Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,865,000 |
C→A |
100% |
P120Q (CCA→CAA) |
yeaI → |
putative membrane‑anchored diguanylate cyclase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,865,000 | 0 | C | A | 99.3%
| 759.2
/ ‑4.3
| 229 | P120Q (CCA→CAA) | yeaI | putative membrane‑anchored diguanylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base A (110/116); total (113/116) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.40e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
GCATTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCA > CP009273/1864853‑1865146
|
gCATTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACaaa > 1:2334447/1‑150 (MQ=255)
gCATTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTAACTAAAAAACAAATTTTACaaa > 2:1884016/1‑150 (MQ=255)
actacCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTc > 2:3902315/1‑150 (MQ=255)
ctacCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCa < 1:4686621/150‑1 (MQ=255)
ctacCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCa < 1:3481637/150‑1 (MQ=255)
tacCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCAt < 2:2063033/150‑1 (MQ=255)
ccTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCAttt < 1:4652934/150‑1 (MQ=255)
ccTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCAttt < 2:4931048/150‑1 (MQ=255)
cTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCAtttt > 2:1868023/1‑150 (MQ=255)
cTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCAtttt > 2:4438356/1‑150 (MQ=255)
cTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCAtttt > 2:2537767/1‑150 (MQ=255)
atataACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAg < 2:1417037/150‑1 (MQ=255)
ataACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGcc > 2:157780/1‑150 (MQ=255)
taACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCt < 1:727990/150‑1 (MQ=255)
aaCGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTTATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCtt > 1:2842663/1‑150 (MQ=255)
aaCGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCtt > 2:2308161/1‑150 (MQ=255)
cGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGc > 2:4323957/1‑150 (MQ=255)
cGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGc > 2:804793/1‑150 (MQ=255)
cGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGc < 2:5107815/150‑1 (MQ=255)
agAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTACTGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGc < 1:2625888/149‑1 (MQ=255)
gAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCa > 2:1808073/1‑150 (MQ=255)
aaaaCACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCAt > 2:1290252/1‑150 (MQ=255)
aaCACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCAttt < 2:616656/150‑1 (MQ=255)
aaCACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCAttt < 2:2681251/150‑1 (MQ=255)
acaAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTa < 2:455981/150‑1 (MQ=255)
caAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTaa > 1:3595303/1‑150 (MQ=255)
aTGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTg > 2:2392050/1‑150 (MQ=255)
tGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTgg > 2:3577063/1‑150 (MQ=255)
aaaaCTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCt < 2:1496642/150‑1 (MQ=255)
aaaaCTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCt > 2:452878/1‑150 (MQ=255)
aaaCTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCtt > 2:814797/1‑150 (MQ=255)
aaCTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTa > 1:2938002/1‑150 (MQ=255)
aaCTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTa > 1:1448640/1‑150 (MQ=255)
cTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATc > 1:386662/1‑150 (MQ=255)
cATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTa > 1:1093217/1‑150 (MQ=255)
cATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTa < 2:2471769/150‑1 (MQ=255)
cATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTa > 1:4296917/1‑150 (MQ=255)
aTCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTAt > 1:1952934/1‑150 (MQ=255)
cccACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTAttt < 1:289368/150‑1 (MQ=255)
aGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTg > 2:4756825/1‑150 (MQ=255)
aGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTg > 1:1248688/1‑150 (MQ=255)
gAATTACCTTATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAAc > 2:4118920/1‑150 (MQ=255)
gAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAAc < 2:642858/150‑1 (MQ=255)
gAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTAAAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAATTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAAc > 1:2202099/1‑150 (MQ=255)
aTTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCa < 2:600076/150‑1 (MQ=255)
ttACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTTAAACCAt > 2:3093509/1‑150 (MQ=255)
ttACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCAt > 2:4057369/1‑150 (MQ=255)
tACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCAtt < 1:1299029/150‑1 (MQ=255)
tGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTaa > 1:1009581/1‑150 (MQ=255)
ttgttgTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATcc < 2:4051011/150‑1 (MQ=255)
tgttgtGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCa > 1:2379645/1‑150 (MQ=255)
gttgtGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCAt < 2:3312994/150‑1 (MQ=255)
tgtgGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATaa > 1:3069636/1‑150 (MQ=255)
tgtgGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATaa > 1:3272796/1‑150 (MQ=255)
tgtgGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATaa > 2:3176889/1‑150 (MQ=255)
gtgGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATaaa > 1:364455/1‑150 (MQ=255)
tCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCa < 2:2752075/150‑1 (MQ=255)
ccTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAg < 1:4492029/150‑1 (MQ=255)
cTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGt < 2:3792493/150‑1 (MQ=255)
ttAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTa > 1:414654/1‑150 (MQ=255)
aaCGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTaca > 1:956196/1‑150 (MQ=255)
aaCGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTaca < 2:2825092/150‑1 (MQ=255)
aCGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTacac > 2:3534901/1‑150 (MQ=255)
gCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTg > 2:2051386/1‑150 (MQ=255)
ccGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGa > 1:3436706/1‑150 (MQ=255)
ccGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTAAAAACACTATTTTTATGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGa < 1:2129313/150‑1 (MQ=255)
tCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATcc > 1:529914/1‑150 (MQ=255)
tCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATcc > 1:4989265/1‑150 (MQ=255)
aTTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAg > 1:3725918/1‑150 (MQ=255)
ttttcttttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGAc < 1:4968789/150‑1 (MQ=255)
ttttcttttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGAc < 1:3545227/150‑1 (MQ=255)
ttttcttttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGAc > 1:2713831/1‑150 (MQ=255)
tttcttttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACa > 1:850492/1‑150 (MQ=255)
ttttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGt < 2:500664/150‑1 (MQ=255)
tttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTc < 1:2256352/150‑1 (MQ=255)
tttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTc < 2:707570/150‑1 (MQ=255)
aTGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAat < 1:4369637/150‑1 (MQ=255)
ttAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAatgat < 2:1206459/150‑1 (MQ=255)
aTGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACAAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtt > 1:1721420/1‑150 (MQ=255)
ttaaaTATTTAAATAACAAAAAAATTTTAAAAACACTAATTTTAAGCCTTTCATTTTTAAGTGTCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTTTAATTATCAATAAACCAATTAACGGCAGTAAACTGATACAGACAAAGTCGAATGATGttt < 1:4541261/148‑1 (MQ=255)
atatTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttctat > 1:2958641/1‑150 (MQ=255)
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CCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTAAAAACACTATTTTTATGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGA < SRR19973063.2135964/150‑1 (MQ=60)
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TCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCC > SRR19973063.531470/1‑150 (MQ=60)
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GCATTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCA > CP009273/1864853‑1865146
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
