| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,782,393 | (C)5→4 | coding (334/4581 nt) | ypjA ← | adhesin‑like autotransporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,782,389 | 0 | C | . | 100.0% | 407.0 / NA | 99 | coding (338/4581 nt) | ypjA | adhesin‑like autotransporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base . (50/49); total (50/49) | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
TACCACCATCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACCCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATACCCCGCCATGAA > NC_000913/2782252‑2782521 | tACCACCATCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGTTTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATAcc < 1:1403064/139‑1 (MQ=255) accaTCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATAccccgt > 2:899340/1‑137 (MQ=255) accaTCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATAccccgt < 2:1707433/139‑3 (MQ=255) tCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATg > 2:1688129/1‑139 (MQ=255) tGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAAtt > 2:1457574/1‑139 (MQ=255) ttCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGt > 2:1124407/1‑139 (MQ=255) ttCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGt > 2:371866/1‑139 (MQ=255) aTTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGc < 2:443908/139‑1 (MQ=255) aCTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGt < 1:1468209/139‑1 (MQ=255) ctccctcTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATg > 1:1371301/1‑139 (MQ=255) tccctcTACGCGTGAGGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTGGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATgg > 2:1157308/1‑139 (MQ=255) cctcTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATgg > 2:1678798/1‑137 (MQ=255) cctcTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATgg < 1:1678798/137‑1 (MQ=255) cgcgTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGtatta < 1:899340/139‑1 (MQ=255) cgTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAAtt > 2:195130/1‑107 (MQ=255) cgTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAAtt < 1:195130/107‑1 (MQ=255) tGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGa < 1:167591/107‑1 (MQ=255) tGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGa > 2:167591/1‑107 (MQ=255) aCCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATAcc < 2:33291/87‑1 (MQ=255) aCCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATAcc > 1:33291/1‑87 (MQ=255) aCCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCAGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGcc < 2:1519973/139‑1 (MQ=255) cGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTACTAGCCTGcccc > 1:1123823/1‑139 (MQ=255) tCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTa < 2:1371301/139‑1 (MQ=255) cGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTc > 1:884118/1‑91 (MQ=255) cGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTc < 2:884118/91‑1 (MQ=255) gTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATg < 1:1020316/139‑1 (MQ=255) gTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATg > 2:61714/1‑139 (MQ=255) ttCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGa < 1:1457574/139‑1 (MQ=255) ttCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGa < 2:1123823/139‑1 (MQ=255) ccATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGt < 2:505313/86‑1 (MQ=255) ccATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGt > 1:505313/1‑86 (MQ=255) aTACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATAcc < 2:1185233/59‑1 (MQ=255) aTACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATAcc > 1:1185233/1‑59 (MQ=255) aTACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTg > 2:1540990/1‑109 (MQ=255) aTACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTg < 1:1540990/109‑1 (MQ=255) aTACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACaaa < 1:1537871/118‑1 (MQ=255) aTACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACaaa > 2:1537871/1‑118 (MQ=255) aTACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATc > 2:1345186/1‑139 (MQ=255) aTACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATc > 1:1484812/1‑139 (MQ=255) aCCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGAc > 2:83011/1‑127 (MQ=255) aCCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGAc < 1:83011/127‑1 (MQ=255) ccccTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGtt < 1:561496/84‑1 (MQ=255) ccccTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGtt > 2:561496/1‑84 (MQ=255) ccTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATCGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACGAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGata < 1:1157308/139‑1 (MQ=255) cTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATAcc > 2:1587597/1‑52 (MQ=255) cTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTaa < 2:501381/83‑1 (MQ=255) cTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTaa > 1:501381/1‑83 (MQ=255) cTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCt > 2:1311516/1‑127 (MQ=255) tataAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATcca < 1:371866/139‑1 (MQ=255) cGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGc > 1:633187/1‑90 (MQ=255) cGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGc < 2:633187/90‑1 (MQ=255) gTCCTGATTGCCACTCTCGTTTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCta < 1:806604/118‑1 (MQ=255) gTCCTGATTGCCACTCTCGTTTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCta > 2:806604/1‑118 (MQ=255) tCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCa > 2:919639/1‑65 (MQ=255) tCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCa < 1:919639/65‑1 (MQ=255) tCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTaa > 1:240337/1‑72 (MQ=255) tCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCtata < 1:1177000/119‑1 (MQ=255) tCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCtata > 2:1177000/1‑119 (MQ=255) tCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTc > 1:180249/1‑139 (MQ=255) ccTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTaa > 1:1632974/1‑71 (MQ=255) ccTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTaa < 2:1632974/71‑1 (MQ=255) ccTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCa < 1:1124407/139‑1 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGc > 2:226320/1‑61 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCGCCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTAt > 2:1132197/1‑106 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCATCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTAt < 1:1132197/106‑1 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATgg < 1:309110/73‑1 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATgg > 2:309110/1‑73 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGtt < 1:1624898/75‑1 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGtt > 2:1624898/1‑75 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTg < 1:518794/76‑1 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTg > 2:518794/1‑76 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTg < 2:1419733/89‑1 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTg > 1:1419733/1‑89 (MQ=255) gATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATa > 2:759980/1‑139 (MQ=255) gCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGAc < 1:1688129/139‑1 (MQ=255) gCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGAc < 2:180249/139‑1 (MQ=255) cACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACtt < 1:1345186/139‑1 (MQ=255) aCTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTg > 2:188547/1‑67 (MQ=255) aCTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTg < 1:188547/67‑1 (MQ=255) tctcGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGa > 1:593783/1‑97 (MQ=255) tctcGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGa < 2:593783/97‑1 (MQ=255) tcGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTaa > 2:322779/1‑57 (MQ=255) tcGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTaa < 1:322779/57‑1 (MQ=255) tcGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCca < 1:866442/81‑1 (MQ=255) tcGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCca > 2:866442/1‑81 (MQ=255) gATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTg < 1:976478/61‑1 (MQ=255) cGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATAcc < 1:1517605/138‑1 (MQ=255) cGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATAcc > 2:1517605/1‑138 (MQ=255) tACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGa > 1:1081013/1‑85 (MQ=255) tACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATccac < 1:219634/107‑1 (MQ=255) tACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATccac > 2:219634/1‑107 (MQ=255) tACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATACCCCg > 2:113991/1‑139 (MQ=255) ccTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGa > 1:1682410/1‑109 (MQ=255) ccTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGa < 2:1682410/109‑1 (MQ=255) gtgGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTg > 1:1003796/1‑61 (MQ=255) gtgGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTg < 2:1003796/61‑1 (MQ=255) tgGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGAc > 2:975843/1‑80 (MQ=255) tgGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGAc < 1:975843/80‑1 (MQ=255) ggAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGcc > 2:1089952/1‑61 (MQ=255) ggAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGcc < 1:1089952/61‑1 (MQ=255) | TACCACCATCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACCCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATACCCCGCCATGAA > NC_000913/2782252‑2782521 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |