| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP034943 | 1,936,589 | T→G | 10.8% | K3554N (AAA→AAC) | EO946_RS09735 ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP034943 | 1,936,589 | 0 | T | G | 10.8% | 972.6 / 14.7 | 413 | K3554N (AAA→AAC) | EO946_RS09735 | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (133/212); new base G (65/2); total (198/215) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.78e-21 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 424 total aligned reads displayed.
CGAGTCCAAGCATCCGCAGAAACTTCGATGTTGAACAGGGACGCATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTATTGGC > NZ_CP034943/1936452‑1936722 | cGAGTCCAAGCATCCGCAGAAACTTCGATGTTGAACAGGGACGCATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGtgtt > 1:2829006/1‑140 (MQ=255) aGCATCCGCAGAAACTTCGATGTTGAACAGGGACGCATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTTGAAGTg > 1:5626540/1‑140 (MQ=255) aTCCGCAGAAACTTCGATGTTGAACAGGGACGCATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCct < 1:2433053/140‑1 (MQ=255) aGAAACTTCGATGTTGAACAGGGACGCATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTctcctc > 2:3110068/1‑140 (MQ=255) aaaCTTCGATGTTGAACAGGGACGCATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTGTTTGGAATTTCCTCTCCTCCa > 1:2124746/1‑140 (MQ=255) tCGATGTTGAACAGGGACGCATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTGTTTGTAAGTGGCTCTCCTCCAATTaa > 2:6061891/1‑140 (MQ=255) aaCAGGGACGGACCGCCACACGTGTCGGTTGGTCCCTATACAATTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTCTAGGAACTTGGTTACCGTCGATTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACg < 2:7632353/140‑1 (MQ=255) aaCAGGGACGCATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTTGAAGTTCCGCTCCTCCAATTAAA‑ACATGACg > 1:497933/1‑140 (MQ=255) aaCAGGGACGCATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACg < 2:425487/140‑1 (MQ=255) aaCAGGGACGCATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACg < 1:4877959/140‑1 (MQ=255) aaCAGGGACGCATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACg < 2:1549615/140‑1 (MQ=255) aaCAGGGACGCATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACg < 2:4598391/140‑1 (MQ=255) aaCAGGGACGCATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTGGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACg < 1:4528926/140‑1 (MQ=255) ggACGCATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGTAGTGCCTCGCCTCCAAATAAA‑AGATGTCGAAGCg > 2:1518544/1‑140 (MQ=255) aCGCATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGt < 2:4670906/140‑1 (MQ=255) aCGCATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGt < 2:1893501/140‑1 (MQ=255) aCGCATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGt < 2:907767/140‑1 (MQ=255) cATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCCAATAAGTGTCTGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTTGCAGTGCCGCTCCGCCCAATAAC‑ACATGACGAAGCGGTACt > 2:2838181/1‑140 (MQ=255) cATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTTCCTCACCGCCAAATAAA‑ACATGACGAAGAGGTAcg > 2:4330673/1‑139 (MQ=255) cATCGACACAAGTTTCGGGTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTTGAAGTTCCTCTCCTCCAATTAAA‑AGATGACGAAGCGGTAca > 2:7230214/1‑139 (MQ=255) caAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTcccc < 2:349125/140‑1 (MQ=255) caAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTcccc < 2:7402687/140‑1 (MQ=255) gTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCCAGTAAC‑ACATGAAGAATCGGTACTCCATCCCcaac > 2:6685969/1‑138 (MQ=255) ggTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTg < 2:2386002/140‑1 (MQ=255) gTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTTGTAGTTCCGGGCCGCCCATTTAC‑ATATTACGAAGCGGTACTCCTTACCCCACATATGCAGcg > 1:3292458/1‑139 (MQ=255) gTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTTGAAGTTCCTCTCCTCCAATTAAA‑ATAGGAAGAAGCGGTAATCCTTCCACATAATCTGCAGCt > 1:749193/1‑140 (MQ=255) cATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTGTTTGGTAGTGGCGCTCCGCCCAATAAA‑ACATGACGAAGCGGTACACCGTACCCAACATCTGCCGCGAcc > 1:1145494/1‑140 (MQ=255) tctaCATTTGGGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCACTTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCATTCCCCATCATCTGCAGCTACcag < 1:7662546/138‑1 (MQ=255) tataCATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTTCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTACCCATCATCTGCAACTACcag > 2:6310674/1‑140 (MQ=255) tataCATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACcag < 1:2976862/140‑1 (MQ=255) tataCATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACcag < 1:3599113/140‑1 (MQ=255) tataCATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACcag < 1:2288724/140‑1 (MQ=255) ataCATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACcagc < 1:5146862/140‑1 (MQ=255) ataCATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACcagc < 1:4397967/140‑1 (MQ=255) aTTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCGCTCCGCCACTTAAA‑ATATGACGCAGCGGTGCTCCGTCCCCCTCAAATGCAGCGACcagcaccg > 1:3086173/1‑137 (MQ=255) aTTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTGTTTGGAAGTGCCACGCCGCCCAATAAC‑AGATGACGGAGCGGTACTCCATCCCCATAATCTTCACCGACCagccgcg > 1:5521278/1‑139 (MQ=255) tttGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTTGTAGTGGCTCTCCTGCAATTAAC‑AGATTACGAAACGGTACTCCATACCCATCATCTGCAGCGAACaccagcgt > 1:3178519/1‑138 (MQ=255) tttGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTTGTAGTGGCGGTCCTGCCATTTAA‑AGATGAAGAAGCGGTACTCCTTCCCCCTCATCTGCAGCTACCagcagcgt > 1:5361937/1‑138 (MQ=255) tttGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTTGAAGTGCCGGTACTCCCATTAACAAAATTAC‑AAGCGGTAATCCTTACCCAACAGATGGACCGACcagcaacgt > 1:6888222/1‑136 (MQ=255) tttGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCtt > 2:4738018/1‑140 (MQ=255) tttGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAA‑AGATGACGAAGCGGTTATCCTTCCCCAACATCTGCAGCTACCAGCAGCtt > 1:3734376/1‑140 (MQ=255) tttGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAAATAAA‑ACATGACGAAGCGGTACTCCTTACCCCACATCTGCAGCTACCagcagcgt > 1:664232/1‑138 (MQ=255) tgtgATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTGTTTGGAAGTTCCGGTCCTCCCATTAAA‑AGATTACGAAGCGGTAATACTTCCCCATAATATGCAGCTACCAGCAGCTTCa > 1:960171/1‑140 (MQ=255) tgtgATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTGTTTGGAAGTGCCGCTCCGCCCAATAAC‑AAATTACGAACCGGTACTCCATACCCAACATAAGCAGCGACCAGCAGCTTCa > 2:2931996/1‑140 (MQ=255) tgATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTGTTTGGAAGTGCCTAGCCTGCAAATAAC‑AGATGACCAAGCCGTTATCCTTACCCATAATCTTCAGAAACCACCAGCATCaaa > 2:5320619/1‑140 (MQ=255) tgATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTGTTTGGAAGTGCCGGTCCGCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTGCTTCCCCCTCATCTGCAGCTACCCGCAGCTTCaaa > 2:5139271/1‑140 (MQ=255) ggCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATggg < 1:7373432/140‑1 (MQ=255) gTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCACTCCTACAAATAAA‑AGATGAAGAAGCGCTACAACTTAACCAAAAAATTCAGCTAACAGCAGCTTAAAAAgggcgggg > 2:1096590/1‑139 (MQ=255) gTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTGTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATgggcgggc > 2:1378638/1‑140 (MQ=255) ctgctCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTTGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCAACATCTGCAGCGACCACCAGCTTCAAATGGGGGGGCGTc > 2:7096768/1‑140 (MQ=255) tgctCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTcc < 1:6800647/140‑1 (MQ=255) ctctATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGGTGAGGAAGCGGTACTCCTTCCCCAACATATGCAGCTACCCGCACCTTCAAATGGGCGGGGGTGCCg > 2:1168024/1‑140 (MQ=255) ctctATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCg < 1:2618452/140‑1 (MQ=255) ctctATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTGTTTGGGAGTGCCGCTCCGCCAATTAAC‑AGATTGCGAAGCGGTACTCCTTCCCCCTCATCTGCAGCTACCCGCACCGTCAAATTGGCGGGCGTgccc > 1:849771/1‑139 (MQ=255) tCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTTGGAGTGCCTCTCGTACAATTAAA‑ACATGAAGAAGCCGTACTCCTTCCCCATAATCTGCAGCTACAAGCACCTTCAAATGGGCGGGCGTGCCGTCggg > 2:5538992/1‑139 (MQ=255) tCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTTGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATTACGAAGCGGTAAACCTTCCCCAAAATCTGCAGCTACCCGCAGCGTAAAATGGGCGGGCGTCCcggcggg > 2:3334854/1‑139 (MQ=255) tCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGt < 1:1688591/140‑1 (MQ=255) tCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGt < 1:7581817/140‑1 (MQ=255) tCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCGACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGt < 2:6619261/140‑1 (MQ=255) tCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCGCGCCTCCCATTAAC‑AGATTACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCCGCGTCAACTGGGCGGGCGGCCCCGCGGt > 2:7314330/1‑140 (MQ=255) tCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTGTTTTGGAGTGCCTCTCCTCCCATTAAA‑ACATTAAGAACCGGTAATACTTCCCCCGCAACTGCCCCTACCAGCCGCATCAAATGGGCGGGCGTGCcggcggg > 1:1576427/1‑139 (MQ=255) tCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTGTTTGGTAGTTCCGCTCCGGCAAATAAA‑AGATGACGAACCGGGACAACGTACCCCAAAACTGCAGCTAACAGCAGCGTCAAAAGGGCGGGCGGCCcggcggg > 1:6348387/1‑139 (MQ=255) tCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTGTTTGGAAGTGGCTCTCCGCCCAATAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTGCCCATCATCTGCAGCTACCAGCACCGTCAAATGGGCGGGCGTCCCGGCGGt > 1:7251792/1‑140 (MQ=255) gcCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTTGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑ACATTACGAAGCGGTACTACTTACCCATAATCTGCACCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGGTAAGt > 2:4092843/1‑140 (MQ=255) gcCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTTGAACTGCCGCTCCTCCAATTAAC‑ACATTACGAAGCGGTACGCCTTACCCATCATCTGCAGCGACCAGCAGCTTCAAATTGGCGGGCGTCCCGTCGGTTAcct > 2:5802810/1‑138 (MQ=255) gcCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGTAGTGCCGCTCCTCCAATTAAA‑AGATGACGAAGCGGTACTCCGTGCCCCTCATCTGCAGCTACCAGCAGCGTCAAATTGGCGGGGGTCCCGTCGGTTACgg > 1:3461797/1‑139 (MQ=255) gcCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATTACGAAACGGTAATCCTTGCCCCTCAACTGCAGCTACCAGCAGCGTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGGTAAGt > 2:3700048/1‑140 (MQ=255) gcCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGt < 1:4304648/140‑1 (MQ=255) gcCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTACCCAACATCAGCAGCTACCAGCAGCTTCAAAAGGGCGGGCGTCCCCTCGGTTAcct > 2:65585/1‑138 (MQ=255) gcCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AAATGAAGAAGCGGTACTCCGTCCCCATCAACTTCAGCGACCCGCAGCGTCAAATTGGCGGGCGTCCCGTCGGGTACgg > 2:3235323/1‑139 (MQ=255) gcCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTGTTTTGAAGTGCCTCTGCGCCAATTAAC‑AGATTACGAAGCGGTACTCCTTACCCATCATCTGCAGCTACCACCAGCTTAAAATGGGCGGGCGGCCCGTCCGTTACGt > 2:1231186/1‑140 (MQ=255) gcCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTGTTTTGAAGTGCCGCTCCGCCAAATAAC‑ACAAGACGAAGCGGTACTCCATCCCCATCAGCTGCACCTACCAGCACCTTCAAAAGGGCGGGCGGCCCGGGGGGTACGt > 1:464082/1‑140 (MQ=255) aaaTAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTGTTTTGTAGTGCCTCTCCTCCAAATAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCGTCCCCCACATCTGCAGCTAACCGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGGCCCGTCGGTTAAGTCaa > 2:2882024/1‑140 (MQ=255) aTAAGTTTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGTGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATg < 1:4033409/140‑1 (MQ=255) aaGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTACC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCg < 1:7118056/140‑1 (MQ=255) aaGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCg < 2:5434771/140‑1 (MQ=255) tgtATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATg < 1:6589816/140‑1 (MQ=255) tgtATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATg < 2:2538745/140‑1 (MQ=255) tATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCt < 1:1040025/140‑1 (MQ=255) aCTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGa < 2:5278623/140‑1 (MQ=255) aCTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGa < 1:4771465/140‑1 (MQ=255) aCTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGa < 1:1378638/140‑1 (MQ=255) aCTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGa < 1:5057730/140‑1 (MQ=255) aCTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGa < 1:1952696/140‑1 (MQ=255) aCTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGa < 2:1663145/140‑1 (MQ=255) aCTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGa < 2:2728126/140‑1 (MQ=255) aCTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGa < 2:5866841/140‑1 (MQ=255) aCTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGa < 1:3527046/140‑1 (MQ=255) aCTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGa < 2:3551909/140‑1 (MQ=255) tGGTTACCGTCGTTTTTGGAAATGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAATCGGTACTACTTCCCCCTCATCTGCAGCTACCACCAGCGTCAAATTGGGGGGCGTCCCCTCGGTTACCTCAATTCGATTCGGTCGATAg > 2:2233200/1‑140 (MQ=255) gTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTa < 2:4934068/140‑1 (MQ=255) ttACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTAt < 2:303016/140‑1 (MQ=255) ttACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTAt < 1:4096543/140‑1 (MQ=255) ttACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTAt < 1:6061891/140‑1 (MQ=255) ttACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTAt < 1:5859434/140‑1 (MQ=255) ttACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTAt < 2:7563083/140‑1 (MQ=255) ttACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGGACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTAt < 2:1989292/140‑1 (MQ=255) ttACCGTCGTGTTTGGACGTGCCTCTCCTCCAATGAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCAGCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTAt < 2:3964133/140‑1 (MQ=255) cgtcgtTTTTTGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAA‑AAAAGACGAACCGGTACTCCTTCCCCATCAACTGCAGCAACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCCGCGGGTGAGGCAATGCGTTGCGGTCGATattatttgg > 2:5684494/1‑137 (MQ=255) cgtcgtTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATTACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCACCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAAAGCGATGCAGTCGATAGGAtttgg > 2:7034891/1‑137 (MQ=255) | CGAGTCCAAGCATCCGCAGAAACTTCGATGTTGAACAGGGACGCATCGACACAAGTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAAC‑AGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTATTGGC > NZ_CP034943/1936452‑1936722 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |