| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_010468 | 3033060 = | 125 (0.130) | coding (1048/1422 nt) | ECOLC_RS14830 | phage tail protein | |||||
Only 100 of 658 total aligned reads displayed.
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TCTCCCAAACCAAGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAG‑CGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGT < 1:1011113/235‑1 CCCAAACCACGTTATTGTAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAAATGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTG‑CAGTCGCCTTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCAGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATAGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGTGCTT < 2:7785039/298‑1 AACCAAGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAG‑CGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGTGCTTTTAG < 2:1546789/298‑1 ACCAAGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAG‑CGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGTGCTTTTAGT < 1:5020698/298‑1 ACCAAGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAG‑CGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGTGCTTTTAGT < 1:1787134/298‑1 CCAAGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAG‑CGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGTGCTTTTAGTG > 2:3074164/1‑298 CAAGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAG‑CGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGTGCTTTTAGTGC > 1:3436029/1‑298 CAAGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAG‑CGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGTGCTTTTAGTGC > 1:1280017/1‑298 AAGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAG‑CGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGTGCTTTTAGTGCC < 1:3780343/298‑1 AAACTTTCCAGAGTCTGGTCGTTAGTTCGTGAAGTCCAGATTCCCCAATAGTGGTTATGACTGACAATAGCACCATCCTGAAGCGTTAATAATCCCCTTCCGTTATCCACTCCACGCCCGTCATCCCAGCCCCGAATAAACTCACCGCGTAAATCAGGTAATTTATTTGTCGGGTAAGCCTTTGCCAGTTCCGGGTATTCTTCAGCAGAAAAAGCCGCACCGTTGCATTTCAGCCAGCCTGTTGGCGGAGTGGCGGAAGGCCACGGAACAGGCACGCCAACGGGTAATGCTGAGCCTTCTCCCAAACCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_010468/3031512‑3031203‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tctcccaaaccaaGGTATGTGAGAAGACCAGCTACATCCTTTCCACTCAAATTGGTAAGCGTATTGTCCAGCGGTTGTTTACCTGACAG‑CGCATTAAGCATTGTCGTGGCAAAGTTCGGATCATTCCCCAGTGCCGCCGCCAGTTCGTTCAGTGTATCCAGTGCCGCAGGTGCAGAACCCACCATTGCCGCAATCGCCGATTTCACAAATGCCGTGGTGGCAATCTGTGTATTGTTGACCGACTGCGCCGCCGTGGGGGCTGTTGGCGTTCCGGTGAGTGCCGGACTCGACAACGGTGCTTTTAGTGCCA > NC_010468/3033060‑3033356 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |