| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,268,487 | (T)7→8 | intergenic (+180/+322) | tyrB → / ← yjbS | tyrosine aminotransferase, tyrosine‑repressible, PLP‑dependent/uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,268,480 | 1 | . | T | 100.0% | 68.6 / NA | 23 | intergenic (+173/+329) | tyrB/yjbS | tyrosine aminotransferase, tyrosine‑repressible, PLP‑dependent/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base T (8/15); total (8/15) | |||||||||||
TTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑TTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCT > NC_000913/4268348‑4268601 | ttAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑tttttt < 2:668270/139‑1 (MQ=255) tGTCGTCGCTTTTACTTTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑ttttttttgggt < 2:224067/139‑6 (MQ=255) ctttctttATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTg < 1:600116/139‑1 (MQ=255) ttttttttTAGTTGTTTTTTTTATTGCCATCGTTTTCGGTAAG‑GATTATTAACGTTTTTTATTTCTTTAATTGTT‑AGGTTTTCCCAATTTTTTTGGAATTCTTTTTCTTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGc < 1:473541/139‑1 (MQ=255) ttctttATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGca < 2:805127/139‑1 (MQ=255) tataGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCt < 1:691175/139‑1 (MQ=255) aGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAAc < 1:198216/139‑1 (MQ=255) gatgatTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAAc < 2:815403/138‑1 (MQ=255) gatgatTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAAc > 1:815403/1‑138 (MQ=255) tCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTtaataata < 1:305060/139‑1 (MQ=255) tttcggtagagaTTATAAATC‑TTTTTAATTCGTTTTTTTTTAAGCCTTACCCAA‑TTATCTGGAATTCCCTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTAt < 2:6500/132‑1 (MQ=255) cGTGAGAGATAATAAACG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCgg > 1:165718/1‑139 (MQ=255) agagaTAATAAACG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAAttt > 1:84049/1‑94 (MQ=255) agagaTAATAAACG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAAttt < 2:84049/94‑1 (MQ=255) agaTAATAAACG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGtaat < 1:472034/87‑1 (MQ=255) agaTAATAAACG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGtaat > 2:472034/1‑87 (MQ=255) agaTAATAAACG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTaataat < 2:715398/90‑1 (MQ=255) agaTAATAAACG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTaataat > 1:715398/1‑90 (MQ=255) aCG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGca < 1:184689/88‑1 (MQ=255) aCG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGca > 2:184689/1‑88 (MQ=255) tgttAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAatat > 1:345121/1‑139 (MQ=255) ttCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCtat < 1:502079/139‑1 (MQ=255) ttCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCtat < 1:232778/139‑1 (MQ=255) tGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCt < 2:203748/139‑1 (MQ=255) tGGAATTCCTTATCCTGTTTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCt > 1:796138/1‑139 (MQ=255) | TTAAACTGTCGTCGCTTTCACTCTTTCTTTATAGATGATTTTTTTGATGCCATCGTTCTACGTGAGAGATAATAAACG‑TTGTTAGTTCTTTTATTGTTAAGCTTATCCCAA‑TTATCTGGAATTCCTTATCCTG‑TTTTTTTGGGTGGAGTAATAATTTCTGCACATCTAACCATTATTAAATTTAATAATAAGTATCGGGTTTGTTACGATAGAATATTTCTATATCCTCAAGAATATGCTTTGCCTTATTGCCT > NC_000913/4268348‑4268601 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |