| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,833,009 | (G)5→4 | coding (582/807 nt) | xthA → | exonuclease III |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,833,005 | 0 | G | . | 100.0% | 233.1 / NA | 56 | coding (578/807 nt) | xthA | exonuclease III |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (33/23); total (33/23) | |||||||||||
ATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGC > NC_000913/1832869‑1833136 | attattGGCGATATGAATATCAGCCCAAGAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGAGCTGGCTGCGTACCGGT‑AATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATTAG‑Tggggg > 2:443809/1‑139 (MQ=255)aTTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTggg > 2:289428/1‑139 (MQ=255) atatGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGAt > 1:1297739/1‑139 (MQ=255) atatGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGAGAAGAAAACCGTCAGCGCTGGCTGCGTAACGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGCCGACCGCGAAAGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGAt > 2:1355794/1‑139 (MQ=255) tatCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTcc > 1:288571/1‑139 (MQ=255) tatCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTcc > 2:361050/1‑139 (MQ=255) aGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGt > 1:917484/1‑124 (MQ=255) aGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGt < 2:917484/124‑1 (MQ=255) cccTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATg > 1:734005/1‑139 (MQ=255) cTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCg < 1:361050/139‑1 (MQ=255) cTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCg > 2:443695/1‑139 (MQ=255) aCAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGaa > 2:220198/1‑139 (MQ=255) cTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCa > 1:628886/1‑139 (MQ=255) gATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAAc > 1:740714/1‑139 (MQ=255) gATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAAc > 2:429965/1‑139 (MQ=255) tatCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAAcag < 2:158914/139‑1 (MQ=255) tCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAAcagca < 1:429965/139‑1 (MQ=255) cGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAAcagcag > 1:1031031/1‑139 (MQ=255) cGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAAcagcag > 2:570655/1‑139 (MQ=255) ttGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGt < 1:570655/139‑1 (MQ=255) ggctgCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCa > 2:1003005/1‑139 (MQ=255) gctgCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTtctc < 2:15675/119‑1 (MQ=255) gctgCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTtctc > 1:15675/1‑119 (MQ=255) ggTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTgggg > 2:1361063/1‑59 (MQ=255) ggTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTgggg < 1:1361063/59‑1 (MQ=255) aaaTGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGa < 1:443695/139‑1 (MQ=255) aaTGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGAt > 2:520294/1‑64 (MQ=255) aaTGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGAt < 1:520294/64‑1 (MQ=255) aaTGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGAt > 1:1074896/1‑139 (MQ=255) tttCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATc < 1:9425/91‑1 (MQ=255) tttCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATc > 2:9425/1‑91 (MQ=255) ttCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCa < 1:435628/79‑1 (MQ=255) ttCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCa > 2:435628/1‑79 (MQ=255) ttCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCAt > 2:924600/1‑99 (MQ=255) ttCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCAt < 1:924600/99‑1 (MQ=255) ttCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTgg > 2:1145372/1‑139 (MQ=255) ttCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTgg > 1:567686/1‑139 (MQ=255) tCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGt < 2:264217/139‑1 (MQ=255) ccGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTgcg < 2:288571/139‑1 (MQ=255) ggAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCa < 1:289428/139‑1 (MQ=255) gAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCAt < 1:1145372/139‑1 (MQ=255) gAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCAt > 1:546622/1‑139 (MQ=255) agagCGCGAATGGATGGACAGCCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCg > 2:209563/1‑139 (MQ=255) gagCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGa < 2:567686/139‑1 (MQ=255) gcgcGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGAcc < 1:220198/139‑1 (MQ=255) gatggaCAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTTACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCg > 2:734664/1‑139 (MQ=255) gatggaCAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCg > 2:513550/1‑139 (MQ=255) tggaCAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTAc < 2:1302095/85‑1 (MQ=255) tggaCAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTAc > 1:1302095/1‑85 (MQ=255) tggaCAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGa > 1:716852/1‑105 (MQ=255) tggaCAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGa < 2:716852/105‑1 (MQ=255) tggaCAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCgcc > 1:631981/1‑139 (MQ=255) aCAGGCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCgccagc < 2:631981/139‑1 (MQ=255) gCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCa < 2:718072/35‑1 (MQ=25) gCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCa > 1:718072/1‑35 (MQ=25) gCTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAAc > 2:37472/1‑139 (MQ=255) cTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTc > 2:78775/1‑108 (MQ=255) cTGATGAGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTc < 1:78775/108‑1 (MQ=255) tgatgaGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCg > 2:962331/1‑139 (MQ=255) gatgaGCT‑GGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGc < 1:734664/139‑1 (MQ=255) | ATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGC > NC_000913/1832869‑1833136 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |