Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,865,000 |
C→A |
100% |
P120Q (CCA→CAA) |
yeaI → |
putative membrane‑anchored diguanylate cyclase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,865,000 | 0 | C | A | 100.0%
| 674.7
/ NA
| 206 | P120Q (CCA→CAA) | yeaI | putative membrane‑anchored diguanylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (98/108); total (98/108) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
ATTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACT > CP009273/1864855‑1865144
|
aTTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACaaa < 1:586192/148‑1 (MQ=255)
tactacCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAaca > 1:831426/1‑148 (MQ=255)
ctacCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACt < 2:779454/148‑1 (MQ=255)
acCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCa < 2:346854/148‑1 (MQ=255)
tatataACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCAtttt > 1:1445022/1‑148 (MQ=255)
tatataACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCAtttt < 1:3364608/148‑1 (MQ=255)
atataACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTa > 2:3188822/1‑148 (MQ=255)
atataACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAAATTTTCAAACACTCAttttt > 1:1559007/1‑147 (MQ=255)
ataACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAg > 2:531951/1‑148 (MQ=255)
ataACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAg > 2:3302513/1‑148 (MQ=255)
ataACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTAAAAACACTCATTTTAAg > 1:265585/1‑148 (MQ=255)
taACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGc < 2:1291397/148‑1 (MQ=255)
aaCGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGcc > 2:3434984/1‑148 (MQ=255)
aaaaCACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGc > 2:3215766/1‑148 (MQ=255)
aaaCACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCa > 1:492492/1‑148 (MQ=255)
cacaAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCAttt > 2:917110/1‑148 (MQ=255)
acaAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCAtttt > 1:77782/1‑148 (MQ=255)
aTGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGTAATATTTGACTAACAAACAAATTTTACAAAAACTCATTTTAAGCCTTGGATTTTTAAg > 1:1594756/1‑148 (MQ=255)
aTGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAg > 1:802526/1‑148 (MQ=255)
aTGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAg < 2:1184279/148‑1 (MQ=255)
tGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTAACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTaatt > 1:700675/1‑146 (MQ=255)
tAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTgg < 1:1489817/148‑1 (MQ=255)
aaaCTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGcc < 1:1718608/148‑1 (MQ=255)
aaCTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCt > 2:2604877/1‑148 (MQ=255)
aCTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCtt < 1:206197/148‑1 (MQ=255)
cTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTa > 2:1223964/1‑148 (MQ=255)
cTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTa > 1:1187910/1‑148 (MQ=255)
cATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTATTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACAATCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTAta > 2:2271257/1‑147 (MQ=255)
aTCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCt < 1:208151/148‑1 (MQ=255)
tCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTa > 2:291581/1‑148 (MQ=255)
tCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTa < 2:1120381/148‑1 (MQ=255)
cacaGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTAttt < 1:12230/148‑1 (MQ=255)
acaGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTa < 2:1262273/148‑1 (MQ=255)
caGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAg < 1:343774/148‑1 (MQ=255)
aGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGt > 1:2034776/1‑148 (MQ=255)
aTGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAAAGCCGTCATTTTTCTTTTAATTTTAAAGAAATATTTGACTAAAAAAAAAATTTTACAAAAAATCATTTTAATCCTTTCATTTTTAAGTGGCCTTATATatttatttt > 1:2721313/1‑147 (MQ=255)
gAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGaa < 1:1877514/148‑1 (MQ=255)
ttACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTAATTTTAATTAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAAcc > 1:1068481/1‑148 (MQ=255)
aCCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCAt < 2:86836/148‑1 (MQ=255)
aCCTGATGGTTGTTGTGGCTGTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCAt < 2:1863387/148‑1 (MQ=255)
cTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTg < 2:2800296/148‑1 (MQ=255)
tGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAAACATTGt > 2:2470476/1‑148 (MQ=255)
ggTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAAtt < 1:3295129/148‑1 (MQ=255)
gttgttGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTa < 1:3052265/148‑1 (MQ=255)
gttgttGTGGCTTTGTATTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTa < 1:1831268/148‑1 (MQ=255)
tgttgtGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATc < 1:698543/148‑1 (MQ=255)
tgtgGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCAt < 2:1871667/148‑1 (MQ=255)
tgGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATaa > 2:45496/1‑148 (MQ=255)
ggCTTTGTTTTTCATTAACGACGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATaaa < 2:2981886/148‑1 (MQ=255)
gCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAAc < 1:624084/148‑1 (MQ=255)
cTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAAcc > 2:1616135/1‑148 (MQ=255)
ttGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCaa < 2:1708557/148‑1 (MQ=255)
tttCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAAc < 1:3118383/148‑1 (MQ=255)
tttCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAAc > 2:2738701/1‑148 (MQ=255)
ccTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGc < 2:3239599/148‑1 (MQ=255)
aaCGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTa > 2:3472276/1‑148 (MQ=255)
cGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGTCCTTATCTATTTAGTTGAATCAATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTaca > 2:1805623/1‑148 (MQ=255)
cGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTg < 2:3388095/148‑1 (MQ=255)
cGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTg < 1:288154/148‑1 (MQ=255)
tCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGAt > 1:404516/1‑148 (MQ=255)
cATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATc > 1:3144184/1‑148 (MQ=255)
cATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATc > 1:1265951/1‑148 (MQ=255)
cATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATc > 2:1745139/1‑148 (MQ=255)
ttttcttttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAg < 1:3515613/148‑1 (MQ=255)
ttttcttttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAg > 1:2611519/1‑148 (MQ=255)
ttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGt > 1:2467639/1‑148 (MQ=255)
ttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGt < 1:3413730/148‑1 (MQ=255)
tcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTc > 1:2781233/1‑148 (MQ=255)
tcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTc > 1:420880/1‑148 (MQ=255)
aTGTTAATTAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGa < 1:3093207/148‑1 (MQ=255)
aTGTTAATGAAATATTTCACTAACAAAAAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGa < 1:1345738/148‑1 (MQ=255)
tAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAatga > 2:1890371/1‑148 (MQ=255)
tAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAatga > 2:204334/1‑148 (MQ=255)
aTGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAatgatg > 2:3352763/1‑148 (MQ=255)
gAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtt > 2:1296121/1‑148 (MQ=255)
gAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtt > 1:536668/1‑148 (MQ=255)
aaaTATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGttt < 2:2123699/148‑1 (MQ=255)
aaTATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttc < 1:570357/148‑1 (MQ=255)
atatTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttct < 1:1023074/148‑1 (MQ=255)
atTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttctat < 1:2650475/148‑1 (MQ=255)
atTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttctat > 2:862403/1‑148 (MQ=255)
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aCTAACAAACAAATTTTACAAACACTAATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGtttctattttct < 2:3102760/148‑1 (MQ=255)
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|
TTGCATTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTT > CP009273/1864851‑1865149
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
