| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 160,648 | (G)5→6 | intergenic (‑44/+134) | dksA ← / ← sfsA | transcriptional regulator of rRNA transcription, DnaK suppressor protein/sugar fermentation stimulation protein A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 160,643 | 1 | . | G | 94.4% | 302.7 / 8.3 | 89 | intergenic (‑39/+139) | dksA/sfsA | transcriptional regulator of rRNA transcription, DnaK suppressor protein/sugar fermentation stimulation protein A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/2); new base G (39/45); total (42/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.25e-01 | |||||||||||
ATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTC‑GGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCACGCGACCAGAATGTAAATTAACCAGTTACT > NC_000913/160506‑160774 | attcatATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTC‑g > 1:1080962/1‑139 (MQ=255)attcatATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTC‑g > 2:253296/1‑139 (MQ=255) tctTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTC‑GGGGGgaaaaa > 1:957623/1‑138 (MQ=255) ttCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGTTCCCCCCCAGCGATGGCGAGAATGCTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATg > 2:772986/1‑139 (MQ=255) ttCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATg > 2:474606/1‑139 (MQ=255) ttCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATg > 2:530832/1‑139 (MQ=255) ttCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTC‑gg > 2:383922/1‑128 (MQ=255) ttCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTC‑gg < 1:383922/128‑1 (MQ=255) ttCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTC‑GGGGGAAAAATGa < 1:1354892/139‑1 (MQ=255) gCCCGGCTTCTCCTGATATGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATGCTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAgg < 1:772986/139‑1 (MQ=255) gCCCGGCTTCTCCTGATATGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAgg < 2:1020331/139‑1 (MQ=255) cGGCTTCTCCTGATATGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCg < 1:486731/139‑1 (MQ=255) cGGCTTCTCCTGATATGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCg < 2:1080962/139‑1 (MQ=255) gCTTCTCCTGATATGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCt < 2:137970/139‑1 (MQ=255) gCTTCTCCTGATATGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCt > 1:1384333/1‑139 (MQ=255) atatGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAgg < 1:700626/124‑1 (MQ=255) atatGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAgg > 2:700626/1‑124 (MQ=255) atatGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCa > 1:1250592/1‑139 (MQ=255) atGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGTCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGa < 2:957623/139‑1 (MQ=255) atGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGa < 2:1116367/139‑1 (MQ=255) gTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGc > 1:1595216/1‑139 (MQ=255) gTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGc > 1:470889/1‑139 (MQ=255) ttCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCt > 1:802329/1‑139 (MQ=255) tCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAgg < 2:315166/117‑1 (MQ=255) tCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAgg > 1:315166/1‑117 (MQ=255) ccccAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAgg > 1:621379/1‑113 (MQ=255) ccccAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAgg < 2:621379/113‑1 (MQ=255) ccccAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCg > 1:1664371/1‑116 (MQ=255) ccccAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCg < 2:1664371/116‑1 (MQ=255) ccccAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTcc > 1:506266/1‑139 (MQ=255) ccccAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACACACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTcc > 1:491471/1‑139 (MQ=255) cAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGa > 1:885911/1‑139 (MQ=255) cAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACACACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGa < 2:491471/139‑1 (MQ=255) aGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAgg > 2:313134/1‑109 (MQ=255) aGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAgg < 1:313134/109‑1 (MQ=255) aGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATg > 1:1307274/1‑128 (MQ=255) aGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATg < 2:1307274/128‑1 (MQ=255) gCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATa > 2:476802/1‑139 (MQ=255) gCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATa > 1:1141268/1‑139 (MQ=255) ggCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCt > 2:783312/1‑108 (MQ=255) ggCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCt < 1:783312/108‑1 (MQ=255) cTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACg < 2:802329/139‑1 (MQ=255) tCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGt < 1:1569311/139‑1 (MQ=255) tCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGt < 2:470889/139‑1 (MQ=255) aGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTaa < 1:419352/139‑1 (MQ=255) aGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTaa < 2:1595216/139‑1 (MQ=255) aGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTaa < 2:1141268/139‑1 (MQ=255) ggACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAgg < 2:767713/88‑1 (MQ=255) ggACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAgg > 1:767713/1‑88 (MQ=255) ggACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTC‑gg > 1:676728/1‑74 (MQ=255) ggACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTC‑gg < 2:676728/74‑1 (MQ=255) gACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAacac > 1:337597/1‑139 (MQ=255) cGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAAAACtt > 1:586021/1‑139 (MQ=255) aTGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGa > 2:318273/1‑139 (MQ=255) tGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGAc > 1:1484253/1‑139 (MQ=255) ttttACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTTG‑GGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATATCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACaa < 1:1722595/139‑1 (MQ=255) ttttACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACaa < 2:337597/139‑1 (MQ=255) ttttACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACaa < 1:253296/139‑1 (MQ=255) ttACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAACAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACt > 2:1217053/1‑139 (MQ=255) cttTCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGa < 2:1081094/79‑1 (MQ=255) cttGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGa > 1:1081094/1‑79 (MQ=255) gCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACg < 2:93203/105‑1 (MQ=255) gCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACg > 1:93203/1‑105 (MQ=255) tGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCa < 2:1384333/139‑1 (MQ=255) tGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTC‑GGGGGAAAAATGGGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCAc > 1:1231782/1‑139 (MQ=255) gCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAgg > 2:505926/1‑52 (MQ=255) gCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAgg < 1:271821/52‑1 (MQ=255) gCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAgg < 1:505926/52‑1 (MQ=255) gCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAgg > 2:271821/1‑52 (MQ=255) cTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGAt < 2:1287672/81‑1 (MQ=255) cTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCAGGAt > 1:1287672/1‑81 (MQ=255) tctcCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCAcgcg > 2:863755/1‑139 (MQ=255) tcCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCACGCGAc < 2:1484253/139‑1 (MQ=255) tcCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCACGCGAc < 1:1713760/139‑1 (MQ=255) ccTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCACGCGAcc < 2:1250592/139‑1 (MQ=255) cTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCACGCGACCa < 1:474606/139‑1 (MQ=255) cTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCACGCGACCa < 1:318273/139‑1 (MQ=255) tAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCACGCGACCAGa > 2:672965/1‑139 (MQ=255) acacGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCACGCGAc > 2:1161577/1‑133 (MQ=255) acacGCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCACGCGAc < 1:1161577/133‑1 (MQ=255) gCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCt < 2:1329026/42‑1 (MQ=255) gCACTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCt > 1:1329026/1‑42 (MQ=38) aCTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGa < 2:1113160/52‑1 (MQ=255) aCTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGa > 1:1113160/1‑52 (MQ=255) aCTATCGATCCCCATG‑TTC‑GGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCACGCGACCAGAATGTAAAtt > 2:1447484/1‑139 (MQ=255) cTATCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAAAACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCACGCGACCAGAATGTAAAtt < 2:586021/139‑1 (MQ=255) tCGATCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCACGCGACCAGAATGTAAATTAAc < 1:476802/139‑1 (MQ=255) aTCCCCATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCACGCGACCAGAATGTAAATTAACCAg < 1:1217053/139‑1 (MQ=255) cccATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAATACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCAcg > 1:596695/1‑113 (MQ=255) cccATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCAcg < 2:596695/113‑1 (MQ=255) cATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACtgtgtg < 2:533268/89‑1 (MQ=255) cATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACtgtgtg > 1:533268/1‑89 (MQ=255) cATG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCACGCGACCAGAATGTAAATTAACCAGttact < 1:672965/139‑1 (MQ=255) tG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCtttt > 2:740912/1‑45 (MQ=255) tG‑TTCGGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCtttt < 1:740912/45‑1 (MQ=255) | ATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATG‑TTC‑GGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCACGCGACCAGAATGTAAATTAACCAGTTACT > NC_000913/160506‑160774 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |