| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB122 | 502,328 | 0 | T | G | 35.2% | 97.7 / 10.7 | 71 | intergenic (‑268/‑100) | estP/trpG | Esterase EstP/Anthranilate synthase component 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (14/32); new base G (25/0); total (39/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.56e-09 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGCCGGGACGTATGAGCGAGACCTATCCTGTGTTGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTCAAGAGGTTTAACACCATGTTACTGATGATCGACAATTACGACTCATTC > ACB122/502195‑502460 | tgCCGGGACGTATGAGCGAGACCTATCCTGTGTTGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCCGCCCCGCCCCCtt > 2:178134/1‑135 (MQ=255)tgCCGGGACGTATGAGCGAGACCTATCCTGTGTTGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCC‑CCCCGGCCGGCCCCGgtt > 8:163003/1‑136 (MQ=255) cGGGACGTATGAGCGAGACCTATCCTGTGTTGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGc > 8:85108/1‑135 (MQ=255) cGGGACGTATGAGCGAGACCTATCCTGTGTTGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGGCCCCCGTTGc > 1:230846/1‑135 (MQ=255) cGGGACGTATGAGCGAGACCTATCCTGTGTTGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTAGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCCGCCCGTGCCCGTTTGcc > 7:251981/1‑136 (MQ=255) cGTATGAGCGAGACCTATCCTGTGTTGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGTCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTTCCGGCCCG‑CCCCGCCCGGACCCGGTTGGCTtct > 3:276861/1‑135 (MQ=255) cGTATGAGCGAGACCTATCCTGTGTTGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCCGCCCCGGTTGCCGtctc > 8:414814/1‑136 (MQ=255) tATGAGCGAGACCTATCCTGTGTTGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCCGCCCCGGTTGGCtgcgcg > 2:127298/1‑130 (MQ=255) tATCCTGTGTTGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGGTTGCGGTCTCG‑GTTTCCGCCCGtt > 4:218724/1‑135 (MQ=255) tATCCTGTGTTGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCC‑CCCGGCCCCTCCCCGGTTGGCTTGGCG‑GTTAACGccccgt > 3:77018/1‑132 (MQ=255) ccTGTGTTGATCGTCTGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTAG‑TTTACCGCCCGTtgt < 3:306771/134‑1 (MQ=255) cTGTGTTGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGGCTTCTGG‑TTTACCGCCCGGTGTgg > 5:217080/1‑135 (MQ=255) cTGTGTTGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCGTCTCG‑GTTACCGCCCGTTGTgg > 3:195002/1‑135 (MQ=255) tgtgTTGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTgg < 6:165583/134‑1 (MQ=255) ttGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCC‑CCCCGCCCGGCCCCGGTTGCCTTCTCG‑GTTTCCCCCCCGTGTGGCAAAg > 3:417868/1‑135 (MQ=255) tGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCGCCCCGCCCCGCCCCCGTTTCCGTCGGCG‑TTTA‑CGCCCGGTGTTGCcaatc > 2:341260/1‑133 (MQ=255) tGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTGCCCGGTTGCCTTGTGG‑TTTACCGCCCGGTGTGGCCAAGc > 4:206847/1‑135 (MQ=255) tGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAg < 1:178134/134‑1 (MQ=255) tGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTGTGGCTTCGCG‑TTTACCGCCCCTTGTGGCAAAGcc > 8:311866/1‑136 (MQ=255) tGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCCGCCCGGCCCCCGTTGCCTTCGCG‑TTTACAGCCCCGTGTGGGCAAGc > 3:323969/1‑135 (MQ=255) tGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCCGCCCCTGCCCGGTTGCCGTCTCG‑TTTACCGCCCGTGGTTGCAAAGcc > 7:54599/1‑136 (MQ=255) tGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCCGCCCCGCCCCGTTTGCCGTGTCG‑TTTAACGCCCCTTGTGGCAAAGc > 3:369630/1‑135 (MQ=255) tGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCC‑CCCGGCCCGGCCCCCTTTTCCTGAACG‑TTTACACCCCGGTGTGGGaaaca > 1:391265/1‑133 (MQ=255) tGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCC‑CCCCGCCCCTGCCCCGTTGCCGTCGGGTTTTACCCCCGGTGGTGGCaaac > 3:287250/1‑134 (MQ=255) tGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCAGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGGCCCCGGTTGCCGTCTCC‑GTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGc > 3:124572/1‑135 (MQ=255) aTCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCCGTTGCCTTATCG‑TTTAAAGCCCGGTGTGGGAAATCcg > 4:403203/1‑135 (MQ=255) cGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCACGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCcgcg < 5:52909/135‑1 (MQ=255) gacAGCAAACTGTGTAGGCG‑GTTATCAACGCCCCACGCCGGTTGGGGTGGGCGCGCTTGATTTAATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGCCGCCGTTTGCATTCGCG‑TTTCCCGCCCTTGGTGGCAAACCcgcg < 6:38411/132‑1 (MQ=255) gTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGGCCCCGTTTGCCTTCTCG‑GTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCgcgc > 4:345094/1‑135 (MQ=255) gTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCC‑CCCCGCCCCGCCCCGTTTTCCGTCAGG‑TTTAACGCCCGGTGTGTCAAAGCCccgc > 4:110896/1‑135 (MQ=255) aGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCtgt < 7:101822/136‑1 (MQ=255) gCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCtgt < 4:86747/135‑1 (MQ=255) cAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGGCCCCCGTTTCGTTGTCG‑GTTTCCGCCCGTTGTGGGAAAGCCGCGCCTGTgg > 8:421926/1‑136 (MQ=255) cAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCCGCCCCTCCCCCGTTGGCGTATAG‑TGTACCGCCCGATGTGGCCAAACCGCGCCggtg > 5:431465/1‑135 (MQ=255) cAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCCGCCCCGCCCCCGTTGGCGTGTCG‑TTTTACCCCCCTTGTGGGAAAACCCCGCCagtg > 4:415013/1‑135 (MQ=255) cAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGCCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCCGCCCGTCCCCCTTTGGCGTATCG‑TTTACCGACCGTTGTGGCAAAACCACGGCGGTgg > 7:254396/1‑136 (MQ=255) aTGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGc < 2:6336/133‑1 (MQ=255) aTGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGGGCCCGGTTGGCGTCTCG‑GTTACCGCCCGGTGTGGCAAAGCCGCGCCGGTGGGGGGTGCCg > 5:167578/1‑135 (MQ=255) cgTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAgg < 3:192165/135‑1 (MQ=255) aaTCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGGCCCCGTTTGCCTTTGGG‑TTTACCCCCCGTTTTGGCAAACCCCCGCGGGGGGGGGGGGCGGGAAGGtg > 4:417174/1‑133 (MQ=255) aaTCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGGCCCCGTTTGCCTTCGCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCCCGCCTGTGGCGGGTGGCGGAAGGTTc > 4:403820/1‑135 (MQ=255) aaGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAAt < 7:83887/135‑1 (MQ=255) cccACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGGTTGCCTTCGCG‑GTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCGGTGGCTGGGGCCGGGAGGGTGGAATCATg > 7:427455/1‑135 (MQ=255) cACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCGTCTCG‑GTTTCCCCCCGTTGTTGCAAAGCCGCGCCGGTGGCGGGTGCCGGAAGGGTGGAATCATGaa > 6:129960/1‑135 (MQ=255) cACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGGTTGCCTTATCG‑TTTAACGCCCGGTGTGGGAAAGCCGCGCCGGTGGGGGGTGCCGGGAGGGTCGCATCATGaa > 4:384055/1‑135 (MQ=255) ccGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGGCCCCCGTTGGCGTCTCG‑TTTAACGCCCGGTGTGGCAAAGCCGCGCCGGTGGCGGGTGCCGGAAGGTTCGCATCATGAAGTGAg > 2:36883/1‑135 (MQ=255) ccGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCC‑CCCGGCCCGGCCCCCGTTGCCGTGTCG‑TTTAACGCCCCTTGTGGCCAACCCGCGCCTGTGGCTGGTGGCGGGAGGGTAGAATAAAGAAGTCAGt > 8:16260/1‑136 (MQ=255) ccGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCC‑CCCCGCCCGGGCCCGGTTGCCGTTACG‑GTTACCCCCCCGTTTGGCAAACCCCCGCCGGGGGCGGGTGGGCGCAGGTTCCAATCATGAAGtgac > 8:20581/1‑132 (MQ=255) tggcgttggcgCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGGTTGGCGTCTCG‑GTTTCCGCCCGGTGTGGCAAAGCCGCGCCGGTGGGGGGTGGCGGCAGGTTGGAATCCAGAAGTCAGTAgct > 8:266275/1‑134 (MQ=255) tggcgttggcgCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCCGCCCGTCCCCCGTTGCCTGCGCG‑TTTACCGCCCGTTGGGGGCAAGCCCCGCCGGAGGCGGGGGCCGGCAGGTTCGGATCATGAAATCAGTAgct > 8:266278/1‑134 (MQ=255) gcgttggcgCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCGGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTc < 7:20581/136‑1 (MQ=255) gcgttggcgCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTc < 7:414814/136‑1 (MQ=255) gcgttggcgCGCATGACTTTAGCTCCGGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCATGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTc < 8:373531/136‑1 (MQ=255) ggttggcgCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTc < 1:443011/134‑1 (MQ=255) cgttggctCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTc < 2:279605/135‑1 (MQ=255) cgttggcgCGCCTGACTTTATCTGCTGCGGGCGCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGTATCATGAAGTCAGTAGATTc < 1:3627/135‑1 (MQ=255) cgttggcgCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTTCCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTc < 1:383622/135‑1 (MQ=255) cgttggcgCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTc < 3:206847/135‑1 (MQ=255) cgttggcgCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTc < 1:108915/135‑1 (MQ=255) cgttggcgCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTc < 3:415013/135‑1 (MQ=255) cgcgcCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCCGCCCGGCCCCGGTTGGCTTATCG‑TTTTACGCCCGGTGTGGCCAAGCCCCGCCGGTGGGGGGGGCCCGAAGGTTGGAATAAAGAACTCAGTAGATTCAAGAgg > 2:3967/1‑135 (MQ=255) cgcCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTCAAGAGGtt < 1:36883/135‑1 (MQ=255) gcTGTCTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTCAAGAGGTTTa < 3:417174/134‑1 (MQ=255) ccTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGTAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTCAAGAGGTTTaa < 8:254396/136‑1 (MQ=255) cTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTCAAGAGGTTTaa < 1:430021/135‑1 (MQ=255) cTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTCAAGAGGTTTaa < 4:237961/135‑1 (MQ=255) cTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTCAAGAGGTTTaa < 4:287250/135‑1 (MQ=255) cTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCTGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTCAAGAGGTTTAACAcc < 3:426606/135‑1 (MQ=255) cTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTCAAGAGGTTTAaca < 4:327826/133‑1 (MQ=255) cTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTCAAGAGGTTTAACACCa < 8:141172/136‑1 (MQ=255) ccGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTCAAGAGGTTTAACACCATGTTACtgatga < 7:85108/136‑1 (MQ=255) tCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTCAAGAGGTTTAACACCATGTTACTGATGATCGACAATTACGACTc < 3:110896/135‑1 (MQ=255) cGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCGCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTCAAGAGGTTTAACACCATGTTACTGATGATCGACAATTACGACTCATTc < 2:67091/135‑1 (MQ=255) | TGCCGGGACGTATGAGCGAGACCTATCCTGTGTTGATCGTCAGCAAACTCTTGATGCGCGTAATCAAGG‑CCCACGCCCGTTGGCGTTGGCGCGCCTGACTTTATCTCCTGCCGGCCCG‑CCCGGCCCGTCCCCGTTTGCCTTCTCG‑TTTACCGCCCGTTGTGGCAAAGCCGCGCCTGTGGCTGGTGCCGGAAGGTTCGAATCATGAAGTCAGTAGATTCAAGAGGTTTAACACCATGTTACTGATGATCGACAATTACGACTCATTC > ACB122/502195‑502460 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |