| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,228,275 | 0 | T | C | 44.4% | 66.5 / 22.1 | 73 | pseudogene (335/1287 nt) | mdtQ | pseudogene; putative channel/filament proteins |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (26/14); new base C (9/23); total (35/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.28e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTG‑CTCGCGTTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCT > NC_000913/2228135‑2228422 | cTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTAAGCTGCCAGCCAGCAATTGGCCGGGTTG‑CTCGCGGTCCGGCCCCCGTGC‑TTTTACCCAGCCCAGGGGGGCCCT‑TA‑ACCCCGCCCGCtt > 1:198247/1‑151 (MQ=255) ctgcAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCCGCCAGCAATTGGCGGGTTTT‑CTCCCGTTTCGCCCCCCCTGC‑TTTTACCCTACCCAGGCGGGCAGT‑AA‑ACTCCGCCCGGTTC‑TTTcc > 2:533869/1‑150 (MQ=255) tgcAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTTCGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTG‑CTCGCGTTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTcccc < 2:1445565/151‑1 (MQ=255) aCCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTG‑CTCGCGTTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCAATTC‑TTTCCCCAGat‑at < 1:872942/151‑1 (MQ=255) aCCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTT‑CTCGCCTTCCGCCCCCCCTGC‑TTTTACCCTACCCCGGCCGGCAGT‑AA‑CCCCCCCCCCCTTC‑TTTccccccctat > 1:465954/1‑145 (MQ=255) tgtTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCGGCCAGCAATTGGCGCGTTTG‑CTCGCGTTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCg‑ag < 1:1154652/151‑1 (MQ=255) gtTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATGGGCGGGTTTG‑CTCGCGTTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAGG‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TGTCCCCAGAT‑CTCg‑ag < 1:493921/150‑1 (MQ=255) cgccgcCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTG‑CTCGCGTTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAg < 2:1113580/151‑1 (MQ=255) tGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTG‑CTCGCGTTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCccgccg < 2:674864/151‑1 (MQ=255) tGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCCGCCAGCCAGCAATTGGCGGGCTTG‑CTCGCGTTTCCCCGCCCCGGC‑GTTTACCCGCCCCAGGCGCGGGGTGAA‑CCCCCCCCCAATAT‑TTTCCCC‑CAT‑CTCG‑GG‑ATG‑CCCGCCCCCCC‑ttttg > 1:113248/1‑147 (MQ=255) cTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTT‑GTCCCGCCCCGCCGCCCCGGCTTTTAACCG‑ACCCCCGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCCCCCGGTTC‑TTTCCCCCGAT‑ATCC‑AG‑ATGCCCAGCCCCCGT‑TTAACCCaaa > 1:1246657/1‑151 (MQ=255) cTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTT‑CTTCCGGTCCGCCGCCCCTGCTTTTAACCG‑ACCCAGGCGGGGCGT‑TA‑ACTCCGCCCGGTTT‑TTTTCCCAGAA‑ATCT‑CGAATG‑CC‑GCCCGCCC‑TTTAGCCacaa > 1:47660/1‑151 (MQ=255) cTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTG‑CTCGCGGTCCGCCCCCCCCGC‑TTTAACCCCACCCAGGCGGGCGGG‑AA‑CCTTCGCCCGCTTC‑TTTTCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATT‑CCCGCCCCCCG‑TTTAGCCcaaa > 2:255501/1‑151 (MQ=255) tCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCCGCAATTGGCGGGGTTG‑CTCGCGTTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCCTACCCCGGCGGGCAGG‑AA‑ACTCCCCCCGATTT‑TTTTCCCCGAT‑ATTG‑AG‑AAG‑CCCACCCCCCC‑TTAAACCaaaaa > 2:1448071/1‑150 (MQ=255) tCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTT‑CTCCCGGTTCGCCCCCCCCGC‑TTTTACCCGACCCCGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCCCCCCGCTC‑TTTTCCCCGGT‑AACC‑AG‑GTG‑CCCACCCCCCG‑CTTAGCCcaaaa > 1:183807/1‑150 (MQ=255) cAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTT‑TTCCCGGTCCGCCGCCCCGGC‑TTTTACCGTACCCCGGGGGGCCGT‑AA‑CCTCCCCCCCATTC‑TTTTCCCCGCA‑ATCC‑GG‑ATG‑CCACCCCCCCC‑CTTAGCCCAAAATa > 1:1003136/1‑150 (MQ=255) cAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTT‑CTCGCGGTTCGCCGCCCGGGC‑TTTAAACGTACCCCGGCGGGCAGT‑AA‑ACTCCGCCCCATTT‑TTTTCCCCGAT‑ATTG‑GG‑ATG‑CCAGCCCCCCG‑GTTAGCCCAAAATa > 2:1197065/1‑150 (MQ=255) gTACAGGCGGGCTACGCTGCCCGCCACCAATTGGCGGGGTTT‑CTGGCGTTCCGCCGCCCGGGC‑GTTTTACGGACCCACGGGGGCGGT‑AATCTTCCCCCCGTTTC‑‑TTCCCCCGAT‑ATTC‑AG‑ACG‑CCCGCCCCCCG‑TCTAGCCcaaaagaac > 1:1070517/1‑145 (MQ=255) gTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCCGCAATTGGCGGGGTTT‑CTCCCGGTTCCCCGCCCCCTC‑CTTTACCCCCCCCCGGCGGGCCGTAAA‑CCCCCCCCCATTTC‑TTTCCCCCG‑T‑ATCGCAG‑AGG‑CCA‑CCCCCCG‑CTAAGGCAAAAGTAcc > 1:1497517/1‑150 (MQ=255) gTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCCGCAATTGGCGGGGTTG‑CTCGCGTTTCGCCCCCCCGGC‑TTTTAACCCACCCCAGCGGGGCGT‑TA‑CCCCCCCCCCGCTC‑TTTTCCCCGCA‑ATCG‑CG‑AAG‑GCACCCCCCCC‑GTTAGCCAAAAATAcc > 1:1155585/1‑150 (MQ=255) gTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGGGGGGTTT‑CTCGGGGTTCGCCCCCCCGGCTTTTAACCGACCCCAGG‑GGGCAGT‑AA‑ACCCCCCCCCATTC‑TTTTTCCCGAT‑ATTG‑AG‑GTG‑GCCGCCCCGCG‑TTAAGCCcaaaacaac > 1:644027/1‑145 (MQ=255) gTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTG‑CTCCCGGTCCGCCCCCCGCGG‑TTTTAACCTACCCCGGGGGGGAGT‑AA‑CCCCCGCCCCCGTT‑TTTTCCCCCAT‑ATCC‑AG‑AAG‑CCAGCCCCCCGCTTAAACCaaaacaac > 1:1474457/1‑146 (MQ=255) gTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTG‑CTCCCGGTTCCCCCCCCGTGG‑TTTTACCCTAACCCGGCGGGCAGG‑AA‑ACCCCCCCCCCTTC‑TTTTCCCCGAT‑ATCG‑GG‑ATGCCCACCCCCCCG‑TTAAGCCAAAAGAAc > 2:1276368/1‑150 (MQ=255) tccAGGCGGGTTACGCGGCCGGCAAGCAATTGGCGGGTTTG‑CTCGCGTTCCGCCGCCCGTTT‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGAAGT‑AA‑CCCCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGTT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCg < 2:1013378/148‑1 (MQ=255) tACAGGCGGGCTTCGCGCCCAGCCAGAAATTGGGGGGTTTG‑CTCGCGTTCCCCCGCCCGTGT‑TTTACCCGTACCCAGGGGGGAATT‑AC‑CCCCCCCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGt < 2:1460401/151‑1 (MQ=255) acggggggccTACCCTGCCAGCCAGAAATGGGGGGGTTTG‑CCCGCGTCCCGCCGCCCGTGT‑TTTAACCGTCCCCGGGGGGGCAGT‑AC‑CCCCCGCCCGATTT‑TTCCCCCAAAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGtt < 1:58804/142‑1 (MQ=255) aCAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTG‑CTCCCGTTCCGCCCCCCGCGC‑TTTAACCGTACCCACGCGGGCAGT‑AA‑CCCCCGCCCGATTC‑TTTTCCCCGAT‑ATCC‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTTAGCCAAAAGTACCGtt > 1:653883/1‑151 (MQ=255) ggCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTG‑CTCGCGTTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCCGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCCGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGGACCCTTggg > 2:102557/1‑150 (MQ=255) gggCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTG‑CTCGCGTTCCGCCGCCCGGGC‑TTTAACCCTACCCAGGCGGGCAGG‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAAAT‑ACTG‑AC‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑GTCAGGCAAAAGGACCCTTGGTGTa > 1:1125898/1‑151 (MQ=255) gCTCCGCTGCCAGCCAGCAATTGGGGGTTTTG‑CTCGCGTTCCGCCGCCCGTGC‑TTTACCCGTCCCCGGGCGGGAAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTAc < 2:783980/150‑1 (MQ=255) gCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTG‑CTCGCGTTCCGCCGCCCGTGC‑TTTACCCGTCCCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCCCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTAc < 2:591062/150‑1 (MQ=255) gCTACGCTCCCAGCCAGCAATGGGGGGGTTTG‑CGCGCGTTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTCCCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCCCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTAc < 2:537195/150‑1 (MQ=255) ccgacccTGCAAGCGAGC‑ATTGGCCGGTTTGCCTCCCTTCCCCCCGCCCTTGT‑TTCACCCGTCCCCACGC‑GGAGGT‑TA‑CCCTCGCCCCATTCTTTTCCCAAGAT‑ATCG‑AT‑TTA‑CCAGGCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTAc < 1:1227714/144‑1 (MQ=255) ctccGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTG‑CTCGCGTTCCGCCGCCCTTGT‑TTTAACCGTCCCCAGGCGGGCAGT‑‑A‑CC‑CCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCAc < 2:664242/147‑1 (MQ=255) ctccGCTCCCATCCAGCAATTGGCGGTTTTC‑CTCGTGTCCCTCCGCCCGCGC‑TTTACCTTTCCCCGGGCGGGCAGT‑AT‑CCCCCGCCCTTTTC‑TTTCCCGGTAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCACCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACGGTTGGTGTACCa < 1:794935/148‑1 (MQ=255) cgagcgtGCCAGCCGGGAGGTGGCGGGTGTG‑TTGGCGTCCCCCCCCCCTTTC‑TTTAACCGTACCCGGGCGGGCAGT‑AC‑CCCCCCCCCGATCC‑TTCCCCAAGGT‑ACGG‑AG‑ATG‑CAGGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCa < 1:1129244/145‑1 (MQ=255) tgcgcggcaggccagaAATGGGGGGGTTTG‑CTCCCGTTCGGCCGCACGTCC‑TTTAACCGTCCCCCGGCGGGAAGA‑CA‑CCCCCGCCCAATTC‑TTCCCCCAGAT‑AGCG‑AG‑AGG‑CCACACCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCAc < 2:502889/141‑1 (MQ=255) tccGCTGCCACCCAGCATTTGGCGGGTTTG‑CTCGCGTCCCGCCGCCGGTGC‑TTTACCCGTCCCCGGGCGGGCAGT‑AC‑CCTCCGCCCGATTT‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCAc < 2:472356/149‑1 (MQ=255) tACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTG‑CTCGCGTTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTCCCCAGGGGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTT‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCAc < 2:1165835/151‑1 (MQ=255) tACGCGCCCCGCCAGAAATTGGGGGTTTTC‑CTCGCTTTCCGCCGCCTGTCT‑TTTAACCGTACCCCGGCGGGCAGT‑AC‑CCCCCGCCCGTTTC‑TTTCCCCAGAT‑TTAG‑AG‑ATC‑CCAGACCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCAc < 2:239604/151‑1 (MQ=255) ctcccacccagCAGTGGGCGGTTTTG‑CTCGCGTCCCCCCGCCCGTCC‑TTTACCCTTCCCCGGGCGGGCAGT‑AA‑CCCCCCCCCGATTC‑TTCCCCCAAAT‑ACCG‑AG‑ATG‑CCGGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGc < 1:843098/148‑1 (MQ=255) tGCCAGCCAGAAATGGGGGGGTTTG‑CTCGCTTCCCCCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAGT‑AC‑CCCCCGCCCGATTC‑TTCCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGcc < 1:770861/151‑1 (MQ=255) gccggccaGCATTGGGCGGGTTTG‑CTCGCGTCCCGCCCCCCGTGT‑TTTACCCGTACCCAGGGGGGAAGT‑AA‑CCCCCGCCCGATTC‑TTCCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑AGG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGcc < 1:1093945/150‑1 (MQ=255) cacccgaaaaTGGGGGGGTTTC‑CCCGCGTCCCCCCCCCCGTGT‑TTTACCCTTCCCCAGGCGGGCAGT‑AC‑CCCCCGCCCTATTC‑TTCCCCCAGAT‑ACCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGt < 2:1120942/143‑1 (MQ=255) ccagcATTGGGCGGGTTGC‑CTCGCGTCCCCCCCCCCGTGT‑TTAACCCGACCCCAGGCGGGCAGT‑AC‑CCTCCGCCCGATTC‑TTCCCCAAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGt < 1:1196494/148‑1 (MQ=255) aaaTGGGGGGGTTGG‑CTCGCGTCCCGCCGCCGGTGC‑TTAAACCGTCCCGAGGGGGGAAGA‑AC‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCAAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCt < 1:228846/150‑1 (MQ=255) tttG‑CTCGCGTTCCGCCGCCCGGTC‑TTTCCCCGTCCCCGGGGGGGCAGT‑AC‑CCCCCGCCCGATTC‑TTCCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGAt < 1:44211/150‑1 (MQ=255) cccgcgTTCCCCCGCCCTTCC‑TTAACCCTTACCCGGGCGGGCAGT‑AC‑CCCCCGCCCTTTTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATC‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTc < 2:1024617/149‑1 (MQ=255) cccccgTCCCCCCGCCCGTTT‑TTTACCGGGCCCGGGGGGGGCACA‑AC‑CCCCCCCCCGATTC‑TTCCCCCAAAT‑TTCG‑AG‑ATC‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTc < 2:124764/147‑1 (MQ=255) cTCGCGTTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTCCCCAGGCGGGAAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTGAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTc < 2:861096/151‑1 (MQ=255) caggtacgaccggccCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCa > 1:589976/13‑151 (MQ=255) tcccgcccCCCGTGT‑TTTACCCGTCCCCGGGGGGGCAGT‑AC‑CCCCCCCCCGATTC‑TTCCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGc < 2:475679/148‑1 (MQ=255) cgccccccggtgtttACCGGTCCCCATGCGGGCAGT‑AG‑CCTCCGCCCTATTC‑TTCCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCGGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAAc < 1:1285159/139‑1 (MQ=255) ggccCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACgg > 2:906055/2‑150 (MQ=255) tGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCAtt > 2:1202810/1‑151 (MQ=255) gC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTa > 2:510496/1‑151 (MQ=255) gC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTa > 2:631610/1‑151 (MQ=255) gC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTa > 1:556349/1‑151 (MQ=255) 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aCCGTACCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCtt > 2:42705/1‑151 (MQ=255) aCCGTACCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCtt > 1:413162/1‑151 (MQ=255) cGTACCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCtt > 2:118248/1‑149 (MQ=255) gTACCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCtt > 2:207546/1‑148 (MQ=255) tccccAGGCGGGCAGT‑AC‑CCCCCGCCCGTTTT‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGc < 2:954472/149‑1 (MQ=255) ccgggggggcgaGT‑AC‑CCCCCGCCCGTTTC‑TTCCCCAAAAA‑AGGG‑AG‑AGG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCg < 2:933349/140‑1 (MQ=255) cccAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCg > 2:1357721/1‑151 (MQ=255) cAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGa > 2:808942/1‑150 (MQ=255) at‑AA‑CCCCCGCCCCATTT‑CTTCCCCAGATAATCG‑GG‑GGG‑CAAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTGCCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGc < 1:644387/150‑1 (MQ=255) ccTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACCTTTTTTGCCGCt > 1:638003/1‑150 (MQ=255) | CTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTG‑CTCGCGTTCCGCCGCCCGTGC‑TTTAACCGTACCCAGGCGGGCAGT‑AA‑CCTCCGCCCGATTC‑TTTCCCCAGAT‑ATCG‑AG‑ATG‑CCAGCCCGCCG‑TTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGAGCAAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCT > NC_000913/2228135‑2228422 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |