| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | ACB143 | 1,310,041 | (C)5→6 | coding (406/1989 nt) | aaeB_2 → | p‑hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB143 | 1,310,036 | 1 | . | C | 96.1% | 295.4 / 3.8 | 77 | coding (401/1989 nt) | aaeB_2 | p‑hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/1); new base C (36/38); total (38/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.15e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.64e-01 | |||||||||||
CTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCA‑CCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGAGCAGCAACTGGGCGGGCAGGCG > ACB143/1309903‑1310163 | cTGTTTCTGCTTACCTTTGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCAACCATTTGCGCAGCGCATGGGCATATGCCATCGTGATGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCCCCTTTCCGGCCATTGa‑cca‑cc > 4:88857/1‑136 (MQ=255)cTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGa‑cca‑cc < 3:131679/136‑1 (MQ=255) tCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCA‑cccccc < 4:89896/135‑2 (MQ=255) cTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCA‑cccccctg > 2:278704/1‑133 (MQ=255) cTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCAGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTAt > 3:239652/1‑135 (MQ=255) ggCGCTTTGGCTTGAGCTGTGTACCGCATAGTCCACCCAGGTGCGCAGCGCCTGGTCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGTCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGTCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTct < 6:229153/135‑2 (MQ=255) cTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAg < 2:118781/136‑1 (MQ=255) ggctggcGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGcc < 2:246584/135‑1 (MQ=255) ggctggcGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGcc < 6:235823/135‑1 (MQ=255) ggctggcGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGcc < 1:38945/135‑1 (MQ=255) ctggcGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTg < 2:111414/136‑1 (MQ=255) ctggcGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTg > 1:232489/1‑136 (MQ=255) gcgcTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGc < 5:344411/135‑1 (MQ=255) gcgcTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGc < 2:176270/135‑1 (MQ=255) gcgcTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGc < 1:83742/135‑1 (MQ=255) tgtACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTg < 1:108562/135‑1 (MQ=255) aCCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTAcc > 6:192757/1‑136 (MQ=255) aCCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTAcc > 2:149121/1‑136 (MQ=255) ccGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTAcc < 2:232489/135‑1 (MQ=255) aGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCgaga > 6:288978/1‑135 (MQ=255) cGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCt > 8:146064/1‑136 (MQ=255) cGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCt < 4:345341/136‑1 (MQ=255) cGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCt < 1:43824/136‑1 (MQ=255) cGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCt < 7:188923/136‑1 (MQ=255) cGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCt < 7:289234/136‑1 (MQ=255) cGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCt < 8:237174/136‑1 (MQ=255) cGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCt < 7:117967/136‑1 (MQ=255) cGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCGCGCTGTACCGAGATCt < 3:12194/136‑1 (MQ=255) cGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGACTCGCTGTACCGAGATCt < 7:57352/136‑1 (MQ=255) cGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCA‑CCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTg > 2:68938/1‑136 (MQ=255) ccACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGcc > 1:56628/1‑136 (MQ=255) ccACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGcc > 7:317730/1‑136 (MQ=255) ccACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGcc > 3:189931/1‑136 (MQ=255) ccACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCAATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACAAGGCCGTGGCTCGCTGTACCgagaacagc > 1:125567/1‑130 (MQ=255) aCCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTg > 5:192835/1‑136 (MQ=255) aCCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTg > 7:278040/1‑136 (MQ=255) aCCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTg > 2:302096/1‑136 (MQ=255) aCCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTg > 1:303488/1‑136 (MQ=255) gTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTAt < 7:46902/136‑1 (MQ=255) aGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCtgt > 6:149764/1‑136 (MQ=255) cgcCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCtgtg > 6:55291/1‑135 (MQ=255) cTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCaa > 7:96244/1‑135 (MQ=255) gggCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAAcag > 2:354436/1‑136 (MQ=255) ggCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAAcagc < 1:222524/136‑1 (MQ=255) ccTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAAcagcca < 7:330457/136‑1 (MQ=255) ccTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAAcagcca < 5:288978/136‑1 (MQ=255) ccTATGCCGTCGTGCTGGCCGGCTTCACCGGAGCGATCATCGCCGTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAAcagcca < 2:276072/136‑1 (MQ=255) tGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCcagcag > 5:15907/1‑136 (MQ=255) gCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGc > 2:170881/1‑106 (MQ=255) gCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGc < 1:170881/106‑1 (MQ=255) cctgattGCTGGCCTGCTACACCTAAGCGATCATCGACTTGCCGGCCATTTACCCC‑CCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCTTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGACTGGGTATTTTCTGTTCAAAAGCCAGCAGt < 3:112403/129‑1 (MQ=255) ccTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGt < 1:231132/135‑1 (MQ=255) ccTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGt < 2:56628/135‑1 (MQ=255) ccTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGt < 1:29642/135‑1 (MQ=255) ccTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGt < 5:218068/135‑1 (MQ=255) ccTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGt < 5:185780/135‑1 (MQ=255) ccTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTg > 3:78799/1‑136 (MQ=255) cTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGc > 7:63296/1‑136 (MQ=255) cTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGc > 7:148371/1‑136 (MQ=255) cTTCGTGCTGGCCGGCTACAACGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTAATCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGGACCGAGATCTGCCTGGGTAATTACTGTGCAACAGCCAGCAGTGc > 4:185893/1‑136 (MQ=255) tGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGc > 8:110900/1‑136 (MQ=255) tGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGc > 7:281612/1‑136 (MQ=255) gCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTAt > 1:252350/1‑106 (MQ=255) gCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTAt < 2:252350/106‑1 (MQ=255) gCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGct > 6:84206/1‑136 (MQ=255) gCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGct > 1:82558/1‑136 (MQ=255) gCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCA‑CCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGctc > 7:302433/1‑136 (MQ=255) cTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGctc < 7:156647/136‑1 (MQ=255) cGGCTACACCGCCGCGATCCTCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTAGTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGAGCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGcc < 8:308853/136‑1 (MQ=255) cGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGcc < 4:176304/136‑1 (MQ=255) cacCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCg > 5:134399/1‑136 (MQ=255) cacCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCg > 8:260298/1‑136 (MQ=255) gCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTc < 8:112619/136‑1 (MQ=255) aGCGAGCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTCTTCGCCCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTc < 8:100878/134‑1 (MQ=255) gATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGag > 3:48552/1‑134 (MQ=255) atcatcGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGCGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGagcag < 1:260712/136‑1 (MQ=255) tcatcGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCGGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGAGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGagcag > 8:132298/1‑135 (MQ=255) atcGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGAGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGAGCAGCaa > 3:261645/1‑136 (MQ=255) cGGCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGAGCAGCAACTgggcgggc < 1:274828/136‑1 (MQ=255) ggCCATTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGAGCAGCAACGgggcggg > 1:128998/1‑134 (MQ=255) aTTGA‑CCACCCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGAGCAGCAACTGGGCGGGCAGgcg > 7:30353/1‑136 (MQ=255) | CTGTTTCTGCTTACCTTGGCGCTTTGGCTGGCGCTGTGTACCGCAGCGTCCACCCAGTTGCGCAGCGCCTGGGCCTATGCCTTCGTGCTGGCCGGCTACACCGCAGCGATCATCGCCTTGCCGGCCATTGA‑CCA‑CCCCCTGCAAGTATTCGACCAGGCCGTGGCTCGCTGTACCGAGATCTGCCTGGGTATTTTCTGTGCAACAGCCAGCAGTGCCTTGCTCTGGCCCATGCGGGTCGAGCAGCAACTGGGCGGGCAGGCG > ACB143/1309903‑1310163 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |