| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,782,393 | (C)5→4 | coding (334/4581 nt) | ypjA ← | adhesin‑like autotransporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,782,389 | 0 | C | . | 100.0% | 514.6 / NA | 121 | coding (338/4581 nt) | ypjA | adhesin‑like autotransporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base . (61/60); total (61/60) | |||||||||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
CTACCACCATCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACCCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATACCCCGCCATGAAC > NC_000913/2782251‑2782522 | cTACCACCATCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATAc > 2:90186/1‑139 (MQ=255) tACCACCATCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATAcc < 2:1267786/139‑1 (MQ=255) tACCACCATCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATAcc < 1:1106099/139‑1 (MQ=255) accaTCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATAccccgt < 1:31073/139‑3 (MQ=255) tCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATg > 2:140558/1‑139 (MQ=255) aGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGa < 1:243140/139‑1 (MQ=255) ttCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGt > 2:604306/1‑139 (MQ=255) tCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATAccccgt > 1:235520/1‑122 (MQ=255) tCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATAccccgt < 2:235520/124‑3 (MQ=255) ccctccctCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTaa < 2:762778/139‑1 (MQ=255) ctccctcTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATg < 1:140558/139‑1 (MQ=255) tctACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCa < 1:401410/125‑1 (MQ=255) cgcgTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACCCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGtatta > 2:1035928/1‑139 (MQ=255) cgTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTCCCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTaa > 2:207658/1‑126 (MQ=255) cgTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTaa < 1:207658/126‑1 (MQ=255) cgTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTg < 2:316755/132‑1 (MQ=255) cgTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTattatt > 1:538300/1‑139 (MQ=255) aaGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCa > 1:835434/1‑115 (MQ=255) aaGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCa < 2:835434/115‑1 (MQ=255) gCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTg < 1:1035928/139‑1 (MQ=255) gCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTg < 1:604306/139‑1 (MQ=255) ttAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACaaa > 2:171859/1‑139 (MQ=255) tCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGtt < 2:544567/102‑1 (MQ=255) cGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCATAAAATTGtt > 1:926732/1‑137 (MQ=255) cGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGtt < 2:926732/137‑1 (MQ=255) gTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGa < 2:803744/85‑1 (MQ=255) gTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGa > 1:803744/1‑85 (MQ=255) ttCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGa < 2:446676/139‑1 (MQ=255) ccATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATg > 2:1042708/1‑136 (MQ=255) ccATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATg < 1:1042708/136‑1 (MQ=255) ccATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCATCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACt > 1:1112944/1‑139 (MQ=255) gCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGtt > 1:179871/1‑92 (MQ=255) aTACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTa > 2:78212/1‑89 (MQ=255) aTACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGtt > 2:438109/1‑95 (MQ=255) aTACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGtt < 1:438109/95‑1 (MQ=255) aTACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATc > 2:560045/1‑139 (MQ=255) aTACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCCATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTa < 1:78212/89‑1 (MQ=255) ccccTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGa > 1:608455/1‑139 (MQ=255) cccTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTTATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGat < 2:63510/139‑1 (MQ=255) cccTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGAc < 1:326206/124‑1 (MQ=255) cTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATAcc < 2:20946/52‑1 (MQ=255) cTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGat > 1:1341016/1‑137 (MQ=255) cTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGat < 2:1341016/137‑1 (MQ=255) cTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGa > 1:503414/1‑136 (MQ=255) cTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGa < 2:503414/136‑1 (MQ=255) tataAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATcca > 2:361283/1‑139 (MQ=255) aaCGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTaa < 2:1346168/76‑1 (MQ=255) aCGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGa < 1:90186/139‑1 (MQ=255) gTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGc < 1:105794/89‑1 (MQ=255) gTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGc > 2:105794/1‑89 (MQ=255) tCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATAccccgt < 1:1256132/45‑3 (MQ=255) tCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCa > 1:1329535/1‑65 (MQ=255) tCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTc > 2:1336101/1‑139 (MQ=255) ccTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATAcc > 1:923825/1‑40 (MQ=255) ccTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCa > 2:331644/1‑139 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGcc > 2:1163538/1‑62 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGcc < 1:1163538/62‑1 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTg > 1:608612/1‑76 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTg < 2:608612/76‑1 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGcc < 1:834873/91‑1 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGAc < 2:649862/109‑1 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGAc > 1:649862/1‑109 (MQ=255) cTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATccac > 2:781055/1‑130 (MQ=255) gATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGa < 1:120043/132‑1 (MQ=255) gATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGa > 2:120043/1‑132 (MQ=255) aTTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATaa < 1:171859/139‑1 (MQ=255) tGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGa < 2:608455/139‑1 (MQ=255) gCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGAc < 1:361283/139‑1 (MQ=255) cACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGc > 2:552033/1‑78 (MQ=255) cACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGc < 1:552033/78‑1 (MQ=255) cACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACtt < 1:1336101/139‑1 (MQ=255) ctctCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGa < 2:1422290/124‑1 (MQ=255) ctctCGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGa > 1:1422290/1‑124 (MQ=255) tctcGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTcc > 2:958779/1‑138 (MQ=255) tcGATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCAtt < 1:331644/139‑1 (MQ=255) gATTGTCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAAtt < 2:386258/36‑1 (MQ=255) tCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGt < 2:298482/37‑1 (MQ=255) tCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGt > 1:298482/1‑37 (MQ=255) tCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGtatta > 1:1380133/1‑61 (MQ=255) tCGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATAcc < 1:560045/139‑1 (MQ=255) cGTACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATAccc > 2:802244/1‑139 (MQ=255) tACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGAc < 1:263202/122‑1 (MQ=255) tACCTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGAc > 2:263202/1‑122 (MQ=255) ccTGTGGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGAc < 2:1308158/120‑1 (MQ=255) tgtgGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACaaaa < 1:491460/72‑1 (MQ=255) tgtgGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACaaaa > 2:491460/1‑72 (MQ=255) tgGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTg < 1:719200/47‑1 (MQ=255) tgGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTg < 2:1098123/47‑1 (MQ=255) tgGAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTg > 1:1098123/1‑47 (MQ=255) tgGAAATA‑CCCCGTCATGAAGTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCca > 2:840199/1‑65 (MQ=255) ggAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTaa < 2:448253/40‑1 (MQ=255) ggAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTaa > 1:448253/1‑40 (MQ=255) ggAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATg < 1:80142/42‑1 (MQ=255) ggAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATg > 2:80142/1‑42 (MQ=255) ggAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCca < 2:1150793/64‑1 (MQ=255) ggAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGAc < 1:568249/79‑1 (MQ=255) ggAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGa < 1:783871/104‑1 (MQ=255) ggAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATA‑CCCGCCATGAAc > 2:708602/1‑139 (MQ=255) ggAAATA‑CCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAACGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATACCCCGCCATGaa > 2:1080125/1‑139 (MQ=255) ggAAATA‑CCCCATCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATACCCCGCCATGaa < 2:1112944/139‑1 (MQ=255) | CTACCACCATCAATGAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGCTGATACCCCCTTTATAAACGTCCTGATTGCCACTCTCGATTGTCGTACCTGTGGAAATACCCCCGTCATGAATTGACTGTCTGCCACCGTTAATGGTTGTATTATTAGCCTGCCCCACAAAATTGTTATGACTTCCTATATCTTGATATCCACCAGATTCAATAAGACTTCCATTAGATACCCCGCCATGAAC > NC_000913/2782251‑2782522 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |