| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 3,813,272 | 0 | C | T | 44.2% | 58.6 / 42.2 | 87 | S181L (TCG→TTG) | dfp | fused 4'‑phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenoylcysteine synthetase, FMN‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (12/36); new base T (38/0); total (50/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.66e-14 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTG‑AAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACG‑CGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGT > NC_000913/3813135‑3813422 | gcaTAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGGTGGGCCATTTTTCGccggctaccc > 1:42952/1‑142 (MQ=255)gcaTAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTAGGGCATTTTTTTCCCCTCAACGa > 2:406838/1‑150 (MQ=255)gcaTAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTAGGGCATTTTTTGCCCCTCCACGa > 2:1468072/1‑150 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aTTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTAGCGCCGTTTTTGCCCCGCAAcacactgga > 1:483788/1‑143 (MQ=255) aTTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGGAGCGCCTTTTTTGCCCCTCAACGACCCG‑aa > 2:1252613/1‑151 (MQ=255) aTTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGGAGCGCATTTTTTGCCCCTCAAAGAACTC‑aa > 2:1114789/1‑151 (MQ=255) ttAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTG‑AAAc < 2:272357/151‑1 (MQ=255) agcggTGCTTGCTTCCCGTGGTGTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTAGCGCGTTTTTCTCCCCTCAAAGACCTA‑AAAcca > 1:1125480/4‑149 (MQ=255) 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cgttttCGCCCGTCAACGACCGG‑AACCATCTGACCATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACG‑CGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGgcg < 2:467500/148‑1 (MQ=255) ttCGCCCGTCAACGACCTG‑AAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACG‑CGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAAc < 2:1320165/151‑1 (MQ=255) tCGCCCGTCAACGACCTG‑AAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACG‑CGTAAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACg < 2:1171265/151‑1 (MQ=255) cGCCCGTCAACGCCCTG‑AAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACG‑CGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGt < 2:1033245/151‑1 (MQ=255) | GCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGC‑GGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTG‑AAACATCTGAACATTATGA‑TTACCGCCGGCCCGACG‑CGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGT > NC_000913/3813135‑3813422 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |