| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP034943 | 2,056,112 | G→T | 5.0% | intergenic (‑208/+32) | EO946_RS10315 ← / ← EO946_RS10320 | CPBP family intramembrane metalloprotease/glutamine amidotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP034943 | 2,056,112 | 0 | G | T | 5.0% | 603.8 / 2.9 | 224 | intergenic (‑208/+32) | EO946_RS10315/EO946_RS10320 | CPBP family intramembrane metalloprotease/glutamine amidotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (85/120); new base T (17/2); total (102/122) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.01e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
AACTTTATTATCACAATACGTTCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAATGCAATGTATCTGGTGCAAATACATCTAATTTTTT > NZ_CP034943/2055973‑2056251 | aaCTTTATTATCACAATACGTTCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACCTATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGAATTTAACAAAAAAATg > 2:2921249/1‑140 (MQ=255)aaCTTTATTATCACAATACGTTCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATg > 1:815041/1‑140 (MQ=255) cTTTATTATCACAATACGTTCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGcc < 1:429425/140‑1 (MQ=255) tattatCACAATACGTTCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAATGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATTCCCCt > 1:1011428/1‑140 (MQ=255) tattatCACAATACGTTCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCt < 1:4130670/140‑1 (MQ=255) tattatCACAATACGTTCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCt < 2:2024536/140‑1 (MQ=255) tattatCACAATACGTTCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCt < 2:473212/140‑1 (MQ=255) tattatCACAATACGTTCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCt < 1:1713917/140‑1 (MQ=255) tattatCACAATACGTTCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATAATCCAACATTCAAGGTTATATAAACTTTAACAAAAAAATGCCCCt > 2:1979899/1‑140 (MQ=255) tattatCACAATACGTTCGAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCt < 1:2596927/140‑1 (MQ=255) gattatCACAATACGTTCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCt < 1:1370890/139‑1 (MQ=255) acaATACGTTCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCa > 2:526543/1‑140 (MQ=255) caATACGTTCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCCAGGTTCTTTTGTCTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTGAg > 1:1649896/1‑140 (MQ=255) caATACGTTCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTAAAGGTTATTTATTCTTTAAGAAAAAAATTCCCCTTAGTTCAg > 1:3488456/1‑140 (MQ=255) gTTCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑t < 1:614555/140‑1 (MQ=255) ttCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTTCTCTTCTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACTTAGTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAATATAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑tt < 2:4202581/140‑1 (MQ=255) tCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATg < 1:2485193/119‑1 (MQ=255) tCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑ttt > 2:2339999/1‑140 (MQ=255) tCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAAAAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑ttt > 2:4258388/1‑140 (MQ=255) tAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTgg > 2:2670233/1‑140 (MQ=255) tAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATAATTAAATGTTATTTAGACTTTAAAAAAAAAATGACACTTAGTTGAGGGGGA‑TTTgg > 2:2159382/1‑140 (MQ=255) aGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGGTCAGGGTCA‑TTTGGt > 2:404611/1‑140 (MQ=255) tgtgATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATATACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGAt > 2:3361892/1‑140 (MQ=255) tgtgATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTATACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGAt > 2:830313/1‑140 (MQ=255) tgtgATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGAt > 2:3595864/1‑140 (MQ=255) tgtgATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACGTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCATGGGCA‑TTTGGTAATGAt > 2:3652118/1‑140 (MQ=255) tgtgATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTAAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTAAGGGGCA‑TTTGGTAATGAt > 2:3697747/1‑140 (MQ=255) tgtgATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCAATCAAGGTTATTTATACTTTAAAAAAAAAATTCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATTAt > 1:2286965/1‑140 (MQ=255) tgtgATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTATTTTTTAATAAATAGACAAAATCCATCATTAAAGGTTAATTATACTTTAACAAAAAAATGCCCCGAAGTTCAGCGGCA‑TTTGGTAATGAt > 2:1647627/1‑140 (MQ=255) gtgATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAAGAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGAtt > 2:4170296/1‑140 (MQ=255) gtgATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAAAAGACATATTCCAACATTAAAGGTTATTTAGACTTTAAAAAAAAAATGACCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAattatt > 1:2244693/1‑140 (MQ=255) tgATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATTCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑GTTGGTAATGATTc > 2:3537696/1‑140 (MQ=255) tgATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTc < 1:694064/140‑1 (MQ=255) tgATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCGTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGAtta > 2:2726483/1‑139 (MQ=255) aTTGTTTCAAATTTCGGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTa < 2:2983735/140‑1 (MQ=255) ttGTTTCAAATTTCTTCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATACATAGACATCTTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGGTCCGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTAt < 2:634335/140‑1 (MQ=255) gTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCCGGGGCA‑TTTGGTACTGATTCTATcc > 2:2853795/1‑140 (MQ=255) gTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTATTTTTTAATTAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAAGCATTCTATcc < 2:240296/140‑1 (MQ=255) tttCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCa < 2:152439/140‑1 (MQ=255) tttCAAATTTCTGCATGACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCa < 2:3012842/140‑1 (MQ=255) ttCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATTCCCCTTAGTTCAGGGTCA‑TTTTGTAATGATTCTATCCAt > 2:881018/1‑140 (MQ=255) aaaTTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTa < 1:3404224/140‑1 (MQ=255) aCTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTaa < 2:3041265/140‑1 (MQ=255) cAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCgaagaa < 2:3918268/140‑1 (MQ=255) cAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCgaagaa < 2:815041/140‑1 (MQ=255) gTTGCGTCGTTTTGTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTAAAGGGTATTTAGACGTTAACAAAAAAATGCCCCTTATTTAAGGGGCA‑TTTTGTAATTATTATATCCATTTATTTTATTCATTAAATAGAAGAAGt > 1:1439471/1‑140 (MQ=255) gTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACAAAATACATCATTCAAGGTTATTTAGAAATTAAAAAAAAAATGCACCTTCGTTGAGGGGCA‑TTTGGTAAATATTATATCCATTTATTGTATTCATTAAATCGAAGAAGt > 1:2913235/1‑140 (MQ=255) ttGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATATACAAATTCCATCATTAAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATTCCCCTTAGTTAAGGGGCA‑ATTGGTAATGATTATATGCAATTATTTTATTAATTAAATCGAAGAAGTa > 1:12841/1‑140 (MQ=255) ttGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAAAAGACATATTCCATCAATAAAGGTTATTTAGACTTTAAAAAAAAAAATACCCTTATTTAAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTGTATGCATTTATTTTATTAATTAAATCgaagacttt > 1:2925408/1‑136 (MQ=255) ttGCGTCGTTTTCTTTTGTAATAAATAGACATAATCCATCAGTCAAGGTTACTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCATAGTTCCCGGGCA‑ATGGGTAATGCTTCGATCGAATGATTGTCCTCCAGAACTCGCAGAAGTa > 2:2453933/1‑140 (MQ=255) gtcgtTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCa < 1:3492459/140‑1 (MQ=255) ttttCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTGAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCAATCCATTTAATGTATTCATTAACTCGAAGAAGTAGTCAGGtt > 2:2052131/1‑140 (MQ=255) tCTTTTTTAATAAATAGACATCTTCCATCATTCAAGGGTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTAt < 2:1003399/140‑1 (MQ=255) taataaATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGTtttt > 2:1124293/1‑140 (MQ=255) atcaagagagATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAAGAATAAAATGACCCTTAGTTGTGGGGGA‑TCTGGGAATGTTTCTATCCCTTTATTGGATTCATTAACTCGACGAAGTATTCAGGTTTATGGGTtttat < 2:1183585/134‑1 (MQ=255) ataaatcCACCTAGTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAACATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTtttat < 1:2387040/140‑1 (MQ=255) ataaataGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTtttat < 2:1349255/140‑1 (MQ=255) ataaataGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTtttat < 2:1373331/140‑1 (MQ=255) agaaatcGACATATTCCCTCATACAAGGGTATTTAGACTTTCACACAAAAATGCCCCGGAGGTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTtttat < 1:781133/138‑1 (MQ=255) aaataGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTtttattt < 1:1910019/140‑1 (MQ=255) aCATCTTCCAACATTCAAGGTTATTGAGACATTAACAAAAACATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTATTGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTta < 1:3952005/140‑1 (MQ=255) cATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTtat < 1:3653577/140‑1 (MQ=255) cATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTtat < 1:3361892/140‑1 (MQ=255) atTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATGCAGGTTTATGTGTTTTATTTAGCTTATAca > 2:3287110/1‑139 (MQ=255) ttCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCAt < 1:1352257/79‑1 (MQ=255) ttCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCa < 1:1137589/140‑1 (MQ=255) ttCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCa > 2:1241570/1‑140 (MQ=255) ttCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTGTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTAGCCATTTATTGTATTCATTAACTCGACGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCa < 1:71450/140‑1 (MQ=255) tCCATCATTCAAGGTTATTTAGTCTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCAt < 1:2713325/140‑1 (MQ=255) tCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCAt < 1:3577419/140‑1 (MQ=255) tCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCAt < 1:2357485/140‑1 (MQ=255) tCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCAt < 2:3077434/140‑1 (MQ=255) atcatTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGaa < 2:1707411/140‑1 (MQ=255) tcatTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCg > 1:2818292/1‑94 (MQ=255) tcatTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCg < 2:2818292/94‑1 (MQ=255) tcatTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAAt > 1:3812423/1‑140 (MQ=255) tcatTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAAt > 1:1417999/1‑140 (MQ=255) tcatTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAAt > 2:3385957/1‑140 (MQ=255) tcatTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAAt > 1:398179/1‑140 (MQ=255) tcatTCAAGGTTATGTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCC‑TGTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCCTTATCTCGAAGAAGTCTTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAAt > 2:3019595/1‑140 (MQ=255) atTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAATGc < 2:3177900/140‑1 (MQ=255) atTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAATGc < 1:4258388/140‑1 (MQ=255) atTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCGATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAATGc < 1:3555316/140‑1 (MQ=255) ttCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCATGTGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTCGCTTATACCATGAATGCa < 2:2140101/140‑1 (MQ=255) aGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAATGCAATGt < 1:677309/140‑1 (MQ=255) aGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAATGCAATGt < 1:522873/140‑1 (MQ=255) ggTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAATGCAATGTa > 1:3597854/1‑140 (MQ=255) tATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAATGCAATGTATCt < 1:3697747/140‑1 (MQ=255) tATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAATGCAATGTATCt < 2:3484654/140‑1 (MQ=255) aTTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAATGCAATGTATCTg > 2:185461/1‑140 (MQ=255) tttAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCATTTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAATGCAATGTATCTg > 1:2096740/1‑140 (MQ=255) tttAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAATGCAATGTATCTgg > 1:3033236/1‑140 (MQ=255) aCTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTCTCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAATGCAATGTATCTGGTGCaa > 2:1731923/1‑140 (MQ=255) aCTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTAt < 2:3261612/95‑1 (MQ=255) aCTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTAt > 1:3261612/1‑95 (MQ=255) cTTGAACAAAAAAATGCCCCTTATTTCAGGCGCA‑TTTTGTACTGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTAGTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAATGCAATGTATCTGGTGCaaa < 1:3198255/140‑1 (MQ=255) tAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGTTTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAATGCAATGTATCTGGTGCAAATAc > 1:4072553/1‑140 (MQ=255) tAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAATGCAATGTATCTGGTGCAAATAc > 2:3086102/1‑140 (MQ=255) tAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TGTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAATGCAATGTATCTGGTGCAAATAc > 1:502185/1‑140 (MQ=255) gCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAATGCAATGTATCTGGTGCAAATACATCCAAtttttt < 2:2623398/140‑1 (MQ=255) | AACTTTATTATCACAATACGTTCTAGATGCTGTGATTGTTTCAAATTTCTGCATTACTCTACTTCAGTTGCGTCGTTTTCTTTTTTAATAAATAGACATATTCCATCATTCAAGGTTATTTAGACTTTAACAAAAAAATGCCCCTTAGTTCAGGGGCA‑TTTGGTAATGATTCTATCCATTTATTGTATTCATTAACTCGAAGAAGTATTCAGGTTTATGGGTTTTATTTAGCTTATACCATGAATGCAATGTATCTGGTGCAAATACATCTAATTTTTT > NZ_CP034943/2055973‑2056251 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |