Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F247 I0 R1
|
1496 |
299.8 |
9582018 |
97.8% |
9371213 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,865,000 |
C→A |
88.8% |
P120Q (CCA→CAA) |
yeaI → |
putative membrane‑anchored diguanylate cyclase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,865,000 | 0 | C | A | 88.8%
| 681.9
/ 73.3
| 268 | P120Q (CCA→CAA) | yeaI | putative membrane‑anchored diguanylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (16/15); new base A (121/116); total (137/131) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
TTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGT > CP009273/1864856‑1865148
|
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tacCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAAAACTCa > 1:915889/1‑149 (MQ=255)
tacCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTACTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTAACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCa > 1:176938/1‑149 (MQ=255)
acCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCAt < 1:3831744/149‑1 (MQ=255)
ccTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCAtt < 1:3703502/149‑1 (MQ=255)
ttATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCAtttt > 1:1081954/1‑149 (MQ=255)
ttATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACAATCAtttt > 2:2086737/1‑149 (MQ=255)
atataACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTaa < 1:1880996/149‑1 (MQ=255)
atataACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTaa < 2:2482935/149‑1 (MQ=255)
atataACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTaa > 1:2385146/1‑149 (MQ=255)
taACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAAAACTCATTTTAAGcc > 2:865312/1‑149 (MQ=255)
taACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTATACCAACACTCAGTTTAAGcc > 2:2997377/1‑149 (MQ=255)
aCGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCtt > 2:4719306/1‑149 (MQ=255)
aCGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGACtt > 2:3269618/1‑149 (MQ=255)
gAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGc < 1:3725132/149‑1 (MQ=255)
aaaCACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCAt > 2:138853/1‑149 (MQ=255)
aaaCACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCAGTTTAAGCCTTGCAt > 2:3600002/1‑149 (MQ=255)
aaCACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCAtt < 1:1173007/149‑1 (MQ=255)
aaCACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCAtt > 2:2149379/1‑149 (MQ=255)
acacAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCAttt > 1:2223411/1‑149 (MQ=255)
cacaAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCAtttt < 2:3364411/149‑1 (MQ=255)
acaAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCAttttt < 1:1019827/149‑1 (MQ=255)
acaAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCAttttt > 2:3160786/1‑149 (MQ=255)
aaTGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAg < 1:3005441/149‑1 (MQ=255)
aaTGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTAACTAACAAACAAATTTTAAAAAAACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAg > 1:4123399/1‑149 (MQ=255)
gTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTgg > 1:3991940/1‑149 (MQ=255)
gTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTgg > 2:870557/1‑149 (MQ=255)
gTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTgg > 1:1977026/1‑149 (MQ=255)
aaaaCTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGcc > 1:1827250/1‑149 (MQ=255)
aaaaCTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAAAAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAATCCTTGCATTTTTaatttgga > 2:3853358/1‑143 (MQ=255)
aaaCTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCt < 2:1708858/149‑1 (MQ=255)
aaaCTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAAAACTCATTTTAAGCCTTGTATTTTTAAGTGGCCt > 1:2023274/1‑149 (MQ=255)
aaCTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCtt < 1:1354683/149‑1 (MQ=255)
cTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTAt < 2:1366080/149‑1 (MQ=255)
cTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTAt < 2:4323896/149‑1 (MQ=255)
tCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTTCATTTTTAAGTGGCCTTATc > 2:2895264/1‑149 (MQ=255)
tCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTATTTTCATGTTAATGAAATATTTAACGAACAAACAAATTTTAAAAAAACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAATTGGCCTTATc > 1:4476/1‑149 (MQ=255)
tCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAAAACTCATTTTAATCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTAt > 1:3356174/1‑149 (MQ=255)
acaGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAg > 2:4183820/1‑149 (MQ=255)
acaGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAg < 1:4505686/149‑1 (MQ=255)
caGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGt < 1:2685269/149‑1 (MQ=255)
aGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGtt > 1:4733725/1‑149 (MQ=255)
gATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTg < 2:40152/149‑1 (MQ=255)
tACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAAAAAACAAATTTTAAAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAATTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCAt > 2:809553/1‑149 (MQ=255)
aCCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCAtt < 1:1426300/149‑1 (MQ=255)
gATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTaa > 2:1892751/1‑149 (MQ=255)
gATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTaa > 1:3833218/1‑149 (MQ=255)
tGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAAtt < 1:4144087/149‑1 (MQ=255)
ggTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTACTTGAAACCATTGTAATTa > 2:4502085/1‑149 (MQ=255)
gttgttGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTAt < 2:765095/149‑1 (MQ=255)
ttgttgTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATTAAATATTTAACTAACAATCAAATTTTACAAAAACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTATTTGAAACCAATGTAATTAta > 2:4057379/1‑148 (MQ=255)
tgtgGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTAACTAACAAACAAATTTTACAAAAAAAAATTTTAATCCTTGCATTTTTAATTGGCCTTATATATTTAGTTGAAACCAATGTAATTATACATa > 1:830361/1‑149 (MQ=255)
gtgGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTTAGTGGGCTTATATATTTATTTGAAACCATTTTAATTATCCATaa > 1:564871/1‑149 (MQ=255)
gtgGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATaa > 1:3066014/1‑149 (MQ=255)
gtgGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATaa < 2:512553/149‑1 (MQ=255)
tgGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATaaa > 2:4754446/1‑149 (MQ=255)
ggCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAAc > 2:3856312/1‑149 (MQ=255)
gCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAAcc > 1:2121694/1‑149 (MQ=255)
ttGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAAt < 2:4685871/149‑1 (MQ=255)
tttttGCTTAAAGATGTAATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTAAATAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGACTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTaa < 1:3016028/149‑1 (MQ=255)
tttttCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCAGAAACCAATTaa > 2:3390994/1‑149 (MQ=255)
tttttCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTaa > 2:3424098/1‑149 (MQ=255)
tttttCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTaa > 2:2535146/1‑149 (MQ=255)
tttttCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTaa > 1:1714574/1‑149 (MQ=255)
ttAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATTTTAATGAAATATTTCACTAACAAAAAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGt < 1:3249547/149‑1 (MQ=255)
ttAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGt < 2:1266291/149‑1 (MQ=255)
aCGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTaca > 2:170247/1‑149 (MQ=255)
cGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTacac < 1:2321323/149‑1 (MQ=255)
ccGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTg < 2:11210/149‑1 (MQ=255)
gTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGAt < 2:4648880/149‑1 (MQ=255)
aaTTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATcc < 1:3538749/148‑1 (MQ=255)
tttttCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAg < 2:1873206/149‑1 (MQ=255)
ttttcttttcATTTTAATTAAATATTTCACTAAAAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCATTATCTATTTAGTTTAAACCATTGTAATTATCAATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGa < 1:2086737/149‑1 (MQ=255)
ttttcATTTTAATTAATTATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCTTTTTAAGCCTTGAATTTTTAAGTGGCCTTATCTTTTTTTTTGAAACAATTGTAATTATCCATAAACCATTTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAg < 1:434925/149‑1 (MQ=255)
ttttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAg < 2:655449/149‑1 (MQ=255)
tttcATGTTAATTAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGt < 2:3607510/149‑1 (MQ=255)
tttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTTAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGt < 1:50999/149‑1 (MQ=255)
tttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGt < 1:3332191/149‑1 (MQ=255)
tttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGt < 1:220857/149‑1 (MQ=255)
tttcATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGt < 1:640035/149‑1 (MQ=255)
tGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAat > 2:2802419/1‑149 (MQ=255)
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TTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTC < SRR19973071.3464513/150‑1 (MQ=60)
TTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTC > SRR19973071.3880429/1‑150 (MQ=60)
TTACAAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTC > SRR19973071.3880823/1‑150 (MQ=60)
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ACAAACACTCATTTTGAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAG > SRR19973071.4170516/1‑150 (MQ=60)
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AAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTT > SRR19973071.3212590/1‑150 (MQ=60)
AAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTT > SRR19973071.3212760/1‑150 (MQ=60)
AAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTAATTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTT > SRR19973071.3202959/1‑150 (MQ=60)
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TTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGTT > CP009273/1864856‑1865149
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
