| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 96,008 | G→A | *453* (TAG→TAA) V3I (GTT→ATT) |
murF → mraY → |
UDP‑N‑acetylmuramoyl‑tripeptide:D‑alanyl‑D‑ alanine ligase phospho‑N‑acetylmuramoyl‑pentapeptide transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 96,008 | 0 | G | A | 100.0% | 300.5 / NA | 92 | *453* (TAG→TAA) V3I (GTT→ATT) | murF mraY | UDP‑N‑acetylmuramoyl‑tripeptide:D‑alanyl‑D‑ alanine ligase phospho‑N‑acetylmuramoyl‑pentapeptide transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (46/46); total (46/46) | |||||||||||
CTGCGTTAATTACGCGTCTTAAATTACTGATTGCTGAGCAACAGGTAATTACGATTTTAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAGTTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACCGCGCTGTTCATCTCATTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCAT > NC_000913/95881‑96142 | cTGCGTTAATTACGCGTCTTAAATTACTGATTGCTGAGCAACAGGTAATTACGATTTTAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGcc < 2:1333533/139‑1 (MQ=255) tACGCGTCTTAAATTACTGATTGCTGAGCAACAGGTAATTACGATTTTAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTgg < 1:83083/139‑1 (MQ=255) aCGCGTCTTAAATTACTGATTGCTGAGCAACAGGTAATTACGATTTTAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGt < 2:1348986/139‑1 (MQ=255) ttAAATTACTGATTGCTGAGCAACAGGTAATTACGATTTTAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAatat > 1:1498818/1‑139 (MQ=255) ttAAATTACTGATTGCTGAGCAACAGGTAATTACGATTTTAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTAGTCAAatat > 1:1108623/1‑139 (MQ=255) ttACTGATTGCTGAGCAACAGGTAATTACGATTTTAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTc < 2:1498818/139‑1 (MQ=255) aTTGCTGAGCAACAGGTAATTACGATTTTAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCtt > 2:103456/1‑139 (MQ=255) cTGAGCAACAGGTAATTACGATTTTAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGACCATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAAc < 1:279518/139‑1 (MQ=255) gAGCAACAGGTAATTACGATTTTAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGt < 2:1108623/139‑1 (MQ=255) aGCAACAGGTAATTACGATTTTAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTtgg < 1:42021/97‑1 (MQ=255) aGCAACAGGTAATTACGATTTTAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTtgg > 2:42021/1‑97 (MQ=255) cAGGTAATTACGATTTTAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTc > 1:190812/1‑110 (MQ=255) cAGGTAATTACGATTTTAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTc < 2:190812/110‑1 (MQ=255) aaTTACGATTTTAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATc > 2:1553235/1‑139 (MQ=255) cGATTTTAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTtgg < 1:177966/82‑1 (MQ=255) cGATTTTAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTtgg > 2:177966/1‑82 (MQ=255) gATTTTAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGt > 1:1222351/1‑139 (MQ=255) ttttAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTtggctggc > 1:779580/1‑84 (MQ=255) ttttAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTtggctggc < 2:779580/84‑1 (MQ=255) tttAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTtgg < 1:45942/78‑1 (MQ=255) tttAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTtgg > 2:45942/1‑78 (MQ=255) gTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCgcgc < 1:952974/139‑1 (MQ=255) gggTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAATGGGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATc > 1:928330/1‑139 (MQ=255) gggTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGa < 1:1601811/124‑1 (MQ=255) gggTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGa > 2:1601811/1‑124 (MQ=255) gggTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCg < 1:103456/139‑1 (MQ=255) gTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTc < 2:1222351/139‑1 (MQ=255) cACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAATGGGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAg < 2:928330/139‑1 (MQ=255) cACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCg < 2:1278788/71‑1 (MQ=255) cACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCg > 1:1278788/1‑71 (MQ=255) cACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTc < 1:756572/82‑1 (MQ=255) cACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTc > 2:756572/1‑82 (MQ=255) gTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCctgctg > 2:1469966/1‑139 (MQ=255) tGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGa < 1:1553235/139‑1 (MQ=255) tGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCt > 2:754154/1‑98 (MQ=255) tGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCt < 1:754154/98‑1 (MQ=255) ggagagGTAGTACGCGCTTTAGAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTC‑AATATTATTCCGGCTTTAACGTCTCTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACCGCGCTGTTc > 2:1041617/3‑139 (MQ=255) agagGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACCGCGCTGTTCa < 1:365585/139‑1 (MQ=255) agagGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACCGCGCTGTTCa > 2:1582770/1‑139 (MQ=255) gtagtaCGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCgcgc > 1:1585364/1‑106 (MQ=255) gtagtaCGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCgcgc < 2:1585364/106‑1 (MQ=255) agtaCGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTc > 2:1340342/1‑57 (MQ=255) agtaCGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTc < 1:1340342/57‑1 (MQ=255) gtaCGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACcgcg < 1:1008100/125‑1 (MQ=255) gtaCGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACCGCGCTGTTCATCTCAtt > 2:463226/1‑139 (MQ=255) gtaCGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGACTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCAGACcgcg > 2:1008100/1‑125 (MQ=255) taCGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTc > 1:1365382/1‑55 (MQ=255) taCGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTc < 2:1365382/55‑1 (MQ=255) taCGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACcg < 1:669447/122‑1 (MQ=255) taCGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACcg > 2:669447/1‑122 (MQ=255) taCGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACCGCGCTGTTCATCTCATtg > 1:869219/1‑139 (MQ=255) 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2:418490/105‑1 (MQ=255) t‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACCGCGCTGt > 1:193149/1‑109 (MQ=255) t‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACCGCGCTGt < 2:193149/109‑1 (MQ=255) t‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACCGCGCTGTTCATCTCATTGTGGAt > 2:1203483/1‑125 (MQ=255) t‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACCGCGCTGTTCATCTCATTGTGGAt < 1:1203483/125‑1 (MQ=255) t‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACCGCGCTGTTCATCTCATTGTGGATGGGc < 1:1061559/129‑1 (MQ=255) t‑GGGACATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACCGCGCTGTTCATCTCATTGTGGATGGGc > 2:1061559/1‑129 (MQ=255) cATGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACCGCGCTGTTCATCTCATTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCt > 2:1682528/1‑139 (MQ=255) aTGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTc > 1:754998/1‑73 (MQ=255) aTGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTc < 2:754998/73‑1 (MQ=255) aTGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACCGCGCTGTTCAt > 2:1559083/1‑107 (MQ=255) aTGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACCGCGCTGTTCAt < 1:1559083/107‑1 (MQ=255) tGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTc < 2:938393/40‑1 (MQ=255) tGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTc > 1:938393/1‑40 (MQ=255) tGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGt > 1:1168695/1‑69 (MQ=255) tGTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGt < 2:1168695/69‑1 (MQ=255) gTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACCGCGCTGTTCATCTCATTGTGGATGGGc < 2:747596/121‑1 (MQ=255) gTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACCGCGCTGTTCATCTCATTGTGGATGGGc > 1:747596/1‑121 (MQ=255) gTTAATTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACCGCGCTGTTCATCTCATTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCAt > 1:638696/1‑139 (MQ=255) | CTGCGTTAATTACGCGTCTTAAATTACTGATTGCTGAGCAACAGGTAATTACGATTTTAGTTAAGGGTTCACGTAGTGCCGCCATGGAAGAGGTAGTACGCGCTTTACAGGAGAAT‑GGGACATGTTAGTTTGGCTGGCCGAACATTTGGTCAAATATTATTCCGGCTTTAACGTCTTTTCCTATCTGACGTTTCGCGCCATCGTCAGCCTGCTGACCGCGCTGTTCATCTCATTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCAT > NC_000913/95881‑96142 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |