| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,619,913 | A→G | E104G (GAA→GGA) | deoB → | phosphopentomutase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,619,913 | 0 | A | G | 100.0% | 169.4 / NA | 48 | E104G (GAA→GGA) | deoB | phosphopentomutase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (24/24); total (24/24) | |||||||||||
GCTGGCGAAAGCACACGAAGGTTCTACCGGTTTCATTCCGGCGGGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGAAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCTTCCGG > NC_000913/4619782‑4620048 | gCTGGCGAAAGCACACGAAGGTTCTACCGGTTTCATTCCGGCGGGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATACCCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGc < 1:1091074/139‑1 (MQ=255) tGGCGAAAGCACACGAAGGTTCTACCGGTTTCATTCCGGCGGGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCgg < 2:1317834/139‑1 (MQ=255) gCGAAAGCACACGAAGGTTCTACCGGTTTCATTCCGGCGGGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGgtg > 1:431455/1‑139 (MQ=255) gCACACGAAGGTTCTACCGGTTTCATTCCGGCGGGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCgg < 2:1232032/139‑1 (MQ=255) acacGAAGGTTCTACCGGTTTCATTCCGGCGGGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGtt < 2:801812/139‑1 (MQ=255) aGGTTCTACCGGTTTCATTCCGGTGGGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGttt > 2:928628/1‑139 (MQ=255) ccGGTTTCATTCCGGCGGGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGcc < 1:649897/113‑1 (MQ=255) ccGGTTTCATTCCGGCGGGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGcc > 2:649897/1‑113 (MQ=255) ttCATTCCGGCGGGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCATTGGGGAATTGc < 1:852613/107‑1 (MQ=255) ttCATTCCGGCGGGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGc > 2:852613/1‑107 (MQ=255) tCCGGCGGGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTcc > 2:252911/1‑139 (MQ=255) gcggGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATc > 2:256112/1‑139 (MQ=255) gAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGa < 2:431455/139‑1 (MQ=255) cAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTc > 1:637305/1‑139 (MQ=255) aaCGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAg > 2:886435/1‑105 (MQ=255) aaCGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAg < 1:886435/105‑1 (MQ=255) cTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTcc > 2:285860/1‑87 (MQ=255) cTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTcc < 1:285860/87‑1 (MQ=255) ttATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAgct < 1:252911/139‑1 (MQ=255) tATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAgctg < 1:1364824/139‑1 (MQ=255) aTCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAgctgc < 2:1050151/139‑1 (MQ=255) aTCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAgctgc > 1:1248418/1‑139 (MQ=255) cgcgTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCgg > 1:173671/1‑69 (MQ=255) 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cGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGt < 1:836357/139‑1 (MQ=255) cGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGt < 2:637305/139‑1 (MQ=255) ggTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCgg < 1:1389863/38‑1 (MQ=255) ggTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCgg > 2:1389863/1‑38 (MQ=255) a‑CCCCGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTa > 2:362261/1‑139 (MQ=255) cccGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGt > 1:752742/1‑41 (MQ=255) cccGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGt < 2:752742/41‑1 (MQ=255) cccGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAAc > 2:747153/1‑139 (MQ=255) cccGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAAc > 2:214579/1‑139 (MQ=255) cccGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAAc > 2:1289840/1‑139 (MQ=255) ccGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAg > 2:1233769/1‑45 (MQ=255) ccGTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAg < 1:1233769/45‑1 (MQ=255) gTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGc > 1:1268263/1‑139 (MQ=255) gTCTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGc < 1:362261/139‑1 (MQ=255) cTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCa < 2:1268263/139‑1 (MQ=255) cTGGTCACTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCa < 2:1248418/139‑1 (MQ=255) aCTGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCTTc < 1:256112/139‑1 (MQ=255) tGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCg < 1:249175/121‑1 (MQ=255) tGGGGAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCg > 2:249175/1‑121 (MQ=255) ggggAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCa > 2:1311189/1‑130 (MQ=255) ggggAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCa < 1:1311189/130‑1 (MQ=255) ggggAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCTTCCgg < 2:176607/139‑1 (MQ=255) | GCTGGCGAAAGCACACGAAGGTTCTACCGGTTTCATTCCGGCGGGAATGGACGGCAACGCTGAAGTTATCGGCGCGTACGCATGGGCGCACGAAATGTCATCCGGTAAAGATA‑CCCCGTCTGGTCACTGGGAAATTGCCGGTGTCCCGGTTCTGTTTGAGTGGGGATATTTCTCCGATCACGAAAACAGCTTCCCGCAAGAGCTGCTGGATAAACTGGTCGAACGCGCTAATCTGCCGGGTTACCTCGGTAACTGCCACTCTTCCGG > NC_000913/4619782‑4620048 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |