| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,248,939 | T→C | intergenic (+117/‑30) | mzrA → / → yqjC | modulator of EnvZ/OmpR regulon/DUF1090 family putative periplasmic protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,248,939 | 0 | T | C | 98.2% | 382.0 / ‑3.4 | 108 | intergenic (+117/‑30) | mzrA/yqjC | modulator of EnvZ/OmpR regulon/DUF1090 family putative periplasmic protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (53/53); total (54/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.31e-01 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
ACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGAGATCA > NC_000913/3248803‑3249074 | aCTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAg > 1:1736275/1‑139 (MQ=255) cATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCg < 2:115672/139‑1 (MQ=255) cATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCg < 1:2489/139‑1 (MQ=255) cGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAAt < 2:1736275/139‑1 (MQ=255) cGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAAt < 1:804852/139‑1 (MQ=255) gCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATc < 1:1674818/139‑1 (MQ=255) gCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATc < 1:17878/139‑1 (MQ=255) tAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGa < 2:909415/139‑1 (MQ=255) tAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGa < 2:1595177/139‑1 (MQ=255) cTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATg < 1:141908/134‑1 (MQ=255) cTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATg > 2:141908/1‑134 (MQ=255) ccTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTc > 2:240997/1‑139 (MQ=255) ttATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGa < 1:240997/139‑1 (MQ=255) tCCGAATCATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAAt < 2:655429/117‑1 (MQ=255) tCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAAt > 1:655429/1‑117 (MQ=255) tCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAAt > 1:193343/1‑117 (MQ=255) tCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAAt < 2:193343/117‑1 (MQ=255) atCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAAt < 2:1493386/107‑1 (MQ=255) atCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAAt > 1:1493386/1‑107 (MQ=255) atCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCa > 2:1315996/1‑139 (MQ=255) atCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTCGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGaa > 2:1155750/1‑127 (MQ=255) atCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTCGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGaa < 1:1155750/127‑1 (MQ=255) ctcactTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGc > 2:140148/1‑139 (MQ=255) ctcactTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGc > 1:1422711/1‑139 (MQ=255) tcactTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCCATGATTAATGATGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACATGTCCGAATCCCAATGGAGGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCt > 1:538632/1‑139 (MQ=255) actTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCttt > 1:892368/1‑139 (MQ=255) actTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCttt > 2:1448717/1‑139 (MQ=255) tttGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAg > 2:326710/1‑139 (MQ=255) tttGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAg > 1:1636053/1‑139 (MQ=255) tGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATAc < 2:316883/124‑1 (MQ=255) tGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATAc > 1:316883/1‑124 (MQ=255) gTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGa > 1:772282/1‑103 (MQ=255) gTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGa < 2:1450981/103‑1 (MQ=255) gTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGa > 1:1450981/1‑103 (MQ=255) gTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGa < 2:772282/103‑1 (MQ=255) gTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGt < 2:1748832/139‑1 (MQ=255) gTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGt > 1:438918/1‑139 (MQ=255) aTTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGGCAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTtc < 1:1315996/139‑1 (MQ=255) tttCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTtct > 1:458196/1‑139 (MQ=255) tCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTtctct > 2:1093423/1‑139 (MQ=255) cACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTtctctc < 2:438918/139‑1 (MQ=255) ccGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCtt < 1:1755067/139‑1 (MQ=255) ccGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCtt < 1:326710/139‑1 (MQ=255) tATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTg > 1:206631/1‑139 (MQ=255) aTTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCgg < 1:1093423/139‑1 (MQ=255) ttAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGt < 2:1075739/139‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAg > 1:169132/1‑139 (MQ=255) aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGt < 2:395210/60‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAAt > 2:185017/1‑66 (MQ=255) aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCaa > 1:924268/1‑83 (MQ=255) aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCaa < 2:555916/83‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCaa < 2:924268/83‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCaa > 1:555916/1‑83 (MQ=255) aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGttt > 1:851399/1‑113 (MQ=255) aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGttt < 2:851399/113‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGt > 2:193778/1‑139 (MQ=255) aTGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGt < 2:458196/139‑1 (MQ=255) ggCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTg < 2:3575/118‑1 (MQ=255) ggCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTg > 1:3575/1‑118 (MQ=255) gCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGc < 1:193778/139‑1 (MQ=255) gCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGc > 2:1817165/1‑139 (MQ=255) gtTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTAc < 2:1422711/139‑1 (MQ=255) ttAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTAcc < 2:892368/139‑1 (MQ=255) aaCACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCt > 1:641124/1‑139 (MQ=255) acTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCtgtg < 1:1817165/139‑1 (MQ=255) tACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTcc > 2:311800/1‑43 (MQ=255) tACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTcc < 1:311800/43‑1 (MQ=255) tACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCtt > 2:1068964/1‑108 (MQ=255) tACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCtt < 1:1068964/108‑1 (MQ=255) ccGCTTCGTTGTTTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGa > 1:323017/1‑54 (MQ=255) ccGCTTCGTTGTTTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGa < 2:323017/54‑1 (MQ=255) ccGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAg > 1:336587/1‑37 (MQ=255) ccGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGa < 2:1737357/54‑1 (MQ=255) ccGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGa > 1:1737357/1‑54 (MQ=255) ccGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCaa > 2:1079299/1‑62 (MQ=255) ccGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGc > 2:356695/1‑123 (MQ=255) ccGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGc < 1:356695/123‑1 (MQ=255) ccGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAg > 2:1270708/1‑139 (MQ=255) ccGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAg > 2:539275/1‑139 (MQ=255) ccGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCAAATCACAATGGAAGGTTCaa < 1:1079299/62‑1 (MQ=255) ttCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGaaa < 2:641124/139‑1 (MQ=255) ttGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAAt < 1:1241255/37‑1 (MQ=255) ttGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAAt > 2:1241255/1‑37 (MQ=255) ttGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGa < 2:1636053/139‑1 (MQ=255) ggACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGtt < 1:215708/45‑1 (MQ=255) ggACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGtt > 2:215708/1‑45 (MQ=255) ggACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCaaaa < 1:539275/139‑1 (MQ=255) ggACAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCaaaa < 1:1270708/139‑1 (MQ=255) tcAATCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAg > 1:1144376/2‑70 (MQ=255) acgaTCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAg < 2:1144376/67‑1 (MQ=255) aaTCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGa < 2:684043/129‑1 (MQ=255) aaTCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGa > 1:684043/1‑129 (MQ=255) tCGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCt > 1:98831/1‑139 (MQ=255) cGTT‑CCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAg < 1:1364127/65‑1 (MQ=255) ccTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAg < 1:1345964/83‑1 (MQ=255) ccTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAg > 2:1345964/1‑83 (MQ=255) ccTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTa < 1:1651675/95‑1 (MQ=255) ccTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTa > 2:1651675/1‑95 (MQ=255) ttGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGgaga > 1:1672790/1‑139 (MQ=255) tAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGAGATCa > 1:1117450/1‑139 (MQ=255) | ACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTT‑CCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGAGATCA > NC_000913/3248803‑3249074 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |