| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | ACB122 | 1,062,909 | T→G | 17.3% | F341V (TTT→GTT) | aroP_1 → | Aromatic amino acid transport protein AroP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB122 | 1,062,909 | 0 | T | G | 17.3% | 155.2 / 3.2 | 76 | F341V (TTT→GTT) | aroP_1 | Aromatic amino acid transport protein AroP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (27/33); new base G (12/2); total (41/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.25e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAGCATTACCCACCTCAAATTCCG > ACB122/1062778‑1063039 | cGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTg < 6:171314/135‑1 (MQ=255)cGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTg < 5:20252/135‑1 (MQ=255) ggTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGc < 1:137968/135‑1 (MQ=255) ggTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGc < 6:11743/135‑1 (MQ=255) ggTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGc < 6:191099/135‑1 (MQ=255) ggTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGc < 4:165361/135‑1 (MQ=255) ggTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGc < 3:35531/135‑1 (MQ=255) ggTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGc < 3:125064/135‑1 (MQ=255) ggTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGGTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGc < 4:354023/135‑1 (MQ=255) gtgtACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGc < 1:240228/134‑1 (MQ=255) acaacaGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCg < 8:1373/135‑1 (MQ=255) tgtgtACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTg‑tgcgt > 1:294675/1‑135 (MQ=255) tgtgtACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTg‑tgcgt > 6:74016/1‑135 (MQ=255) tgtgtACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTg‑tgcgt > 7:366838/1‑135 (MQ=255) tgtgtACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTg‑tgcgt > 7:228365/1‑135 (MQ=255) tgtgtACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGAACGGCCTg‑ggcgt > 8:36013/1‑135 (MQ=255) tgtACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTg‑tgcgtgc > 7:218499/1‑135 (MQ=255) aCGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCAGTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTgc > 2:307448/1‑134 (MQ=255) gCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGAt > 5:314127/1‑134 (MQ=255) ccGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTAcc > 6:369007/1‑134 (MQ=255) ccGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTAcc > 2:28372/1‑134 (MQ=255) ccGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTAcc > 7:239973/1‑134 (MQ=255) ccGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCGTTGGGGCCGGGCGG‑TGCCTGCGGATCAAATa > 5:315105/1‑132 (MQ=255) ccGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCGTTGCGGCCGGCCGG‑TGGGTGCTGATCAATTaacg > 1:181743/1‑132 (MQ=255) ccGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCCTTGCGCCCCGCCTG‑TGCGGGCTGCTCAATTATCt > 3:27451/1‑135 (MQ=255) tGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGCGCCGTAGCGGCGTGCCGCAGACCGCCCTGGCCGTGTCGGCCTTAGCGACCGGCCTG‑GGCCGTCTGATGAAATACCAGA‑Tgg > 1:25179/1‑134 (MQ=255) tGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGc > 6:347637/1‑135 (MQ=255) tGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCGTTGCGACCGGCCGG‑TGCGTGCGGATCAATTAACTGA‑TGc > 3:335272/1‑135 (MQ=255) cTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCcg > 3:364370/1‑135 (MQ=255) gTTTGGGCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCcggg < 5:89170/135‑1 (MQ=255) ttGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCcggg < 5:70682/133‑1 (MQ=255) ggcctggccAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGGCCGGCCTG‑GGCGGGCGGATCAATTTCCTGA‑TGGcgggccgg > 1:377891/1‑135 (MQ=255) ggcctggccAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCcgggcggg > 4:91740/1‑135 (MQ=255) ggcctggccAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCcgggcgg < 8:366838/134‑1 (MQ=255) ggcctggccAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTAGGGCGTTGCGGCCGGCCCG‑GTGGTGCGTCGAAATTTCCTGA‑TGCcgggcggg > 1:186422/1‑135 (MQ=255) ggcctggccAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGGCGGCCGTTGGGCCCGGCCGG‑GGCGGGGGGATCAATTACCTGA‑TGCcgggcggg > 6:224151/1‑135 (MQ=255) ggcctggccAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCCTGTCGGCCGTTTCGCCCGGCCGGTTGCGT‑CTGATCAAATTCCTGA‑AGCccggcggg > 2:354321/1‑135 (MQ=255) cctggccAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCgggg < 3:175364/134‑1 (MQ=255) ccagccagGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTg < 5:74016/135‑1 (MQ=255) cagccagGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGCCCGCGCTGGCCGTGTCGGGCGTTGCGCCCGGCCTG‑TGCGTGCGGGGCAATTACCGGC‑TGCCCGGCGGGGCCGTTgg > 2:137067/1‑135 (MQ=255) cagccagGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGCCCGCGCTGGCCGTGGCGGCCGTTTGGGCCGGCCGG‑TGGGGGCGGGGGACTTTCCTGA‑TGCCGGGGGGGGGCGTTgg > 1:320817/1‑135 (MQ=255) cagccagGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCAGGCCGTGTCGGCCGTTGCGCCCGGCCTG‑TGCGTGCGGATCAATTACCGGA‑TTCCGGGCGGGGCCTTTgg > 3:264703/1‑135 (MQ=255) gggCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCt < 1:126085/135‑1 (MQ=255) gggCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCt < 3:304277/135‑1 (MQ=255) gggCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCt < 2:172156/135‑1 (MQ=255) gggCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCGTTTCGCCCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCGTTGGTTTggt > 5:101843/1‑133 (MQ=255) aTGCGCCGCGTCAGTTGGTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCAGACCGCGCAGGCCGTGTTCGCCCTTGCGCCCGCGCTG‑TGCGTGGGGCGCAATTACCTGATTCCCGGGGGGGGCGGGTGGTTTggggtgg > 2:371052/1‑129 (MQ=255) gccgcGTCAGTTGCGGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCGTTGCGACCGGCCTG‑GGCGTGCTGATCAATTACCTGG‑TTCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGTTGGCGtg > 2:259621/1‑134 (MQ=255) ccgcGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTg < 2:294675/135‑1 (MQ=255) ccgcGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGCGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑GGCGTGCTGCTCCATTACCTGA‑GGCCGGGCGGGGCCGTGGGTTTGCGGCTGGGGTTg > 7:176401/1‑135 (MQ=255) cgcgTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGCCCGGCCGG‑TGGGTGCTGCTCAATTTCCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCGTTGGTTTGCGGATGGCGGTgg > 1:96570/1‑135 (MQ=255) gTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGGGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTTCCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAg > 5:150016/1‑135 (MQ=255) tGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCcg < 8:66576/135‑1 (MQ=255) tGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCcg < 2:25179/135‑1 (MQ=255) ggcgTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGGCTTTGGGGCCGGCCGG‑GGCGGGGGGGTCAATTTCCGGC‑TGCCGGGCGGGGGCGTTGGTTTGGGGATGGCGGTGGGCGTGTGCGCGGTGGGGGTCGACTggggg > 6:36275/1‑133 (MQ=255) cgggCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAg < 7:242366/132‑1 (MQ=255) cgggCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCGTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAg < 5:36275/132‑1 (MQ=255) cgTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAg < 1:309142/135‑1 (MQ=255) cgTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAg < 5:224151/135‑1 (MQ=255) cgTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAg < 4:227608/135‑1 (MQ=255) cgTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAg < 1:5873/135‑1 (MQ=255) cGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGGCTTTGGGACCGGCCGG‑GGCGTGCTGATCAATTACCTGC‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGGGTTGGCAGTGTCCGCGGTGGTGATCAACTGGGCGCGCATCa > 1:37945/1‑135 (MQ=255) cGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGCTGAACTGGGCGAGCCTCa > 3:159104/1‑135 (MQ=255) cGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCa < 6:18711/135‑1 (MQ=255) cGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑GGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCa < 5:132281/135‑1 (MQ=255) ccGCGCTGGCCGTGTCGGCCTGTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGACGGGCGGGGCGGTTGGTTTGCGGATCGCGGTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAGCATTa < 5:291063/135‑1 (MQ=255) ccGCGCTGGCCGGGTCGGCCGTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAGCATTa < 7:364554/135‑1 (MQ=255) gcgcTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGt > 7:372270/1‑88 (MQ=255) gcgcTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGt < 8:372270/88‑1 (MQ=255) gcTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGGTTGCTGATGGCGTTGGCTGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAGCATTACCCa > 1:1661/1‑135 (MQ=255) tGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAGCATTACCCAcc > 1:147363/1‑135 (MQ=255) ggCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCCGCATTACCCAcc > 1:248883/1‑134 (MQ=255) ggCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGGTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAGCATTACCCAcc > 8:248314/1‑134 (MQ=255) ccGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAGCATTACCCACCt < 8:239973/133‑1 (MQ=255) ccGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAGCATTACCCACCTc < 4:364370/134‑1 (MQ=255) gCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAGCATTACCCACCTCAAATTCCg > 3:45173/1‑134 (MQ=255) | CGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTG‑TGCGTGCTGATCAATTACCTGA‑TGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAGCATTACCCACCTCAAATTCCG > ACB122/1062778‑1063039 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |