Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,988,934 |
G→T |
pseudogene (186/447 nt) |
ygeN ← |
pseudogene |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,988,934 | 0 | G | T | 100.0%
| 754.7
/ NA
| 223 | pseudogene (186/447 nt) | ygeN | pseudogene |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (111/112); total (111/112) |
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
AGGGGAGAAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATAAAAACATCAACTTCTTCTGAAGGTTTTAACAA > CP009273/2988787‑2989080
|
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agaAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAat < 1:17745/150‑1 (MQ=255)
gaAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAata > 2:562844/1‑150 (MQ=255)
aaCAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATg > 2:1790159/1‑150 (MQ=255)
aCAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACATAATATGa < 1:3256090/150‑1 (MQ=255)
cAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGAc < 1:1597046/150‑1 (MQ=255)
cAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGAc > 2:2339831/1‑150 (MQ=255)
cAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGAc < 2:2602142/150‑1 (MQ=255)
tGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGActct > 1:1451446/1‑150 (MQ=255)
gATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTa < 1:2767109/150‑1 (MQ=255)
gATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTa > 2:2695422/1‑150 (MQ=255)
ttattaATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACt > 2:1807209/1‑150 (MQ=255)
taattaaATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCaa > 1:1900263/1‑150 (MQ=255)
aattaaATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAag > 2:2473514/1‑150 (MQ=255)
aattaaATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAag > 1:1947332/1‑150 (MQ=255)
attaaATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAaga > 2:1448938/1‑150 (MQ=255)
aaaTATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGAc < 2:3545389/150‑1 (MQ=255)
atatTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACtt < 2:876516/150‑1 (MQ=255)
tatTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTa < 1:1020221/150‑1 (MQ=255)
ttGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATc < 1:1548029/150‑1 (MQ=255)
ttGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATc > 2:1182466/1‑150 (MQ=255)
cTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCttt > 1:405317/1‑150 (MQ=255)
tCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTg > 2:2848699/1‑150 (MQ=255)
aaTTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAAc < 2:1708778/150‑1 (MQ=255)
aaTTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAAc > 1:2021532/1‑150 (MQ=255)
ttATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTg < 1:3689293/150‑1 (MQ=255)
tCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTggta < 1:947489/150‑1 (MQ=255)
cacaAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTggtagg < 1:3115106/150‑1 (MQ=255)
cacaAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTggtagg > 1:1742458/1‑150 (MQ=255)
cacaAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACACTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTggtagg > 2:3794025/1‑150 (MQ=255)
acaAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTggtaggt > 1:3388928/1‑150 (MQ=255)
caAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTggtaggta > 2:2951313/1‑150 (MQ=255)
caAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTggtaggta < 1:3410578/150‑1 (MQ=255)
aaTTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGtata < 1:2827792/150‑1 (MQ=255)
aaTTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGtata < 2:843592/150‑1 (MQ=255)
aaTTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGtata < 2:1255946/150‑1 (MQ=255)
aaTTACTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGtata > 1:3117951/1‑150 (MQ=255)
ttCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATg < 2:808617/150‑1 (MQ=255)
ttCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATg > 2:1952210/1‑150 (MQ=255)
cTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGgag < 1:3143521/150‑1 (MQ=255)
cTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGgag > 2:1626933/1‑150 (MQ=255)
tGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACAGTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGgaga < 1:2519009/150‑1 (MQ=255)
cGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGAtt < 1:1671307/150‑1 (MQ=255)
cTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACa < 1:2321760/150‑1 (MQ=255)
tAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAg < 2:1635141/150‑1 (MQ=255)
tAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAg > 2:765046/1‑150 (MQ=255)
aaaTTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAgg < 2:636620/150‑1 (MQ=255)
aaaTTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTAGATGGAGATTTACAgg > 2:1000219/1‑150 (MQ=255)
aaTTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGTTATATGGAGATTTACAGGa < 1:283969/150‑1 (MQ=255)
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cAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGata < 2:2444621/150‑1 (MQ=255)
aaTAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAGCTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGatat > 2:2930865/1‑150 (MQ=255)
aTAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATAtt > 2:1655969/1‑150 (MQ=255)
aaaTTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGa > 1:2083485/1‑150 (MQ=255)
aaTTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGAt > 1:1133119/1‑150 (MQ=255)
aaTTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGAt < 1:3750088/150‑1 (MQ=255)
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tGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGt < 1:1700032/150‑1 (MQ=255)
tGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGt > 1:1927676/1‑150 (MQ=255)
gATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTa > 1:2177609/1‑150 (MQ=255)
gATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTa < 1:2890222/150‑1 (MQ=255)
gATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTa < 1:129575/150‑1 (MQ=255)
cGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAAtt < 2:1858624/150‑1 (MQ=255)
ggTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAAttt < 1:2848699/150‑1 (MQ=255)
gTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAAtttt > 1:489565/1‑150 (MQ=255)
tAAAAAACACAAACCGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTg < 2:3448179/150‑1 (MQ=255)
aaaaaaCACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGt > 1:3240527/1‑150 (MQ=255)
caAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAAc > 2:2023943/1‑150 (MQ=255)
aaCGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACttt < 2:3700397/150‑1 (MQ=255)
aCGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTc < 1:2473514/150‑1 (MQ=255)
cGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCa > 1:735248/1‑150 (MQ=255)
cTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCaaa > 2:138741/1‑150 (MQ=255)
cTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCaaa > 2:2148236/1‑150 (MQ=255)
ttATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCaaaa > 1:2730759/1‑150 (MQ=255)
atcatcATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAAt > 2:526489/1‑150 (MQ=255)
atcatcATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAAt < 2:2800554/150‑1 (MQ=255)
gAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATaa < 2:1167279/150‑1 (MQ=255)
gAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATaa < 1:577861/150‑1 (MQ=255)
aaaTGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATaaa < 1:1807209/150‑1 (MQ=255)
aTGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATaaaaa > 2:2186820/1‑150 (MQ=255)
aTGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATaaaaa < 2:3002349/150‑1 (MQ=255)
tAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATAAAAACAt > 2:3075568/1‑150 (MQ=255)
aaTATGGACATTCCATATTGATTTGTCTACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATAAAAACATc > 1:3060215/1‑150 (MQ=255)
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AGGGGAGAAACAATGATTATTAATTAAATATTGCTCACAATTATCCACAAATTCCTGCGGACTAAATTCAGCAATAAATTGATCGGTAAAAAACACAAAACGCTTATCATCATGAAATGTAATATGGACATTCCATATTGATTTGTCGACAAAATATGACTCTACTTCAAGAGACTTATCTTTGAAACTGGTAGGTATATGGAGATTTACAGGACCTGATATTGATGGTAATTTTGTTACCCAACTTTCAAAAATTTTGATAAAAACATCAACTTCTTCTGAAGGTTTTAACAA > CP009273/2988787‑2989080
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |