| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NZ_CP034943 | = 767772 | 278 (1.220) | coding (193/645 nt) | EO946_RS03930 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
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(MQ=255) cAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCA‑CAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAg < 1:1446845/71‑1 (MQ=255) aGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCA‑CAGCGCCGCCGCCACTGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAg < 1:3567443/140‑1 (MQ=255) aGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCA‑CAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAg < 1:3174534/140‑1 (MQ=255) aGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCA‑CAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAg < 1:1969454/140‑1 (MQ=255) aGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCA‑CAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAg < 1:208866/140‑1 (MQ=255) aGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCA‑CAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAg < 1:2813985/140‑1 (MQ=255) aGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCA‑CAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCACCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAg < 1:2928635/140‑1 (MQ=255) gggCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCA‑CAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAGc > 1:1496985/1‑140 (MQ=255) ggCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCA‑CAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGcgccgccgc < 2:2088119/87‑1 (MQ=255) | GAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATACCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCA‑CAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAGCA > NZ_CP034943/767639‑767911 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |