| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,006,415 | Δ1 bp | coding (464/543 nt) | zapC → | FtsZ stabilizer |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,006,413 | 0 | G | . | 100.0% | 128.7 / NA | 30 | coding (462/543 nt) | zapC | FtsZ stabilizer |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (13/17); total (13/17) | |||||||||||
ACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTG > NC_000913/1006313‑1006545 | aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 1:582678/139‑1 (MQ=255) gCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg > 1:29293/1‑139 (MQ=255) gCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg < 2:264707/139‑1 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt < 2:29293/139‑1 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:192230/1‑139 (MQ=255) ggTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg > 2:535752/1‑132 (MQ=255) ggTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 1:535752/132‑1 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCAtt < 2:694550/104‑1 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCAtt > 1:694550/1‑104 (MQ=255) tttGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTg < 2:300740/139‑1 (MQ=255) aCTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAAcgcg < 2:103714/139‑1 (MQ=255) ctgctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACtt < 2:517693/139‑1 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGa > 1:70829/1‑51 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 2:70829/51‑1 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCa < 1:481646/66‑1 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCa > 2:481646/1‑66 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAGCt < 2:551874/116‑1 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCACCt > 1:551874/1‑116 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTCAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:527776/1‑139 (MQ=255) tATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCtt < 1:751155/83‑1 (MQ=255) tATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCtt > 2:751155/1‑83 (MQ=255) tATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGc < 1:192230/139‑1 (MQ=255) tCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg < 2:324501/44‑1 (MQ=255) tCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 1:324501/1‑44 (MQ=255) tCGCGCGATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 1:864880/1‑139 (MQ=255) cgcgcgATGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAg > 2:268879/1‑139 (MQ=255) aTGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGt < 1:268879/139‑1 (MQ=255) tGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 2:468284/1‑106 (MQ=255) tGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 1:468284/106‑1 (MQ=255) tGCAGTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACGTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTg < 2:75416/139‑1 (MQ=255) | ACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTG > NC_000913/1006313‑1006545 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |