Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F204 I0 R1
|
1155 |
255.8 |
8356456 |
95.7% |
7997128 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,646,993 |
C→T |
46.8% |
intergenic (+28/+19) |
intQ → / ← ydfJ |
pseudogene, Qin prophage; phage integrase family;Phage or Prophage Related/pseudogene, MFS transporter family; interrupted by Qin prophage;Phage or Prophage Related; putative transport protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,646,993 | 0 | C | T | 46.8%
| 76.5
/ inf
| 233 | intergenic (+28/+19) | intQ/ydfJ | pseudogene, Qin prophage; phage integrase family;Phage or Prophage Related/pseudogene, MFS transporter family; interrupted by Qin prophage;Phage or Prophage Related; putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (62/62); new base T (71/38); total (133/100) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.42e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 |
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
GGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGTACTACTTACTC > CP009273/1646845‑1647139
|
ggTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCa < 1:2743990/150‑1 (MQ=255)
gTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATACTGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCAt < 2:1578839/150‑1 (MQ=255)
tATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATg > 1:3329499/1‑150 (MQ=255)
tATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATg < 1:457119/150‑1 (MQ=255)
tATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATg < 1:2470557/150‑1 (MQ=255)
aTTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGa < 2:3344287/150‑1 (MQ=255)
tataCGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGaa > 2:3231474/1‑150 (MQ=255)
taCGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAAt < 1:1226175/150‑1 (MQ=255)
ggAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCa > 2:943479/1‑150 (MQ=255)
gAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCAt > 1:28574/1‑150 (MQ=255)
aaaaTGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATa < 1:1677193/150‑1 (MQ=255)
aTGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAAt > 2:3122603/1‑150 (MQ=255)
aTGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAAt > 1:1760995/1‑150 (MQ=255)
tGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAAtt < 2:1263972/150‑1 (MQ=255)
tGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAAtt < 1:806936/150‑1 (MQ=255)
ggATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATATTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCCAAAATTc > 1:214125/1‑150 (MQ=255)
gTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAgc < 1:3705447/150‑1 (MQ=255)
tCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAgcg < 1:33600/150‑1 (MQ=255)
aaaCAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTg > 1:1069954/1‑150 (MQ=255)
aataatGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCa > 2:568717/1‑150 (MQ=255)
aataatGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCa < 1:2935794/150‑1 (MQ=255)
ataatGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAg > 2:1357788/1‑150 (MQ=255)
aatGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGcc < 2:3512453/150‑1 (MQ=255)
tGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCAt < 2:1948570/150‑1 (MQ=255)
gCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATc < 2:1116029/150‑1 (MQ=255)
gCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATc < 1:903160/150‑1 (MQ=255)
caGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCg < 1:1973411/150‑1 (MQ=255)
caGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCg < 1:3181931/150‑1 (MQ=255)
gTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATa > 2:2949045/1‑150 (MQ=255)
gTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATa > 1:1501542/1‑150 (MQ=255)
tAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATAc > 1:663066/1‑150 (MQ=255)
aGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATAct < 1:218392/150‑1 (MQ=255)
aGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATAct > 1:3873378/1‑150 (MQ=255)
ttGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATActgctg < 2:278301/150‑1 (MQ=255)
gTTAAATACAAAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAATCAATGAAAAATTAATTTAATAAATATCAAATAGTTAACACGCATGACTATTTAAATCCAAAAATTCAAGCCCAGAGCCCAGCCATCCCGATACTgctgct > 2:1834168/1‑150 (MQ=255)
ttAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCtt > 2:2622261/1‑150 (MQ=255)
tAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATACAAGCGCAGTGCCCCGCCATCCCGATACTGCTGCttt > 2:342609/1‑150 (MQ=255)
tAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCttt < 2:1641680/150‑1 (MQ=255)
aaaTACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTc > 1:413118/1‑150 (MQ=255)
aaTACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCa > 2:3384456/1‑150 (MQ=255)
aaTACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCa < 1:3247457/150‑1 (MQ=255)
gTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATcc < 1:2798960/150‑1 (MQ=255)
gTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATcc < 1:1806259/150‑1 (MQ=255)
ttAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCt < 2:2939340/150‑1 (MQ=255)
aaGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTa > 2:1784215/1‑150 (MQ=255)
aaGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTa > 2:3189196/1‑150 (MQ=255)
aaGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTa > 2:974850/1‑150 (MQ=255)
tttGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGcttc > 1:600530/1‑150 (MQ=255)
ttGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGcttct < 1:1035002/150‑1 (MQ=255)
gCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCttt > 1:2631878/1‑150 (MQ=255)
cccAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCg < 2:3802595/150‑1 (MQ=255)
cAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCgtg > 2:3152880/1‑150 (MQ=255)
aCCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGtt > 1:3598433/1‑150 (MQ=255)
aCCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGtt > 2:1735729/1‑150 (MQ=255)
cccATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTAt < 2:2162111/150‑1 (MQ=255)
ccATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTAtt > 1:2536725/1‑150 (MQ=255)
cATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTg > 1:1618482/1‑150 (MQ=255)
aTAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGt < 2:1801229/150‑1 (MQ=255)
tAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTc > 1:2471103/1‑150 (MQ=255)
tAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTc < 1:1932459/150‑1 (MQ=255)
aaCGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCa > 1:2166392/1‑150 (MQ=255)
aCGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCAt < 1:3401843/150‑1 (MQ=255)
cGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAACTCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATa > 2:1672476/1‑150 (MQ=255)
cGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATa > 2:1672544/1‑150 (MQ=255)
cGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATa < 2:3645185/150‑1 (MQ=255)
gAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATaa > 1:2023682/1‑150 (MQ=255)
gAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATaa < 2:1395694/150‑1 (MQ=255)
gAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGAGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATaa > 1:2828298/1‑150 (MQ=255)
aaGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAAt > 2:1634981/1‑150 (MQ=255)
aGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATg < 2:654823/150‑1 (MQ=255)
cAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGt < 2:680072/150‑1 (MQ=255)
aaTGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGtt > 2:1114235/1‑150 (MQ=255)
tGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTAt > 1:3641870/1‑150 (MQ=255)
tGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTAt > 2:460425/1‑150 (MQ=255)
tGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTAt > 1:3842176/1‑150 (MQ=255)
gAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTAtc > 1:960886/1‑150 (MQ=255)
gAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTAtc > 2:1434206/1‑150 (MQ=255)
aaaaaTTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTAtct < 1:69038/150‑1 (MQ=255)
aaaaaTTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTAtct > 2:1810978/1‑150 (MQ=255)
aaaaTTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTAtctc > 1:3658180/1‑150 (MQ=255)
aaaTTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATctct > 2:874436/1‑150 (MQ=255)
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aattaattTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTa < 1:3687137/150‑1 (MQ=255)
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TTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTC > SRR19973074.601678/1‑150 (MQ=60)
TTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCT < SRR19973074.1036908/150‑1 (MQ=60)
TTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCT < SRR19973074.1059436/150‑1 (MQ=60)
TGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTT > SRR19973074.222195/1‑150 (MQ=60)
GCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTT > SRR19973074.2636801/1‑150 (MQ=60)
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TAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTC > SRR19973074.2475685/1‑150 (MQ=60)
TAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTC < SRR19973074.1936154/150‑1 (MQ=60)
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AACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCA < SRR19973074.3826051/150‑1 (MQ=60)
AACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCA > SRR19973074.2095948/1‑150 (MQ=60)
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ACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCAT < SRR19973074.3408139/150‑1 (MQ=60)
GAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAA > SRR19973074.2027508/1‑150 (MQ=60)
GAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAA > SRR19973074.2833547/1‑150 (MQ=60)
GAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGAGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAA > SRR19973074.2833531/1‑150 (MQ=60)
AAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAAT < SRR19973074.2941973/150‑1 (MQ=60)
AAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAAT < SRR19973074.176571/150‑1 (MQ=60)
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TAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGTACT > SRR19973074.3351701/1‑150 (MQ=60)
AGTTAACACGTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGTACTA > SRR19973074.1904912/1‑150 (MQ=60)
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GTATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGTACTACTTACTCGC < SRR19973074.3446243/150‑1 (MQ=60)
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GGTATTTCAGGTATACGGAAAATGGATGTCTGAAAACAATAATGCACAGGTAGCTTTGTTAAATACACAGTTAAGCGAGTTTGCCCCAACCATGCCCCATAACGAAGCAATGAAAAATTAATTTAATATTTATCAAATAGTTAACACGCATGACTCTTGAAATCCATAAATTCAAGCGCAGTGCCCAGCCATCCCGATACTGCTGCTTTCACCAAATCCTTAGTGCTTCTTTCGTGTTTTTCTATTGTCATAATGGTTATCTCTAAAAAAGAGGTAAGATGCGTACTACTTACTCGC > CP009273/1646845‑1647141
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
