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tCGCATGGCGGGCGGGGGGGGCGG‑T‑T‑‑GGCG‑G‑G‑GTTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCg < 5:196628/135‑1 (MQ=14) gcGCACGGCCGGCGGGGGCGGCCT‑T‑T‑‑GGAG‑G‑G‑GGTTAACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCg < 6:122572/134‑1 (MQ=17) cGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGCG‑G‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCgg < 6:358066/135‑1 (MQ=255) cGCAAGGCCTGCGCGGGCGGCGG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCgg < 5:179880/135‑1 (MQ=255) catggCCGGCGGGGTGGGCCG‑T‑T‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCggggg < 2:6294/133‑1 (MQ=17) cacggCCGGCGGGGGCGGCGG‑A‑A‑‑GTTG‑G‑G‑GGTTACCCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCggggg < 4:41124/133‑1 (MQ=17) cAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCggggg < 1:233371/136‑1 (MQ=255) tggCCTGCGGGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGTG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTg < 2:245645/135‑1 (MQ=255) cgggcTGCGCGGTGGGCCG‑T‑A‑‑GGCG‑G‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTg < 5:127484/132‑1 (MQ=255) aGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTg < 1:248870/136‑1 (MQ=255) ggCCTGCGCGGGCGGCCT‑T‑T‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTgg < 6:161160/136‑1 (MQ=255) gcccTGCGGGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GCAG‑G‑G‑GTTTAACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTgg < 1:214868/134‑1 (MQ=17) gggcgGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGCG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGaca < 3:246591/134‑1 (MQ=255) cgcgGACGGCCG‑T‑A‑‑GTAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGaca < 5:68428/135‑1 (MQ=255) gggTGGGCGG‑T‑A‑‑GCCG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACAt < 2:245430/135‑1 (MQ=255) gggTCGGCGG‑A‑A‑‑GTCG‑G‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACAt < 2:75684/135‑1 (MQ=17) gggTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GTTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACAt < 2:111005/135‑1 (MQ=255) cgGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACAt < 8:33648/136‑1 (MQ=255) ggTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTAt > 7:374611/1‑90 (MQ=255) ggTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTAt < 8:374611/90‑1 (MQ=255) gggCGG‑T‑A‑‑GGTG‑C‑G‑GTTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGTGTGGAGACACATTggg < 2:100838/135‑2 (MQ=17) | CGCCGTGAAGCAGGCGACGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCG‑T‑A‑‑GGAG‑C‑G‑GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGG‑ACCTGC‑TGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACATTGGT > ACB143/4805099‑4805362 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |