| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,006,415 | Δ1 bp | coding (464/543 nt) | zapC → | FtsZ stabilizer |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,006,413 | 0 | G | . | 100.0% | 160.4 / NA | 40 | coding (462/543 nt) | zapC | FtsZ stabilizer |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (21/19); total (21/19) | |||||||||||
GGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCG‑‑CACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAA > NC_000913/1006279‑1006540 | ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGTGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCG‑‑CACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTggcga < 2:959256/139‑4 (MQ=255) gCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCG‑‑CACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTggcgac < 1:673540/139‑5 (MQ=255) tGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGc < 1:1475484/139‑1 (MQ=255) tttGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCG‑‑CACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATg > 2:1342565/1‑139 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCG‑‑CACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 2:347903/139‑1 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCG‑‑CACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 2:637529/1‑139 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCG‑‑CACTATGCCTGCTGGCACAACTCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 2:1600439/139‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCG‑‑CACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg > 1:417618/1‑139 (MQ=255) gCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCG‑‑CACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg < 1:1435759/139‑1 (MQ=255) gCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCG‑‑CACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg < 2:845343/139‑1 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCG‑‑CACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACG‑CATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGtt > 2:646577/1‑139 (MQ=255) gCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCG‑‑CACTATGCCTACTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACa > 2:110014/1‑139 (MQ=255) aTCTGGCGAAAATGCCG‑‑CACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACG‑CATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGa < 1:646577/139‑1 (MQ=255) aaaTGCCG‑‑CACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg > 2:1213623/1‑106 (MQ=255) aaaTGCCG‑‑CACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg < 1:1213623/106‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTg > 2:1020362/1‑137 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTg < 1:1020362/137‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 1:1352866/139‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 2:493447/1‑139 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 2:1517461/134‑1 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:1517461/1‑134 (MQ=255) tgttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGa > 2:937347/1‑95 (MQ=255) tgttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGa < 1:937347/95‑1 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:1231354/1‑139 (MQ=255) tATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGc < 1:1342565/139‑1 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGa > 1:455699/1‑73 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGa < 2:455699/73‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATTAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:1120221/1‑116 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg > 2:1509409/1‑60 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg < 1:1509409/60‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 2:1120221/116‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa > 2:1579414/1‑139 (MQ=255) tCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 1:1529098/1‑139 (MQ=255) cgcgcgATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTg > 2:935955/1‑111 (MQ=255) cgcgcgATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAg < 1:637529/139‑1 (MQ=255) cgcgcgATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGACAACtttaatg < 1:935955/111‑6 (MQ=255) cgcgATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa > 2:634195/1‑121 (MQ=255) cgcgATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa < 1:634195/121‑1 (MQ=255) cgcgATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 2:517213/1‑136 (MQ=255) cgcgATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa < 1:517213/136‑1 (MQ=255) cgcgATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa > 2:114081/1‑139 (MQ=255) cgcgATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa > 1:768824/1‑139 (MQ=255) | GGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCG‑‑CACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAA > NC_000913/1006279‑1006540 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |