| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | ACB143 | 4,788,943 | T→G | 8.6% | S228R (AGC→CGC) | dat ← | Diaminobutyrate‑‑2‑oxoglutarateaminotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB143 | 4,788,943 | 0 | T | G | 8.6% | 750.5 / 3.0 | 349 | S228R (AGC→CGC) | dat | Diaminobutyrate‑‑2‑oxoglutarateaminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (171/128); new base G (39/2); total (219/130) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.96e-07 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 351 total aligned reads displayed.
GTCGACGATCAACGCCACGCCCGCCTGCTCGGTAATGCGCCGCACGCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTAAGGCATGAACTGCACGCCGTTGCCGAGCAAGGCCCC > ACB143/4788809‑4789075 | cgacgaTCAACGCCACGCCCGCCTGCTCGGTAATGCGCCGCACGCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTc > 6:346228/1‑136 (MQ=255) cgacgaTCAACGCCACGCCCGCCTGCTCGGTAATGCGCCGCACGCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCGTTc > 4:66632/1‑136 (MQ=255) gacgaTCAACGCCACGCCCGCCTGCTCGGTAATGCGCCGCACGCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTcc > 4:397457/1‑136 (MQ=255) gacgaTCAACGCCACGCCCGCCTGCTCGGTAATGCGCCGCACGCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTcc < 8:311380/136‑1 (MQ=255) gacgaTCAACGCCACGCCCGCCTGCTCGGTAATGCGCCGCACGCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTcc > 1:350911/1‑136 (MQ=255) acgaTCAACGCCACGCCCGCCTGCTCGGTAATGCGCCGCACGCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCg < 2:293630/136‑1 (MQ=255) aTCAACGCCACGCCCGCCTGCTCGGTAATGCGCCGCACGCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCGTTCCGGAt > 1:362763/1‑136 (MQ=255) ccccgcccgcgTGCTCGTTAATGCGCCGCACGCCTTTGTCCAATTCGATGGCGGCCGCAACCACCCCGCCCCCACCCTCCACCACTTCGAGGATCCCGGCGGGGGGCTGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGagcag < 4:225507/133‑1 (MQ=255) cccgccTGCTCGGTAATGCGCCGCACGCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCCCCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGt < 7:240723/136‑1 (MQ=255) cccgccGGCTCGGTAATGCGCCGCACGCCATTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGt < 8:353617/136‑1 (MQ=255) ccgccTGCTCGGTAATGCGCCGCACGCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGtt > 7:187332/1‑136 (MQ=255) gCTCGGTAATGCGCCGCACGCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCCCG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAg > 3:67453/1‑136 (MQ=255) aTGCGCCGCAGGCCGTTTTGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCGCTCACCGTGAACCACTTCGATGATCACGGCGGCGTGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGc < 2:321123/135‑1 (MQ=255) aTGCGCCGCACGCCCTTGAGCAATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCa < 1:289196/136‑1 (MQ=255) aTGCGCCGAACGCCTTTCAGCCATTCGATGTCGGCGGTAACCACCCCGCCCTCACCTTGAACCAGTTGGTGTTGCACGGGGGGGGGCTGCGGCAGG‑GCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCa < 3:290844/136‑1 (MQ=255) gccgcACGCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCCCG‑CCGCTTTACGGCTCGAGCAGCAGGTTTTGCAGGGAATGCAGGtt > 3:53096/1‑136 (MQ=255) cgcACGCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCCCG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGGTTTCCAGGTAATGCAGGTTgg > 2:134717/1‑136 (MQ=255) cgcACGCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCCCG‑CCGCGTTCCGGCTCGAGCCGCAGGTTTTGCAGGTAATGCAGGTTgg > 3:215696/1‑136 (MQ=255) aCGCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCt > 6:76347/1‑136 (MQ=255) aCGCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCt > 3:306901/1‑136 (MQ=255) aCGCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCt > 7:268278/1‑136 (MQ=255) aCGCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGAGCGAGCAGCAGGTTTTACAGGTAATGCAGGTTGGCCt > 1:309959/1‑136 (MQ=255) gCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCCCCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCCGCCCG‑CCGCTTTCGGGATCGAGCAGCAGGTGTTCCAGGTAATTAAGGTTGGCCtt > 7:255228/1‑135 (MQ=255) gCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCCCG‑CCGCTTTGCGGATCGTGCAGCAGGGTTTGCAGGTAATGCCGGTTgggcgtg > 1:185238/1‑131 (MQ=255) gCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGCTCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCtt > 7:74990/1‑135 (MQ=255) gCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGCTCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCtt > 3:358142/1‑135 (MQ=255) gCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCtt > 2:230353/1‑135 (MQ=255) gCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCtt > 1:108074/1‑135 (MQ=255) gCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGGTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTg > 4:281257/1‑136 (MQ=255) gCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTCCACCACTTCGAGGATCACGGAGCCGGGCACCCGCCCGCCCGTTTGCCGGA‑AGGGCAGCAGGTTTTGCATGTAATTCAAGTTgggcatg > 2:398669/1‑131 (MQ=255) tGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCCGCACG‑CCGCATTCCGGTACGAGCAGCAGCGTTTCCAGGTAAAGCACGTTGGCCTTTAcccc > 5:58954/1‑136 (MQ=255) ccaggcGATGTCGGCCGTAAGCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCCCGGCGGCGGGCAGCGGCAAG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGcc < 7:110652/131‑1 (MQ=255) ccATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGcc < 2:268794/136‑1 (MQ=255) cATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCCGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCt > 7:89988/1‑136 (MQ=255) gATGTCGGCCGTACCCACCCCGCCCTCACCCTGCCCCCCTTCGTGGACCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CGGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCAcc < 5:94597/135‑1 (MQ=255) gATGTCGGCCGGACCCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCGTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCg > 4:355562/1‑136 (MQ=255) gATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGTTCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCg > 4:250456/1‑136 (MQ=255) gATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCCCG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCg > 2:10870/1‑136 (MQ=255) gATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCCCG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGGAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCg > 7:212853/1‑136 (MQ=255) gATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCCCG‑CCGCGTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTGCAGGTAATTCAGGTTGGCCTTGAACCCGGCCTCAccc > 5:337358/1‑135 (MQ=255) gATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCCCG‑CCGCAGTGCCGATCGAGCACCACGTTTTGCATGGAATGCAGGTTGGGCTTGGCCCCCGCCTCAccc > 6:228876/1‑135 (MQ=255) gATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGTTCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGGAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCg > 1:37716/1‑136 (MQ=255) gATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCg > 6:154341/1‑136 (MQ=255) gATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCGTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCg > 1:248633/1‑136 (MQ=255) gATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCCCGTTGCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCCCCg > 4:196156/1‑136 (MQ=255) gATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCCCGTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTACAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCg > 2:164802/1‑136 (MQ=255) 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ggAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCGGTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCCGGCCg > 3:115686/1‑135 (MQ=255) ggAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCCCAGTGCGGATCGAGCAGCAGGTTTTGCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGccca > 8:161138/1‑134 (MQ=255) caccCCGCCCTCACCCTCCCCCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACggg < 7:365798/136‑1 (MQ=255) cccGCCCTCACCCTGCCCCCCTGCGCGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAg < 4:110504/136‑1 (MQ=255) ccGCCCTCACCCTGCACCCCTTCGCGGAGCCCGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGc < 8:254553/136‑1 (MQ=255) ccGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGTAGCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGc < 6:380228/136‑1 (MQ=255) cTCCCCCTGCACCACTTCGAGGAGCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAg < 5:148736/136‑1 (MQ=255) cccccTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTc < 3:397457/134‑1 (MQ=255) cACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTc < 6:163067/136‑1 (MQ=255) ccccTCCCCCACTCCGCGGAGCCCGGCGGCGGGCCGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGt < 3:33284/133‑1 (MQ=255) aCCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCCCG‑CCGCTTTCCGGATCGCGCAGCAGGGTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCCAACGGGCAGCGGGTGTCg > 5:249091/1‑136 (MQ=255) aCCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTc < 2:7458/135‑1 (MQ=255) 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cacTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCCCG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCCGGCCGAACGGGCCGCGGTAGTCGTA‑CGGGTaa > 5:279333/1‑136 (MQ=255) cacTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGt > 6:265145/1‑134 (MQ=255) cacTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGt > 1:212865/1‑134 (MQ=255) cacTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGt > 5:195602/1‑134 (MQ=255) cacTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGt > 5:175974/1‑134 (MQ=255) cacTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTaa < 1:230353/136‑1 (MQ=255) cacTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCACGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGt > 2:253516/1‑134 (MQ=255) ttCGAGGATCCCGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTAAGGc < 5:353179/136‑1 (MQ=255) ttCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTAAgg > 5:109375/1‑135 (MQ=255) tCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCCCC‑CCGCATTACGGATCGAGCAGCAGGTTTTGCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTAAggg > 6:19015/1‑134 (MQ=255) tCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCCGGCCGCACGGGCAGCGGTAGGCGTA‑CGGGTAAGGCa > 8:187717/1‑136 (MQ=255) tCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTAAGGCa > 4:174850/1‑136 (MQ=255) tCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGACTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAAAGGCCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTAAGGCa > 4:343653/1‑136 (MQ=255) cGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGt < 8:74720/54‑1 (MQ=255) cGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTAAGGCAt > 3:247987/1‑136 (MQ=255) cGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTAAGGCAt > 2:93785/1‑136 (MQ=255) cGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCATGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTAAGGCAt > 3:152935/1‑136 (MQ=255) cGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGCCACG‑CCGCATAACGGAACGACCACCCGGTTTTCCAGGTAATGCCAGTTGGCCATGACCCCCGCCGAACCGCCCACGCCGCAACCGCACCGGTAATAGTA‑CCGGTAAAGCaa > 2:190980/1‑135 (MQ=255) gAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTc < 5:295524/120‑1 (MQ=255) gAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTc > 6:295524/1‑120 (MQ=255) gAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTAAGGCAt > 7:134222/1‑135 (MQ=255) cacccgggggcggGCAGGGCCCCG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTAAGGCATGAACt < 2:354510/132‑1 (MQ=255) ggcggcggGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTAAGGCATGAACTGCACg < 6:809/136‑1 (MQ=255) gcggcggGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTAAGGCATGAACTGCACGc > 2:62162/1‑136 (MQ=255) gcggcggGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTAAGGCATGAACTGCACGc > 8:14696/1‑136 (MQ=255) gCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCCGGCCGAACGGGCAGCGGGAGTCGTA‑CGGGTAAGGCATGAACTGCACGCCGTTGcc > 7:332285/1‑136 (MQ=255) aGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTAAGGCATGAACTGCACGCCGTTGCCGa < 6:116977/136‑1 (MQ=255) aGCGGCACG‑CCGCGTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTAAGGCATGAACTGCACGCCGTTGCCGa > 2:371414/1‑136 (MQ=255) ggaccg‑ccgcTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTAAGGCATGAACTGCACGCCGTTGCCGAGCa < 8:213321/132‑1 (MQ=255) cgcTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTAAGGCATGAACTGCACGCCGTTGCCGAGCAAGGcccc > 4:143452/1‑136 (MQ=255) | GTCGACGATCAACGCCACGCCCGCCTGCTCGGTAATGCGCCGCACGCCCTTGAGCCATTCGATGTCGGCCGGAACCACCCCGCCCTCACCCTGCACCACTTCGAGGATCACGGCGGCGGGCAGCGGCACG‑CCGCTTTCCGGATCGAGCAGCAGGTTTTCCAGGTAATGCAGGTTGGCCTTGACCCCGGCCTCACCGCCCAGGCCGAACGGGCAGCGGTAGTCGTA‑CGGGTAAGGCATGAACTGCACGCCGTTGCCGAGCAAGGCCCC > ACB143/4788809‑4789075 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |