| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,821,867 | (A)8→7 | intergenic (‑248/+51) | chbB ← / ← osmE | N,N'‑diacetylchitobiose‑specific enzyme IIB component of PTS/osmotically‑inducible lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,821,860 | 0 | A | . | 100.0% | 392.3 / NA | 93 | intergenic (‑241/+58) | chbB/osmE | N,N'‑diacetylchitobiose‑specific enzyme IIB component of PTS/osmotically‑inducible lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (48/45); total (48/45) | |||||||||||
AGCAATAGTATTTCTTTGACCTTATAAATTGTTTCTCCTTGACCTGTGGTTATGACCCTCTTCACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCCAAAAAAAACCGGCGCAATGGCCGGTTTCCGTTGTTACTCAAGCTTTCAGACGAATTGATTACTTCGCAGCCTGTGGATCAGTGTCGTATTCAGCACAGGTCTGATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCAT > NC_000913/1821752‑1821994 | aGCAATAGTATTTCTTTGACCTTATAAATTGTTTCTCCTTGTCCTGTGGTTATGACCCTCTTCACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCC‑AAAAAAACCGGCGCAATGGCCGGttt < 1:426472/134‑1 (MQ=255)aGCAATAGTATTTCTTTGACCTTATAAATTGTTTCTCCTTGTCCTGTGGTTATGACCCTCTTCACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCC‑AAAAAAACCGGCGCAATGGCCGGttt > 2:426472/1‑134 (MQ=255)aGCAATAGTATTTCTTTGACCTTATAAATTGTTTCTCCTTGATCTGTGGTTATGACCCTCTTCACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCC‑AAAAAAACCGGCGCAATGGCCGGTTTCCgtt > 1:1103666/1‑139 (MQ=255)aGCAATAGTATTTCTTTGACCTTATAAATTGTTTCTCCTTGACCTGTGGTTATGACCCTCTTCACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCC‑AAAAAAACCGGCGCAATgg < 1:904979/127‑1 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(MQ=255) gtgGTTATGACCCTCTTCACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCC‑AAAAAAACCGGCGCAATGGCCGGTTTCCGTTGTTACTCAAGCTTTCAGACGAATTGATTACTTCGCAGCCTGTGGa < 1:604743/139‑1 (MQ=255) tgGTTATGACCCTCTTCACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCC‑AAAAAAACCGGCGCAATGGcc < 2:683756/83‑1 (MQ=255) tgGTTATGACCCTCTTCACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCC‑AAAAAAACCGGCGCAATGGcc > 1:683756/1‑83 (MQ=255) ggTTATGACCCTCTACACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCC‑AAAAAAACCGGCGCAATGGCCGGTTTCCGTTGTTACTCAAGCTTTCAGACGAATTGATTACTTCGCAGCCTGTGGATc > 2:1017087/1‑139 (MQ=255) aTGACCCTCTTCACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCC‑AAAAAAACCGGCGCAATGGCCGGTTTc > 1:538329/1‑84 (MQ=255) aTGACCCTCTTCACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCC‑AAAAAAACCGGCGCAATGGCCGGTTTc < 2:538329/84‑1 (MQ=255) aTGACCCTCTTCACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCC‑AAAAAAACCGGCGCAATGGCCGGTTTCCg > 1:1276427/1‑86 (MQ=255) aTGACCCTCTTCACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCC‑AAAAAAACCGGCGCAATGGCCGGTTTCCg < 2:1276427/86‑1 (MQ=255) tGACCCTCTTCACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCC‑AAAAAAACCGGCGCAATGGCCGGTTTCCGTTGTTACTCAAGCTTTCAGACGAATTGATTACTTCGCAGCCTGTGGATCAgtgt > 1:341592/1‑139 (MQ=255) gACCCTCTTCACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCC‑AAAAAAACCGGCGCAATGGCCGGTTTCCGTTGTTACTCAAGCTTTCAGACGAATTGATTACTTCGCAGCCTGTGGATCAGTGTc < 2:341592/139‑1 (MQ=255) gACCCTCTTCACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCC‑AAAAAAACCGGCGCAATGGCCGGTTTCCGTTGTTACTCAAGCTTTCAGACGAATTGATTACTTCGCAGCCTGTGGATCAGTGTc > 2:1352148/1‑139 (MQ=255) ccTCTTCACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCC‑AAAAAAACCGGCGCAATGGCCGGTTTCCGTTGTTACTCAAGCTTTCAGa > 2:1668121/1‑101 (MQ=255) ccTCTTCACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCC‑AAAAAAACCGGCGCAATGGCCGGTTTCCGTTGTTACTCAAGCTTTCAGa < 1:1668121/101‑1 (MQ=255) ccTCTTCACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCC‑AAAAAAACCGGCGCAATGGCCGGTTTCCGTTGTTACTCAAGCTTTCAGACGAATTGATTACTTCGCAGCCTGTGGAt < 1:140586/129‑1 (MQ=255) 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> 2:984468/1‑139 (MQ=255) | AGCAATAGTATTTCTTTGACCTTATAAATTGTTTCTCCTTGACCTGTGGTTATGACCCTCTTCACATTTCGGGCAAATAATTCGCGAAGATAATTAAGAACTCAGGCCAAAAAAAACCGGCGCAATGGCCGGTTTCCGTTGTTACTCAAGCTTTCAGACGAATTGATTACTTCGCAGCCTGTGGATCAGTGTCGTATTCAGCACAGGTCTGATAACCGGAGTTGATGACATGTCCGGTATCAT > NC_000913/1821752‑1821994 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |