| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | KT2440 | 4,291,840 | T→G | 30.4% | intergenic (‑142/‑20) | sdhL ← / → CJ019_04025 | Shikimate dehydrogenase‑like protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | KT2440 | 4,291,840 | 0 | T | G | 30.4% | 67.1 / 7.0 | 69 | intergenic (‑142/‑20) | sdhL/CJ019_04025 | Shikimate dehydrogenase‑like protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (16/30); new base G (21/2); total (37/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.10e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGG > KT2440/4291716‑4291975 | tGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCg < 7:211740/134‑1 (MQ=255) gACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAg < 7:151650/135‑1 (MQ=255) gACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGTTTGCGGCGAg > 5:61807/1‑135 (MQ=255) cTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTACTGCGAGgt > 8:313757/1‑135 (MQ=255) gAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGTTTTCGGGGGGgttg > 5:366632/1‑135 (MQ=255) gAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGTTTGCTGCGAGggtgt > 4:132111/1‑136 (MQ=255) gTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTAt < 3:292147/136‑1 (MQ=255) gTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTAt < 4:342076/136‑1 (MQ=255) aaCAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACCACCATTACCGTTCCCCTGTCCTCAGCTGACAGCGGCCGGAGTCATAGTAACAGGCCCCCCGACGT‑GGGGTGTTCCGTCGTGGTTGTTTTATGGACCgggacat > 7:197491/1‑129 (MQ=255) aaCAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCAt > 3:307582/1‑135 (MQ=255) aaCAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCAt < 7:220588/135‑1 (MQ=255) aCAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGTTTTCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCCGCTCAtt > 7:36177/1‑135 (MQ=255) agTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCgg > 4:164314/1‑136 (MQ=255) cAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGACCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTACTGCGTGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCCGaaa > 4:159153/1‑135 (MQ=255) tccAATGGTAGTCCCTTACAAAACATTAACCTTTCCCATGTGATCAGCTGACAGAGTCCGGAGTAATAGTAACAGTGCCCGGGACGT‑GGGGTTTTCCTTCTAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCTGAATc < 2:132005/134‑1 (MQ=255) gCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTGTTTCTGCGCGGGTGTTTTTTTCAACGTCTGGTTCCCgcacag > 2:47206/1‑130 (MQ=255) gCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGTTTGCTGCGGGGTTGTTTTTTTTACCGTCGGATTACCgggaacg > 3:20056/1‑131 (MQ=255) cACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTGCTGGGCGGTTGTTTTATGAAACGTATCATTACCGGAATCGtg > 4:336618/1‑135 (MQ=255) aCTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTc < 5:131908/135‑1 (MQ=255) aCTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGTTTACATCGAGGGTGTTTTATTAAACCTCTCAATACCGGAAtactcc > 3:357272/1‑131 (MQ=255) aCTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGGGTGCTGCGGGGGTGTTTTTTGAACCCGCGCCTTCCCGGCATCggc > 1:216767/1‑133 (MQ=255) aCTGGTCGTACCTTACACAACCTTTACCTTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCAGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTAGCTGCGAGGTTGTTTTATGATCCGTCTCATTCCCGGAATCGTc < 2:58571/135‑1 (MQ=255) gtcCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGTTTCCAGGGAGGGTGTTTTATGAAACCGCTCAGTACCGGCATCGGCCGGCTgg > 7:311370/1‑135 (MQ=255) ttACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGt < 1:160568/135‑1 (MQ=255) acaACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGTTTACTGCGAGGGTGGTTTAATAACCCGCTCAATTCCCGCATCGTCCTGCGGGTCGGTGccc > 7:21688/1‑135 (MQ=255) caACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTg < 4:179814/136‑1 (MQ=255) aaCCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCCGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGG‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTGGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGGCGGTGCCCTg < 5:203348/135‑1 (MQ=255) cTTTACCGTTCCCCTGTGATCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTTATGCGAGGTTGTTTTATGAAACGTCAGATTACCCGCATCGTACATCTGGTGGGTGCCCAGGcc > 4:110575/1‑135 (MQ=255) ttACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGTTTGGTGCGAGGTTGTTTTTTGTTCCGTCGAATTACCGGAATCGTCCTGCTGGTGGGTGGCCTGGCCa > 2:194097/1‑134 (MQ=255) ttACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGGTTGCTGGGAGGTTGGGTTATTAACCGTCGCATTCCCCGAATCGTCCGGCGGGTGGGTGCCCGGGccga > 7:352823/1‑133 (MQ=255) aCCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATc < 7:267036/134‑1 (MQ=255) ttCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCgg < 8:72166/135‑1 (MQ=255) ccccTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTGAGGCGAGGTTTTTTTTTGTTCAGTCTTAATGGACGAATCGTCAGGGAGGGCGGTGGCCTGGGCATCAGCGGGc > 2:124063/1‑135 (MQ=255) ccccTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGTTTCCAGCGAGGTTGTTTTATGAAACCGCGCATTCCCCGAATACTCCTGCTGGTAGGTGCCCGGGCCCTCAGCCGGcc > 4:162171/1‑136 (MQ=255) ccTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGGTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGccg > 7:22424/1‑134 (MQ=255) ccTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGTTTGGTGCGAGGTTGTTTTTTTAAACGTCGCATTCCCCGACAAGTCCGGCTGGTCGGTGGCCGGGCCCGCAGCggggcg > 1:367363/1‑132 (MQ=255) cTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGCATCGTCCTTCGGGTCGGTGGCCTGGGCCTAAGCGGGCCTg > 6:181782/1‑135 (MQ=255) cTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGTTTGCTGCGAGGGTTTTTTTTTAAAAGTGTCATTACCGGCATCCTCCATCGGGTGGGTGGCCAGGCCATCAGCGGGCCGgc > 4:321864/1‑136 (MQ=255) cTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGTTTCCAGGGAGGTTGTTTTTTTAACCGGGTGAATACCGGCATAGTCCTGCTGGTCGGTGGCCGCGCCCTCAACGGGCCt > 8:305964/1‑134 (MQ=255) tgCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTgca < 4:307582/134‑1 (MQ=255) tGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGTTTTCTGCGAGGTTGTTTTTTTAAACGTCTCATTCCCGGCATCGTACTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCCTCACCCGGCCTGCagccgccccc > 1:223821/1‑131 (MQ=255) aCAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGTGGGGGGTTGCTTGGGGGGTTG‑TTTATGAAACGTCTCAATACCGGCAACGGGATGAGGGGCGGTGCCCAGGCCCAGACCGGGCCGGCCGCACCGCAcgg > 6:32287/1‑135 (MQ=255) gagGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGTTTACTGCGAGGTTTTTTTATTAACCGTCTGATTCCCGGTATCGTCCTGGTGGTCGGTGCCCTTGCCATCCGCCGGCCTGCAGCAGCGCAaggcggg > 4:357361/1‑135 (MQ=255) ggCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTTTTTTATTAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTTCCCGGGCCATCAGCGGGCCGGCAGCCGCGCACGGCGGCt > 8:12131/1‑135 (MQ=255) ggCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGACTCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCt < 1:321183/135‑1 (MQ=255) gAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTGCGTCGAGGGTGTTTTATGAACCGTCTCATTGCCGGCATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATggc > 2:290585/1‑135 (MQ=255) gAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGGTGTTTTTTTAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCCTCAGCGGGCCGGCAGCAGCGCCCCGCGGCTATggc > 2:221376/1‑135 (MQ=255) gAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGTTTGCTGGGAGGGTGTTTTTTTATCCGTCTCCTTGCCGGCATCGTGCTGCGGGTCGGTGGCCGGGGCCTCAGCGGGCCGGCAGCAGCGCCCGGCGGCGTTggc > 2:290187/1‑135 (MQ=255) gAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGTTTGCGGCGAGGTTGTTTTTTGAACCGTCTCATTCCCGGCATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCGGCCGCAGCGCCCGGCGGCGATggc > 7:67407/1‑135 (MQ=255) gacagtAGGAACAGGGCCCCGGACGG‑GGGGGTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATggcg < 5:244144/130‑1 (MQ=255) aGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATggcg < 7:53599/135‑1 (MQ=255) tcaCAGGGCCCCGGACGG‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAACAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATgg < 2:160673/132‑1 (MQ=255) tAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATgg < 1:221376/134‑1 (MQ=255) tAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATgg < 2:170110/134‑1 (MQ=255) tAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGGTTTGGTGCGCGGGTGTTTTTTTTACCGGCTGATTGCCGGAATCGTCCGGCGGGTGGGGGGCCGGGGCCGCCGCGGGGCGGCCGCAGCCCCCGGCGGCGATGGCGGCCagcgg > 2:321183/1‑131 (MQ=255) gtgCCGCGGAGGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATTAACCGTCTCATTCCCGGTATCGTCGTGGTGGTCGGTGCCCTGGCCATGAGGGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCAtggt < 4:228990/134‑1 (MQ=255) gggCCCCGGACGT‑GTGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCAtgg < 1:348883/135‑1 (MQ=255) gggCCCCGGACGT‑GGGGTTTTGCTGCGAGGGTGTTTTATGAACCGTCTCAATGCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCCGGAGCGGGCCTGCCGCAGCGCCCCGCGGCGAGGGCGGCCAGGGGCAtgg > 6:333071/1‑135 (MQ=255) gggCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCAtgg < 5:181782/135‑1 (MQ=255) gggCCCCGGACGT‑GGGGGTTTCCTGCGAGGTTGATTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCAtggt < 4:109928/136‑1 (MQ=255) cGGACGT‑GGGGTTTTCATGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGtggttg < 6:295173/135‑1 (MQ=255) ggggTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGGCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGc < 3:162171/136‑1 (MQ=255) ggTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGc < 1:124063/134‑1 (MQ=255) ggTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCg < 3:159153/136‑1 (MQ=255) ggTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCg < 3:172705/136‑1 (MQ=255) gTTTTCCTGCGTGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCTGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACTGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCgg < 4:107602/136‑1 (MQ=255) gTTTTCCTGCGAGGTTCTTTTATGAACCGTCTCATTCCCTGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCgg < 3:357361/136‑1 (MQ=255) gTTTTACTGCGAGGTTGTTTTATTAAACCTATAAATACCCGTATCGTGCAGCGGGTCCGTGCACAGGCCATCACCGTGGCTGCCGCAGCCCACCGCGGCGCGGGCGGGGCAGGGCCTGGTGGTGGGTTTGGGGCg > 6:143802/1‑135 (MQ=255) gTTGTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCATCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCGATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCg < 5:30106/135‑1 (MQ=255) ttttCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCgg < 1:290187/135‑1 (MQ=255) ttttCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCgg < 2:223821/135‑1 (MQ=255) ttttCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGGCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCgg < 8:311370/135‑1 (MQ=255) ttttACAGCGAGGTTGTTTTATTAACCGTCTCATTACCGGAATCGTCCAGCTGGTCGGTGCCCTGGCCAGCAGCCGGCCTGCAGCAGCGCACCGCCGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCggg > 4:134443/1‑136 (MQ=255) | TGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGGGCCCCGGACGT‑GGGGTTTTCCTGCGAGGTTGTTTTATGAACCGTCTCATTCCCGGAATCGTCCTGCTGGTCGGTGCCCTGGCCATCAGCGGGCCTGCAGCAGCGCACGGCGGCTATGGCGGCCATGGGCATGGTGGTTGGTATGGGCCGGG > KT2440/4291716‑4291975 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |