| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | KT2440 | 3,973,794 | 0 | A | C | 45.7% | 82.2 / 31.1 | 81 | L161R (CTG→CGG) | cobN | Aerobic cobaltochelatase subunit CobN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (9/35); new base C (37/0); total (46/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.57e-15 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ACAGCAGCGGTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCA‑GGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGG > KT2440/3973660‑3973921 | cccgcagcGGTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCTGTCCTCGAGTGGCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑GGATAGACCGCCGGGCGCGGCAAAGGCTGGGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCa < 3:50406/132‑1 (MQ=255) agcagcGGTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCAGAGTCGC‑GG‑GCCacc > 6:326316/1‑133 (MQ=255) cagcGGTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCa < 6:97404/135‑1 (MQ=255) cagcGGTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCa < 4:83252/135‑1 (MQ=255) cGGTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑cccatg > 6:93928/1‑131 (MQ=255) cGGTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑CCa > 8:293107/1‑132 (MQ=255) cGGTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCa < 7:293107/132‑1 (MQ=255) gTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑CCCGtggc > 3:117619/1‑135 (MQ=255) gTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑CCAAtggc > 3:233130/1‑135 (MQ=255) gTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCCTtggc > 2:209392/1‑135 (MQ=255) gTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATtggc < 3:320564/135‑1 (MQ=255) gTGCCACTGGCTGCTCGGGGTG‑CAATGTTGGTACCAGTCCTCGAGTGTAGGCCATCCCATGGCGGGGTTGAT‑GACCGCCCTGCGCGGCAAAGGCAGCCGCTCGGACCAAGGATATTAGC‑GG‑CCCCG‑CCATtggcc > 4:282758/1‑134 (MQ=255) ccACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATtggctgg < 7:216439/135‑1 (MQ=255) ctCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCATTCCTCGAGGGTCGCGCTGCCCTTGGGGGTG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CACAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGtt < 2:285826/135‑1 (MQ=255) ctCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGtt < 3:54675/135‑1 (MQ=255) ctCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGtt < 2:275461/135‑1 (MQ=255) ctCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGtt < 5:93928/135‑1 (MQ=255) tCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑CCCCTGGCTGGCCCGGccctag > 4:320564/1‑130 (MQ=255) tCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGtt < 7:223828/134‑1 (MQ=255) ggggTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑CCATTGGGGGGCCAGGccggtgg > 3:225970/1‑128 (MQ=255) ggggTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑CCAGTGGCGGGGCAGGCACtttg > 4:11630/1‑132 (MQ=255) ggggTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑CCAATGGCGGGCCACGccctgga > 7:18225/1‑128 (MQ=255) ggggTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCC‑CCAGTGGCGGGCCAGGCAGTTGaa > 2:279687/1‑135 (MQ=255) gCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGt < 4:205452/135‑1 (MQ=255) gCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGt < 7:208550/135‑1 (MQ=255) ggTACCAGTCCTCGCGTGTGGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGCACAGGTTGATGGCGt < 5:324067/135‑1 (MQ=255) gTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑CCCTTGGCTGGGCAGGGCGTTGCACAGGTTTGTTGCGtt > 2:46292/1‑135 (MQ=255) aCCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑TG‑CCCAG‑GCCATGGGGGGCGCGCCCGGTGGACCGGTTTATGGCGtttg > 2:135161/1‑133 (MQ=255) ccTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCC‑CCATTTGCTGGCCAGGCAGGTGAACAGGTTGATGGCGTTGGGCTTgc > 4:322289/1‑135 (MQ=255) tCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑GCCCG‑CCAATTGCTGGGCCGGCCGTTGGACAGGTTGTTGGCGTTTGCCGTggcc > 7:312897/1‑132 (MQ=255) tCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑GCCCC‑CCCATGGCTGGCCCGGGAGGTGAACAGGTTTTTGGCGTTGGCCTTgccc > 4:30201/1‑134 (MQ=255) tCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCC‑CCATTTGCTTGCCAGGCAGTTGAAAAGGTTGATTGCGTTTGGCTTgccg > 4:80902/1‑135 (MQ=255) tCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTgcc < 7:105936/134‑1 (MQ=255) tCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTgcc < 1:222367/134‑1 (MQ=255) tCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAC‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTTAAGGCGTTGGCCTTgccg > 3:132937/1‑135 (MQ=255) gAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAATGCTGCGGCTCGTCCAAGGAATAGTCGC‑GG‑ACCAG‑CCAATGGCATGCCAGGCAGTTGCACAGAGTGATGGCTTTGGCCTTgcctc > 6:92851/1‑132 (MQ=255) tgtCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTg < 5:198577/135‑1 (MQ=255) tgtCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTg < 5:169715/135‑1 (MQ=255) tgtCGCGCGGCCCTTGGCGGGG‑TGAGAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTg < 7:248315/135‑1 (MQ=255) cgcTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGCGGG‑CCCCC‑CCATGGGGTGGCC‑GGCCGGTGAAAACGTGGCTGGCGGTTGGCGTGGCGCCCGGgcgcc > 6:27241/1‑134 (MQ=255) cgcTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑CCCTTGGGTGGGCCGGCAGTTTCACAGGTTGATGGCGTTGGCCGTGGCGCCCAGgcgcc > 4:51538/1‑134 (MQ=255) cgcTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑CCCATGGCTGGGCAGGGCGGTGGACCGGGTGCTGGCGGTGGGCGTGGCGCCCGGgggcc > 8:334351/1‑134 (MQ=255) tGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑CCCGTGGGGGGGCCGGCCGGTGGACAGGTTGGTGGCGTTGGGCGTGGCGCCCCGGCGCC‑gg > 3:198089/1‑134 (MQ=255) tGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCCTTGGCGGGCCCGGCAGTTGCACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTTCCGCCCTGGCGCA‑gg > 7:202087/1‑134 (MQ=255) ttGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCAATTGGTGGGCCGGGAGTTGGACACGTTGTTTGCGTTGGGCTTTCCGCCCTGGCGCC‑gggtattg > 2:100454/1‑129 (MQ=255) ggg‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCA‑GGTAATGCCAAAGc < 4:318844/135‑1 (MQ=255) g‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCA‑GGTAATGCCAAAGCCg < 3:51538/135‑1 (MQ=255) gATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GGCCCCCC‑CCTTTGGGTGGCCGGGC‑GTTGGACACGTTGATTGCGGTGGGCGTTCCCCCCGGGCGCC‑GGGAATTCCAAAGCCGCt > 6:233451/1‑135 (MQ=255) gATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑GCCCC‑CCCTTGGCTGGCCCCGCAGTTGAACAGGTTTTTGGCGTTTGCCTTGCCGCCCGCGGGCA‑GGGAATGCCAAAGCCGCt > 8:168952/1‑135 (MQ=255) gATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCGCCCATGGGGGGGCCCGGC‑GTTGAACACGTTTGTTGCGGTGGCCGTTGCGCCCGGGCGCAGGGTATTGCCaaaccgcc > 6:274691/1‑130 (MQ=255) gATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑CCCTTGGGGGGCCCGGGCGTTGCACCGGTTGATGGCGGTTGCCTTGCCGCCCGGGCGCA‑GGTAATTCCCAACCCGcg > 3:146927/1‑134 (MQ=255) gATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑CCCGTGGCGGGGCCGGCCGGTGTCCAGGTTGTTTGCGGTGGCCTTGCCGCCCCCGCCCG‑GGGAAATCCCAAGCCGcg > 5:134066/1‑134 (MQ=255) gATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑CCATTTGGTGGGCCGGCCGTTGAACAAGGTGATGGCGTTGGGCGTTCCCCCCAGGCGCC‑GGGAATTCCAAAccccca > 6:235761/1‑132 (MQ=255) gATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCC‑CCCTGGGCTGGCCAGGCAGTTGAAAAGGGTGGTTGCCGGGGCCTTTCCGCCCGGGCGCA‑GGTAATTCCCAACCCGcg > 6:164307/1‑134 (MQ=255) gATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCC‑CCCATGGGGGGGCCGGCCGGTGTACAGGGTGTTGGCGGTTGGCGTGGCGCCCGGGCGCC‑GGGTATGGCCAAGccccg > 5:238995/1‑132 (MQ=255) gATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCC‑CCATTTGCTGGCCCCGCAGGTGAACAGGTTGATGGCGTTGGGCTTGGCCCCCAGGCGCA‑GGTAATTCCCAAGCCGcg > 4:216484/1‑134 (MQ=255) gATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCA‑CCAGAGGCTGGCCCGGCTGGTGAACAGGTTGATGGCGTTGGGCATGCCGCCCGGGGGCA‑GGTAATTCCCAAACCGca > 6:158714/1‑134 (MQ=255) aTAGCCCGCCGGGCGCGGCAAAGGCTGCGGCGCGGCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCA‑GGTAATGCCAAAGCCGCTc < 7:298578/135‑1 (MQ=255) aCCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGGTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCA‑GGTAATGCCAAAGCCGCTCGGc < 1:209392/134‑1 (MQ=255) ccgccgTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑CCATTGGCGGGCCCGGCAGGTGCACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGGCGCCCGGGCGCA‑GGGTATGCCCAAGCCGCTCGGGCt > 4:222508/1‑135 (MQ=255) tGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑GCATTGGCGGGGCCGGCCGTTGTACAGGTTGCTGGCGTTTGGCGTGGCGCCCGGGCGCC‑GGGAATGGCCAAGCCGCGCGGCCTgggccc > 2:39086/1‑130 (MQ=255) tGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑CCCTTGGGTGGGCAGGCAGTTGGACAGGTTGATGGCGTTGGGCGTGCCGCCCGGGCGCC‑GGGAATGGCCAAGCCGCGcggccggcgccc > 3:127466/1‑131 (MQ=255) tGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑CCATTGGCTGGGCCGGCCGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCGTTCCCCCCTGGGGCA‑GGGTATTCCAAAGCCCCGCGGCCAGCTCAc > 8:175569/1‑135 (MQ=255) tGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCC‑CCCGTGGCGGGCCAGGCCGTTGCACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTTCCGCCCTGGCGGC‑GGGTATGCCCAAGCCGCGcggccggcggcc > 3:120208/1‑131 (MQ=255) gtcAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGAATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCA‑GGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCgg < 5:203158/133‑1 (MQ=255) ggCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCA‑GGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCgg < 4:225970/135‑1 (MQ=255) ggCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCA‑GGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCgg < 6:288900/135‑1 (MQ=255) ggCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCA‑GGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCgg < 4:112251/135‑1 (MQ=255) ggCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCA‑GGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCgg < 2:159331/135‑1 (MQ=255) aaGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCA‑GGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGt < 8:13566/135‑1 (MQ=255) 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gCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCA‑GGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGc < 8:36715/135‑1 (MQ=255) gCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAC‑CCCATGGGTGGGCAGGCAGTTGAACATGTTGATTGCGTTGGCCTTGGCGCCCGGGCGCC‑GGTTATGCCAAAACCCCTCCGCCAGCTCACCGCGGGCGGTGCCCCGGc > 6:255890/1‑135 (MQ=255) cTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCCG‑CCCTTGGGTGGCCAGGCAGTTGGACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCA‑GGGAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCCCCGCGGCCGTTGCCCAGGcg > 3:72225/1‑134 (MQ=255) tCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCA‑GGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTg < 4:198089/135‑1 (MQ=255) aGGCTTAGTCGC‑GG‑CGCAT‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGTTGGCTTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCA‑GGTAATGCGAAAGCCGCTCGGCGTGCTCAGCGCGGTCGTTGCCCAGGCTGGTCAGCt < 7:50784/135‑1 (MQ=255) tCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCA‑GGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCtccgggtcc < 4:233130/135‑1 (MQ=255) gc‑gG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCAGGCGCA‑GGTAATGCCCAAGCCGCTCGGCCTGCTCCCCGCGGACGTTGCCCCGGCTGGTCAGCtccgggtccgg > 6:120553/1‑135 (MQ=255) | ACAGCAGCGGTGCCACTGGCTGCTCGGGGTGCCAGTGTGGGTACCAGTCCTCGAGTGTCGCGCTGCCCTTGGCGGGG‑TGATAGACCGCCGTGCGCGGCAAAGGCTGCGGCTCGTCCCAGGCATAGTCGC‑GG‑CCCAG‑CCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCA‑GGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGG > KT2440/3973660‑3973921 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |