| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,717,821 | (C)5→4 | coding (708/1038 nt) | yfiF ← | putative methyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,717,817 | 0 | C | . | 100.0% | 147.2 / NA | 36 | coding (712/1038 nt) | yfiF | putative methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base . (17/19); total (17/19) | |||||||||||
CCCTGCTCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGCCCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGCCAGAACGCAATCCTGCGCG > NC_000913/2717690‑2717947 | cccTGCTCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCcag < 1:693643/139‑1 (MQ=255) tGCTCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCcagcag > 1:21442/1‑139 (MQ=255) cTCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTg < 2:478976/139‑1 (MQ=255) cGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGcc < 1:930370/139‑1 (MQ=255) tGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCa < 2:21442/139‑1 (MQ=255) tGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCa > 2:326502/1‑139 (MQ=255) tACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAgccgcc > 2:655273/1‑106 (MQ=255) tACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAgccgcc < 1:655273/106‑1 (MQ=255) gcctgACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGcc > 2:1181029/1‑139 (MQ=255) cACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTg > 1:219814/1‑98 (MQ=255) cACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTg < 2:219814/98‑1 (MQ=255) cACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGca < 2:893258/139‑1 (MQ=255) aaTGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCAc < 1:318590/139‑1 (MQ=255) gttgcCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCa > 2:857665/1‑139 (MQ=255) ttgtCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGcatcat > 2:144697/1‑130 (MQ=255) ttgtCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGcatcat < 1:144697/130‑1 (MQ=255) ttgtCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATg > 2:189772/1‑131 (MQ=255) ttgtCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATg < 1:189772/131‑1 (MQ=255) gtCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTg > 1:446996/1‑83 (MQ=255) gtCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTg < 2:446996/83‑1 (MQ=255) ccAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATg < 1:926689/139‑1 (MQ=255) tctGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAg > 2:899387/1‑126 (MQ=255) tctGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAg < 1:899387/126‑1 (MQ=255) gcgcCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGc > 1:888960/1‑139 (MQ=255) gcgcCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGc > 2:64695/1‑139 (MQ=255) cgccgcCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCtt > 1:787025/1‑68 (MQ=255) cgccgcCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCtt < 2:787025/68‑1 (MQ=255) cgccgcCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGcc > 1:430293/1‑139 (MQ=255) gccgccTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGCCa < 1:1181029/139‑1 (MQ=255) ccTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTg < 2:139604/86‑1 (MQ=255) ccTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTg > 1:139604/1‑86 (MQ=255) ccTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAg > 2:393641/1‑117 (MQ=255) ccTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAg < 1:393641/117‑1 (MQ=255) cTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGCCAGAACg < 1:326502/139‑1 (MQ=255) tACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTc < 1:775618/117‑1 (MQ=255) tACGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTc > 2:775618/1‑117 (MQ=255) aCGGATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGCCAGAACGCAATCCTgcg < 1:354837/139‑1 (MQ=255) ggATAGCCG‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGCCAGAACGCAATCCTgcgcg > 2:72076/1‑139 (MQ=255) | CCCTGCTCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGCCCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGCCAGAACGCAATCCTGCGCG > NC_000913/2717690‑2717947 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |