‑1 (MQ=255)
ctgctgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATa < 1:1227087/150‑1 (MQ=255)
tgctgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGAATAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATaa > 2:2930725/1‑150 (MQ=255)
gctgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATaaa < 1:2259074/150‑1 (MQ=255)
gctgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATaaa > 2:3491557/1‑150 (MQ=255)
gctgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATaaa < 1:599252/150‑1 (MQ=255)
tgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACg < 1:1830689/150‑1 (MQ=255)
cATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgcag > 2:3683718/1‑150 (MQ=255)
aTTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgcagc > 2:3303996/1‑150 (MQ=255)
ttCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgcagca < 2:639812/150‑1 (MQ=255)
attattAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGa > 2:2520209/1‑150 (MQ=255)
ttattaGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCAAGAACAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAg < 1:3392613/150‑1 (MQ=255)
attaGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGATAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCAATGCAGCAGAATTCCTTCGGCATTAATTACCGACCCATAACCAAAAATTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTa > 2:1926475/1‑150 (MQ=255)
taGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACa < 1:1176573/150‑1 (MQ=255)
agGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAggg > 2:2039138/1‑150 (MQ=255)
gCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCt < 2:3711780/150‑1 (MQ=255)
gCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCt > 1:911446/1‑150 (MQ=255)
cGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTg > 2:2959409/1‑150 (MQ=255)
gTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTgc > 2:1414877/1‑150 (MQ=255)
tATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCt > 2:871021/1‑150 (MQ=255)
tATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCt > 1:2380953/1‑150 (MQ=255)
aTGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTg < 2:429333/150‑1 (MQ=255)
tGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGa < 2:2281733/150‑1 (MQ=255)
tGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGa > 1:2161254/1‑150 (MQ=255)
ggCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCGTCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGAc < 2:493841/150‑1 (MQ=255)
tACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGccc > 1:164009/1‑150 (MQ=255)
gccgccAGACCAGCGGATTAGTGCTAATGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCctg < 2:776082/150‑1 (MQ=255)
cgccAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCctgaa > 1:488745/1‑150 (MQ=255)
cAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCctgaactg > 1:1540190/1‑150 (MQ=255)
cAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCctgaactg > 1:3437365/1‑150 (MQ=255)
gACCAGCGGATTAGTGCTATGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCctgaactgaa < 1:337282/150‑1 (MQ=255)
gACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCctgaactgaa > 2:1084104/1‑150 (MQ=255)
gACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCctgaactgaa < 1:2193592/150‑1 (MQ=255)
aCCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCtgaactgaac > 1:3493153/1‑150 (MQ=255)
aCCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCtgaactgaac > 1:1596412/1‑150 (MQ=255)
ccAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAaca > 2:3173527/1‑150 (MQ=255)
cAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTGCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGGATAAGGTTGATCCTGATCAAGGCAGCACTGAGTCCAGGGCTGCGCTGACGGCCCGCctgacctgcgccc > 2:2818178/1‑145 (MQ=255)
cGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTc > 2:3596162/1‑150 (MQ=255)
gATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTg > 1:3138080/1‑150 (MQ=255)
aTTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTgg > 2:1811305/1‑150 (MQ=255)
aTTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTgg > 2:3057334/1‑150 (MQ=255)
gTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGt > 2:2537524/1‑150 (MQ=255)
aaGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGtt > 1:1086447/1‑150 (MQ=255)
aGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGACCACTTCTGGCGGTACGttt > 2:2756906/1‑150 (MQ=255)
aGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGttt > 2:2791957/1‑150 (MQ=255)
gggTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTa < 2:2490725/150‑1 (MQ=255)
gTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTAcc > 1:3647056/1‑150 (MQ=255)
gTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTAcc < 2:3415496/150‑1 (MQ=255)
tttGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTc < 1:3780418/150‑1 (MQ=255)
tGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCa < 1:3283251/150‑1 (MQ=255)
catcaCGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGt < 1:1362107/150‑1 (MQ=255)
aCGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCgg > 2:1658676/1‑150 (MQ=255)
gCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGAc < 1:3037961/150‑1 (MQ=255)
gCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGAc > 1:1401776/1‑150 (MQ=255)
gCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGAc > 1:2821622/1‑150 (MQ=255)
tagCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGa > 2:402564/3‑150 (MQ=255)
tagCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGa > 2:1349374/3‑150 (MQ=255)
gCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGACCACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATa > 1:82839/1‑150 (MQ=255)
gCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATa < 1:3046813/150‑1 (MQ=255)
gCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATa > 1:447738/1‑150 (MQ=255)
aTTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAAt < 2:3349879/150‑1 (MQ=255)
ttGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATg < 2:2161254/150‑1 (MQ=255)
gcagcaGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGCg > 1:322358/1‑150 (MQ=255)
agcagAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGCggg > 2:2717214/1‑150 (MQ=255)
agcagAAGTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGCggg < 1:1357720/150‑1 (MQ=255)
|
CGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGCGGGTT > CP009273/1836045‑1836338
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGCGGGTTAGC > CP009273/1836044‑1836341
|
GCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAA > SRR19973061.1755814/1‑150 (MQ=60)
CGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAAGGTTTTGTAATCACACTAGCATTGCAGCAGAAT > SRR19973061.101771/1‑150 (MQ=60)
GCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATT < SRR19973061.1382903/150‑1 (MQ=60)
GTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTT < SRR19973061.1425011/150‑1 (MQ=60)
GTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTT < SRR19973061.1424760/150‑1 (MQ=60)
GTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTT < SRR19973061.3583893/150‑1 (MQ=60)
TGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGG < SRR19973061.415919/150‑1 (MQ=60)
GCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTT < SRR19973061.421952/150‑1 (MQ=60)
GCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTT < SRR19973061.421892/150‑1 (MQ=60)
GCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACAGTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTT < SRR19973061.421360/150‑1 (MQ=60)
CTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTA > SRR19973061.3714563/1‑150 (MQ=60)
TCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCATAATTCCTTCGGCTTTAA > SRR19973061.2074569/1‑150 (MQ=60)
TCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCACCGCCAGACCAACCGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAAATACTTCGGCATTAA > SRR19973061.79956/1‑150 (MQ=60)
CACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATTGCTTTACGCGCCGCCAGACCAACGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTAATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTACTTCGGCTTTAAT > SRR19973061.2242054/1‑150 (MQ=60)
TGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACC > SRR19973061.1912282/1‑150 (MQ=60)
TGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACC > SRR19973061.1912227/1‑150 (MQ=60)
AAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGC > SRR19973061.776319/1‑150 (MQ=60)
AAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTAACGC > SRR19973061.1331057/1‑150 (MQ=60)
GAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCCGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTAACGCCC > SRR19973061.1661171/1‑150 (MQ=60)
GAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTAACGCCC > SRR19973061.1661147/1‑150 (MQ=60)
GCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGATTTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTT < SRR19973061.3255343/150‑1 (MQ=60)
GCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTT < SRR19973061.311855/150‑1 (MQ=60)
GCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTT < SRR19973061.2426095/150‑1 (MQ=60)
GCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTT < SRR19973061.2858189/150‑1 (MQ=60)
GCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTT < SRR19973061.3255986/150‑1 (MQ=60)
GCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCA < SRR19973061.3764500/150‑1 (MQ=60)
GCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCA < SRR19973061.3764489/150‑1 (MQ=60)
CTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAG < SRR19973061.3763492/150‑1 (MQ=60)
GCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAA < SRR19973061.1186446/150‑1 (MQ=60)
CAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAAT < SRR19973061.701909/150‑1 (MQ=60)
ATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAA < SRR19973061.1079550/150‑1 (MQ=60)
TATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTTCATTATTAGAGGCGTTTATGGATTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAAT < SRR19973061.788386/150‑1 (MQ=60)
TATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAAT < SRR19973061.3553876/150‑1 (MQ=60)
TATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAAT < SRR19973061.3553883/150‑1 (MQ=60)
TATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTAACGCCCCATCAGAATAAT > SRR19973061.2623355/1‑150 (MQ=60)
CGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTG < SRR19973061.2746120/150‑1 (MQ=60)
CTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGAT < SRR19973061.3111364/150‑1 (MQ=60)
TGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATC > SRR19973061.1251975/1‑150 (MQ=60)
GCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCT < SRR19973061.877165/150‑1 (MQ=60)
GCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCT < SRR19973061.3483747/150‑1 (MQ=60)
GCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCT < SRR19973061.2049532/150‑1 (MQ=60)
GCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCT < SRR19973061.2049686/150‑1 (MQ=60)
GCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCACAAATCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCATCAGAAAAAATTTGATCCT > SRR19973061.1114216/1‑150 (MQ=60)
GCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAAAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCATCAGAATAATTTTGATCCT > SRR19973061.136978/1‑150 (MQ=60)
CCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTG < SRR19973061.2850707/150‑1 (MQ=60)
CCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATTGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAATGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCATCAAAATAATTTTGATCCTGA > SRR19973061.708409/1‑150 (MQ=60)
CCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATTGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTATTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCAATTCAGCAGAATTACTTCGGCTTTAATTAACGCCCCTTCAGAAAAATTTTTATACTGAT > SRR19973061.2887820/1‑150 (MQ=60)
CTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATA < SRR19973061.1230144/150‑1 (MQ=60)
CTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATA < SRR19973061.1360167/150‑1 (MQ=60)
CTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATA < SRR19973061.2933300/150‑1 (MQ=60)
GCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAA < SRR19973061.2264763/150‑1 (MQ=60)
GCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAA < SRR19973061.600810/150‑1 (MQ=60)
CTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAAC < SRR19973061.3403178/150‑1 (MQ=60)
CTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAAC < SRR19973061.308101/150‑1 (MQ=60)
TGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACG < SRR19973061.1835277/150‑1 (MQ=60)
GACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGC < SRR19973061.2185784/150‑1 (MQ=60)
GACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGC < SRR19973061.524206/150‑1 (MQ=60)
CATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAG < SRR19973061.400560/150‑1 (MQ=60)
TTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCA < SRR19973061.2523664/150‑1 (MQ=60)
TTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCAAGAACAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAG < SRR19973061.3401326/150‑1 (MQ=60)
TAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACA < SRR19973061.2762714/150‑1 (MQ=60)
TAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACA < SRR19973061.1179552/150‑1 (MQ=60)
GCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCT > SRR19973061.913784/1‑150 (MQ=60)
GTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGC > SRR19973061.976665/1‑150 (MQ=60)
GTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGC < SRR19973061.308553/150‑1 (MQ=60)
TTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGC > SRR19973061.2934465/1‑150 (MQ=60)
TATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCT > SRR19973061.2386946/1‑150 (MQ=60)
TATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCT > SRR19973061.2387016/1‑150 (MQ=60)
ATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTG < SRR19973061.2508108/150‑1 (MQ=60)
TGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGA > SRR19973061.213455/1‑150 (MQ=60)
TGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGA > SRR19973061.2166682/1‑150 (MQ=60)
TGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGA < SRR19973061.470310/150‑1 (MQ=60)
GCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACT < SRR19973061.3482230/150‑1 (MQ=60)
TTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCC > SRR19973061.2390404/1‑150 (MQ=60)
TTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCC > SRR19973061.3416675/1‑150 (MQ=60)
TACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCC > SRR19973061.164518/1‑150 (MQ=60)
CGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCT < SRR19973061.1169506/150‑1 (MQ=60)
CGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAA > SRR19973061.490049/1‑150 (MQ=60)
CAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTG > SRR19973061.3446178/1‑150 (MQ=60)
CAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTG > SRR19973061.1544025/1‑150 (MQ=60)
GACCAGCGGATTAGTGCTATGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAA < SRR19973061.338169/150‑1 (MQ=60)
GACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAA < SRR19973061.338640/150‑1 (MQ=60)
GACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAA < SRR19973061.2199105/150‑1 (MQ=60)
ACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAAC > SRR19973061.3502079/1‑150 (MQ=60)
ACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAAC > SRR19973061.152414/1‑150 (MQ=60)
ACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAAC < SRR19973061.1632967/150‑1 (MQ=60)
ACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAAC > SRR19973061.1600373/1‑150 (MQ=60)
CAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACAC > SRR19973061.1581894/1‑150 (MQ=60)
CAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACAC > SRR19973061.3484277/1‑150 (MQ=60)
AGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACT > SRR19973061.748273/1‑150 (MQ=60)
GATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTG > SRR19973061.3146156/1‑150 (MQ=60)
GTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGT < SRR19973061.2722739/150‑1 (MQ=60)
AAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTT > SRR19973061.1089294/1‑150 (MQ=60)
AAGGGTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTT > SRR19973061.1089230/1‑150 (MQ=60)
GTTTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACC > SRR19973061.3656373/1‑150 (MQ=60)
TTTGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTC < SRR19973061.3790062/150‑1 (MQ=60)
TGTCATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCA < SRR19973061.3291708/150‑1 (MQ=60)
CATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGT < SRR19973061.1800572/150‑1 (MQ=60)
CATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGT < SRR19973061.1365510/150‑1 (MQ=60)
CATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGT < SRR19973061.1365543/150‑1 (MQ=60)
ATCACGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTC > SRR19973061.3160003/1‑150 (MQ=60)
TCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCC < SRR19973061.3257204/150‑1 (MQ=60)
CGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGA < SRR19973061.3670846/150‑1 (MQ=60)
CGCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGA > SRR19973061.3054227/1‑150 (MQ=60)
GCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGAC > SRR19973061.1405318/1‑150 (MQ=60)
GCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGAC < SRR19973061.3045817/150‑1 (MQ=60)
GCTAGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGAC > SRR19973061.2828854/1‑150 (MQ=60)
GCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGACCACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATA > SRR19973061.83130/1‑150 (MQ=60)
GCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATA > SRR19973061.448950/1‑150 (MQ=60)
GCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATA < SRR19973061.3054687/150‑1 (MQ=60)
CATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAA > SRR19973061.3375057/1‑150 (MQ=60)
ATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAAT > SRR19973061.3782038/1‑150 (MQ=60)
GCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGCG > SRR19973061.323198/1‑150 (MQ=60)
AGCAGAAGTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGCGGG < SRR19973061.1361143/150‑1 (MQ=60)
GCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGCGGGT < SRR19973061.768649/150‑1 (MQ=60)
AATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGCGGGTTAGC > SRR19973061.1399591/1‑150 (MQ=60)
AATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGCGGGTTAGC < SRR19973061.822366/150‑1 (MQ=60)
|
GCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAACACTTCTGGCGGTACGTTTACCTCCACGTCCGGACGATAATGCGGGTTAGC > CP009273/1836044‑1836341
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |