| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 385,737 | A→G | D169G (GAT→GGT) | tauA → | taurine ABC transporter periplasmic binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 385,737 | 0 | A | G | 100.0% | 105.2 / NA | 30 | D169G (GAT→GGT) | tauA | taurine ABC transporter periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (15/15); total (15/15) | |||||||||||
ACCGTTTATCTCCACCACCCACTACAGCCTGCTGGCGGCACTGAAACACTGGGGCATTAAACCCGGGCAAGTGGAGATTGTGAACCTGCAGCCGCCCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGATATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCTGGAAAAAGACGGCAAGGTGTTGACCGATTCTGAACAGGTCGGGCAGTGGGGCGCGCCAACGCTGGACGTCTGGGTGGTGCGCAAAGATTTT > NC_000913/385612‑385870 | aCCGTTTATCTCCACCACCCACTACAGCCTGCTGGCGGCACTGAAACACTGGGGCATTAAACCCGGGCAAGTGGAGATTGTGAACCTGCAGCCGCCCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCt < 2:786624/139‑1 (MQ=255) tcCACCACCCACTACAGCCTGCTGGCGGCACTGAAACACTGGGGCATTAAACCCGGGCAAGTGGAGATTGTGAACCTGCAGCCGCCCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTggg < 2:1320212/139‑1 (MQ=255) accaccCACTACAGCCTGCTGGCGGCACTGAAACACTGGGGCATTAAACCCGGGCAAGTGGAGATTGTGAACCTGCAGCCGCCCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCAc < 1:94007/139‑1 (MQ=255) cccacTACAGCCTGCTGGCGGCACTGAAACACTGGGGCATTAAACCCGGGCAAGTGGAGATTGTGAACCTGCAGCCGCCCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACcggc > 2:967005/1‑139 (MQ=255) cccacTACAGCCTGCTGGCGGCACTGAAACACTGGGGCATTAAACCCGGGCAAGTGGAGATTGTGAACCTGCAGCCGCCCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACcgg > 2:364837/1‑138 (MQ=255) cccacTACAGCCTGCTGGCGGCACTGAAACACTGGGGCATTAAACCCGGGCAAGTGGAGATTGTGAACCTGCAGCCGCCCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACcgg < 1:364837/138‑1 (MQ=255) tACAGCCTGCTGGCGGCACTGAAACACTGGGGCATTAAACCCGGGCAAGTGGAGATTGTGAACCTGCAGCCGCCCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTa > 2:493764/1‑139 (MQ=255) ctgctgGCGGCACTGAAACACTGGGGCATTAAACCCGGGCAAGTGGAGATTGTGAACCTGCAGCCGCCCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTTATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGccc > 1:947806/1‑139 (MQ=255) tgctgGCGGCACTGAAACACTGGGGCATTAAACCCGGGCAAGTGGAGATTGTGAACCTGCAGCCGCCCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCt < 2:744964/139‑1 (MQ=255) aaaCACTGGGGCATTAAACCCGGGCAAGTGGAGATTGTGAACCTGCAGCCGCCCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCTGGAAAAAGACGGCa < 2:545681/139‑1 (MQ=255) gggCAAGTGGAGATTGTGAACCTGCAGCCGCCCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCTGGAAAAAGACGGCAAGGTGTTGACCGATTCTGAAc > 2:844615/1‑139 (MQ=255) gggCAAGTGGAGATTGTGAACCTGCAGCCGCCCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCTGGAAAAAGACGGCAAGGTGTTGACCGATTCTGAAc > 1:671253/1‑139 (MQ=255) ggCAAGTGGAGATTGTGAACCTGCAGCCGCCCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCAc > 1:766587/1‑87 (MQ=255) ggCAAGTGGAGATTGTGAACCTGCAGCCGCCCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCAc < 2:766587/87‑1 (MQ=255) aGTGGAGATTGTGAACCTGCAGCCGCCCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCTGGAAAAAGACGGCAAGGTGTTGACCGATTCTGAACAGGTc < 2:671253/139‑1 (MQ=255) ccTGCAGCCGCCCGCGATTATCGCGGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCTGGAAAAAGACGGCAAGGTGTTGACCGATTCTGAACAGGTCGGGCAGTGGGgcgcg < 1:844615/139‑1 (MQ=255) gCAGCCGCCCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGc > 1:822959/1‑78 (MQ=255) gCAGCCGCCCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGc < 2:822959/78‑1 (MQ=255) gccgccCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCTGGAAAAAGACGGCAAGGTGTTGAc > 2:1235446/1‑102 (MQ=255) gccgccCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCTGGAAAAAGACGGCAAGGTGTTGAc < 1:1235446/102‑1 (MQ=255) cccgcGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCTGGAAAAAGACGGc > 1:587504/1‑87 (MQ=255) cccgcGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCTGGAAAAAGACGGc < 2:587504/87‑1 (MQ=255) cccgcGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCTGGAAAAAGACGGCAAGGTGTTGACCGATTCTGAACAGGTCGGGCAg > 2:934625/1‑120 (MQ=255) cccgcGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCTGGAAAAAGACGGCAAGGTGTTGACCGATTCTGAACAGGTCGGGCAg < 1:934625/120‑1 (MQ=255) tGCCAGGCAGCGGGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCTGGAAAAAGACGGCAAGGTGTTGACCGATTCTGAACAGGTCGGGCAGTGGGGCGCGCCAACGCTg > 1:814113/1‑125 (MQ=255) tGCCAGGCAGCGGGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCTGGAAAAAGACGGCAAGGTGTTGACCGATTCTGAACAGGTCGGGCAGTGGGGCGCGCCAACGCTg < 2:814113/125‑1 (MQ=255) gCCTGGCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCTGGAAAAAGACGGCAAGGTGTTGACCGATTCTGAACAGGTCGGGCAGTGGGGCGCGCCAACGCTGGACGTCTGGGTGGTgc > 1:1164139/1‑139 (MQ=255) ggCAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCTGGAAAAAGACGGCAAGGTGTTGACCGATTCTGAACAGGTCGGGCAGTGGGGCGCGCCAACGCTGGACGTCTGGGTGGTGCGCaa < 2:1164139/139‑1 (MQ=255) cAGC‑GGGGAGGTATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCTGGAAAAAGACGGCAAGGTGTTGACCGATTCTGAACAGGTCGGGCAGTGGGGCGCGCCAACGCTGGACGTCTGGGTGGTGCGCAAAg > 2:1223831/1‑139 (MQ=255) gggAGGTATTGATGGTGCATATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCTGGAAAAAGACGGCAAGGTGTTGACCGATTCTGAACAGGTCGGGCAGTGGGGCGCGCCAACGCTGGACGTCTGGGTGGTGCGCAAAGAtttt > 2:452642/1‑139 (MQ=255) | ACCGTTTATCTCCACCACCCACTACAGCCTGCTGGCGGCACTGAAACACTGGGGCATTAAACCCGGGCAAGTGGAGATTGTGAACCTGCAGCCGCCCGCGATTATCGCTGCCTGGCAGC‑GGGGAGATATTGATGGTGCTTATGTCTGGGCACCGGCGGTTAACGCCCTGGAAAAAGACGGCAAGGTGTTGACCGATTCTGAACAGGTCGGGCAGTGGGGCGCGCCAACGCTGGACGTCTGGGTGGTGCGCAAAGATTTT > NC_000913/385612‑385870 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |