| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2643100 | 101 (1.050) | 5 (0.060) | 5/254 | 8.7 | 5.3% | intergenic (‑256/+29) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent |
| ? | NC_000913 | = 2643110 | 89 (1.020) | intergenic (‑266/+19) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATCACCACGAGTTTTACGCA > NC_000913/2642963‑2643256 | gTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACTG‑TACATAAAGTaa < 8:373283/149‑1 (MQ=255) gACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGACACGG‑TACATAAAGTAAcc > 1:273670/1‑149 (MQ=255) cAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGt < 4:201487/149‑1 (MQ=255) aaGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTgg < 7:210065/149‑1 (MQ=255) aGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGc < 4:255454/149‑1 (MQ=255) ccACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGt > 2:304006/1‑148 (MQ=255) cacaTTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTaa > 7:130084/1‑149 (MQ=255) acaTTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAAt < 7:248726/149‑1 (MQ=255) caTTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATg < 7:43529/149‑1 (MQ=255) tCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGc > 6:349152/1‑148 (MQ=255) aCTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTTACTTTATGT‑ACCGTGGCGTAATgtttta < 5:166158/149‑6 (MQ=38) aCTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTAt > 3:139590/1‑149 (MQ=255) aGGCTAACTTAGTGTTGCTTAGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTTCAACTTAATTCTTCATTCATAAAACATAACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGa < 4:113857/149‑1 (MQ=255) aGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTATTATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGACACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGa > 5:367390/1‑149 (MQ=255) aGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCa < 4:388771/147‑1 (MQ=255) aGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCa < 4:338265/147‑1 (MQ=255) aaCTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCt > 4:229577/1‑149 (MQ=255) tACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTaa > 8:60459/1‑149 (MQ=255) aCTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATAACGCCACTG‑TACATAAAGTAACAGTGCCGTAATCACAATCAGACCGCTATAAt > 1:267409/1‑149 (MQ=255) cTGTTGCATCGTTACATACTTCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAAt < 5:327749/148‑1 (MQ=255) cTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTCCGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAAt < 2:164489/148‑1 (MQ=255) cTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAAt < 7:371350/148‑1 (MQ=255) cTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAAt < 8:109708/148‑1 (MQ=255) tGTTGCATAGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCAACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGt > 7:183668/1‑149 (MQ=255) ttACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATAAGACCGCTTTAATGTCGATGGCtt > 7:246968/1‑148 (MQ=255) tACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCt < 2:169450/149‑1 (MQ=255) aCTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTg > 2:207414/1‑149 (MQ=255) ccTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAAt < 8:57519/107‑1 (MQ=255) ccTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAAt > 7:57519/1‑107 (MQ=255) ccTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATc > 4:250267/1‑149 (MQ=255) ccTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATc < 6:76136/149‑1 (MQ=255) ttAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCg > 7:271344/1‑149 (MQ=255) ttAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCg > 4:102896/1‑149 (MQ=255) gTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTAc < 1:127522/149‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aaTACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGAGGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGa < 8:183668/148‑1 (MQ=255) aTACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGAc < 4:332535/148‑1 (MQ=255) aTACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGAc < 8:306151/148‑1 (MQ=255) aTACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGAc < 5:361853/148‑1 (MQ=255) tACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTACCCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACca < 2:267409/149‑1 (MQ=255) 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tAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATc < 4:33118/149‑1 (MQ=255) tAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATc > 7:46511/1‑149 (MQ=255) aaaaCATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTa < 4:258960/107‑1 (MQ=255) aaaaCATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTa > 3:258960/1‑107 (MQ=255) aaaCATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGA‑ACCATCGCCCGCCCACTGCCCACAGGCAGCATCGat > 5:206427/1‑149 (MQ=255) aaCATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGa > 5:394754/1‑148 (MQ=255) aTTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTc < 2:173578/99‑1 (MQ=255) aTTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGa < 4:153388/129‑1 (MQ=255) aTTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGa > 3:153388/1‑129 (MQ=255) gCCACGG‑TACATACAGTATCGGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCTTCCGGTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGGCGATACAAGCGCCCGCCAACTGACCAGATGCAGCATCGATATCATcac < 2:100488/149‑1 (MQ=255) gCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATcac < 2:273670/149‑1 (MQ=255) aTAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATCACCACGAGttt > 4:362164/1‑148 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |