| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,789,352 | G→A | R244C (CGC→TGC) | waaH ← | LPS(HepIII)‑glucuronic acid glycosyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,789,352 | 0 | G | A | 100.0% | 244.9 / NA | 77 | R244C (CGC→TGC) | waaH | LPS(HepIII)‑glucuronic acid glycosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (29/48); total (29/48) | |||||||||||
GTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAAC > NC_000913/3789217‑3789485 | gTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 2:1201745/139‑1 (MQ=255)gTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 1:85595/139‑1 (MQ=255)gTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 2:496082/139‑1 (MQ=255)gTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 1:384478/139‑1 (MQ=255)gTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 2:1032468/139‑1 (MQ=255)gTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 2:220601/139‑1 (MQ=255)gTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 2:973678/139‑1 (MQ=255) tGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTaa < 2:440354/139‑1 (MQ=255) gggCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTaa < 2:317426/138‑1 (MQ=255) cGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCt < 1:468666/139‑1 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ccGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 1:240010/121‑1 (MQ=255) ccGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACg > 2:297267/1‑139 (MQ=255) gCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTg > 1:963288/1‑139 (MQ=255) ctctTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGa > 1:947962/1‑139 (MQ=255) tctTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt > 2:251602/1‑116 (MQ=255) tctTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 1:251602/116‑1 (MQ=255) 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tttGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGt < 1:226441/73‑1 (MQ=255) cTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGta < 2:947962/139‑1 (MQ=255) tgatgaAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTc > 2:415787/1‑108 (MQ=255) tgatgaAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTc < 1:415787/108‑1 (MQ=255) tCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGat < 2:1204914/139‑1 (MQ=255) ccGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGata > 1:414328/1‑139 (MQ=255) cGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGataa < 2:414328/139‑1 (MQ=255) ggATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGataat < 1:1179587/139‑1 (MQ=255) aTAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAatat < 1:1203353/139‑1 (MQ=255) ttttGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGa < 1:203454/139‑1 (MQ=255) tGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCTAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTg < 2:943033/105‑1 (MQ=255) tGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAAc > 1:427128/1‑95 (MQ=255) 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aaTTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGAtt < 1:833873/118‑1 (MQ=255) aaTTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGAtt > 2:833873/1‑118 (MQ=255) aTTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTcc > 1:751360/1‑60 (MQ=255) aTTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTcc < 2:751360/60‑1 (MQ=255) aTTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGAtt > 1:918354/1‑117 (MQ=255) aTTTCTCCAGCAGGCAGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGAtt < 2:918354/117‑1 (MQ=255) caggcaggTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAAc < 2:1033082/139‑1 (MQ=255) | GTTGGCGGGTAAGAATATCCGGCTCTTTGCGCACCGCATGGCAAACACGCAATGCCTCGTAAGTTATTTGCTGATGAAATTCCGGATAAATCATAA‑TTTTGTCGGCATAATTTCGATTTAATTTCTCCAGCAGGCGGGTAATCTTAATATAGTGACGTTGATAATTAAGGTTTTTATTCCCTTGTCTATGCAACCGACTCACTGACGTATTATGCAGATAATATTTATATAATGATTGCTCGGTATATCGCGCACGCAGCGCGTTAAAC > NC_000913/3789217‑3789485 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |