| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,253,930 | C→A | 5.6% | W95C (TGG→TGT) | yhaJ ← | LysR family putative transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,253,930 | 0 | C | A | 5.6% | 230.4 / 4.2 | 72 | W95C (TGG→TGT) | yhaJ | LysR family putative transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/30); new base A (2/2); total (40/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.60e-02 | |||||||||||
GGTTCCGGCTCCTGATGAATCGGGTGATCAGGCGCGGCAACGTAGACGTTCATTAACGTATAGAGCTTGCGCGAGTTGATCTCCGACGAGGAACGAAAATGCATATCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGTCCCAGCTCATCCGCCGCCGCCGCAAAACTGCCCCGGCGATCGATCGCATCCATAACCCGTAGTGCTTCCAGCGTTAATGCCCTTTCTTTG > NC_000913/3253652‑3254209 | ggTTCCGGCTCCTGATGAATCGGGTGATCAGGCGCGGCAACGTAGACGTTCATTAACGTATAGAGCTTGCGCGAGTTGATCTCCGACGAGGAACGAAAATGCATATCCGGCGCGCTAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCGTTAGCCGCCAGTTTGCCGATTAACGGGAAAAAGGAAGGTGTCGGTACCAGCTCGTCGGT‑ACAACTGGTGGAATGGGTTTCCCa > 2:642041/1‑281 (MQ=255)ggTTCCGGCTCCTGATGAATCGGGTGATCAGGCGCGGCAACGTAGACGTTCATTAACGTATAGAGCTTGCGCGAGTTGATCCCCGACGAGGAACGAAAATGCATATCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGCTGATTGCCAGCTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACCA‑CGGTGAGATGCCATTCCCa > 1:239586/1‑281 (MQ=255) tgatgaATCGGGTGATCAGGCTCGGCAACGTAGACGTTCATTAACGTATAGAGCTTGCGCGAGTTGATCTCCGACGAGGAACGAAAATGCATATCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGAGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGGAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACTA‑TGGGGAGGTGCGGTTCCCAACcgcgggcgg > 2:315977/1‑279 (MQ=255) tgatgaATCGGGTGATCAGGCGCGGCAACGTAGACGTTCATTAACGTATAGAGCTTGCGCGAGTTGATCTCCGACGAGGAACGAAAATGCATATCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCGTCGGTCACAA‑TGGTGGGTTTGGTTTCCCAAcccgccgcgg > 2:544795/1‑272 (MQ=255) aTCGAGTGATCAGGCAACGAACCGTAGACGTTGAGTAGCGTGTAGCGCTTGCGCGAGTTGATCTCCGCAGGGGAGTGAACATGCATATCCGGCGCGATAACACTATCCGCCCGCCCCTGCTCGAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTc < 2:239586/281‑1 (MQ=255) aTCAGGCGCGGCAACGTAGACGTTCATTAACGTATAGAGCTTGCGCGAGTTGATCTCCGACGAGGAACGAAAATGCATATCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGGAGGTGTCGGTAACAGCGCTTCGGTCACCA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACGGCGCGCGAGAGCTTCCGCAtacg > 2:765227/1‑278 (MQ=255) aGGCGCGGCAACGTAGACGTTCATTAACGTATAGAGCTTGCGCGAGTTGATCTCCGACGAGGAACGAAAATGCATATCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCagta < 1:851881/280‑1 (MQ=255) gCAACGTAGACGTTCATTAACGTATAGAGCTTGCGCGAGTTGATCTCCGACGAGGAACGAAAATGCATATCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGttt > 1:1042248/1‑281 (MQ=255) aTTAACGTATAGAGCTTGCGCGAGTTGATCTCCGACGAGGAACGAAAATGCATATCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAg < 1:765227/281‑1 (MQ=255) agCTTGCGCGAGTTGATCTCCGACGAGGAACGAAAATGCATATCCGGCGCGATAACAATATCAGCCCGCCCCTGCTCCAGCAGTTCCCACGCCTCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCCGTAGCAAGGTTATCTGCGGCCACCAGCAAAACAGGccc > 1:466927/1‑281 (MQ=255) tGCGCGAGTTGATCTCCGACGAGGAACGAAAATGCATATCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGc > 1:349763/1‑281 (MQ=255) tGCGCGAGTTGATCTCCGACGAGGAACGAAAATGCATATCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGc > 1:124802/1‑281 (MQ=255) tGCGCGAGTTGATCTCCGACGAGGAACGAAAATGCATATCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGGTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCCACCGCCCGCGAGAGCTTCCGCATCAGCAGGCCGTTTATCTGCCGCTTCCAGAAAAACGCGCCCACGc > 2:244918/1‑281 (MQ=255) 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ttGATCTCCGACGAGGAACGAAAATGCATATCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTCTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCCGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTCCCAGCCCTTCGGTCACAA‑TGGGGAGCTGCGTTTCCCAACCACGCGCCAGAGCTCCACCATTAGTAGGC‑GGTTATCTGCGGCTGCCAGCAAAACGCGCGCCAGCCCcaacaa > 2:1080457/1‑280 (MQ=255) aCGAAAATGCATATCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTgg < 1:315977/281‑1 (MQ=255) tCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCGTCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACg < 1:971349/281‑1 (MQ=255) cgcgATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGc > 1:1105540/1‑281 (MQ=255) aaCAATAACGGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGc < 1:908178/281‑1 (MQ=255) tCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGAGTCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTACCTGCGGATTCCAGCAAAACGCCCCCTCGCCCCAACAACATCCCCCCGACACTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGGCGGGTCaa > 2:706037/1‑280 (MQ=255) cccgcccCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCACAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACg < 1:696788/259‑1 (MQ=255) ccgcccCTGCTCCAGCCGTTCCCCCGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGca < 1:606196/281‑1 (MQ=255) cgcccCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCAAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCCCGTCCCAAAAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCCAGCGGTCAAACAGca > 1:1059514/1‑280 (MQ=255) cgcccCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCACAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCCCCCCAAAAACATCCTCCCGACATTGGGGAATTTGGTACGATGGCCCCAGccaggtcactttaa > 2:696788/1‑268 (MQ=255) cgcccCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCACAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGGCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGGGCCCTCGCCCCAAAAACATCCTCCCGACATTGGGGAATTTGGTCCCTAGGCCCGAGCGGTCAAACAGcc > 2:261901/1‑279 (MQ=255) tGCTCCAACCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATAGCCAGATGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCACTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACCACTTCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGTCaaa < 1:496837/269‑1 (MQ=255) ccccAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTTTCGATTAACGGGAAAAAGGCTGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGTTCACCA‑TGGTTAGCTGCGTTTCCCAAACGCGCGCGAGAGCGTCCTCATCAGCTGTCAGTTTATCTGCGGATTCCAGCAAAACGCGCTCTTGCTCCAACAACCTCCTCCCGAAATGGGTGAATTTGGCCCGATGGCCCGTCTGGTCAAAACTcaccacgccgg > 2:496837/3‑276 (MQ=255) aGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCCTTAGTTGTAAGTTTATCTGCGGCTTCCAGAAAAGCGCGCCCTCGCTCCAACCATATCCTCCCCACGTTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGTGCGGCGAAAcaccaccaccacaagct > 2:603180/1‑272 (MQ=255) gCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGTCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGctct > 1:1072135/1‑281 (MQ=255) gCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGCTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCg > 1:103443/1‑159 (MQ=255) gCCGTGCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCg < 2:103443/159‑1 (MQ=255) tCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACACCCAGCTCttcttc > 1:246356/1‑281 (MQ=255) cccACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGAGTTCCAGTTGTGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCCGAACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTCAGATGCGTTTCCTTACCCCGCCAGTGAGCTTCCGCCTCAGTAGTCAGTTCATCTGCGCCTTCCAGCAAAACCCGCTCTCGCCACAACAACATCCTCCCGATATTGGTGTATTTGGGACGAGAGACCCTGCGGTCCAAGACCACCACAttgagatctccct > 2:977968/1‑267 (MQ=255) 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cTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCCGTTCGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGCCGGTACCAGCGCTTCGTTAACAA‑TGGTGAGATGAGATGCCCAATCGCGAGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGCCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCCCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGATCGGTCAAACAGCCCCACATCAAGCTCCTCTTACAGTTTTTGCATGGTGTAGCTa > 2:725009/1‑281 (MQ=255) tgatgaTTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGTCaaa < 1:453077/232‑1 (MQ=255) tgatgaTTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGTCaaa > 2:453077/1‑232 (MQ=255) 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ggTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTCTATCTGTGGTTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGTGCGGTCAACCAGCACTACATCCACCCCTCCTTCCAGTTCTTGCAGGGTGTAGCTAACTGCGGAAGGTACGCGCCCCACATCACCCGTCGCCGCCGCAAAACTGCCCCGCCGatcgatcg > 2:336136/1‑280 (MQ=255) ggTGCCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACCTCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGTCCCAGCTCATCCGCCGCCGCCGCAAAACTGCCCCGGCGatcgatcg < 1:753011/280‑1 (MQ=255) gtgtCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCgg > 1:356437/1‑164 (MQ=255) gtgtCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCgg < 2:356437/164‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGTCCCAGCTCAACCGCCGCCGCCGCAAACCTGCCCCGGCGATCGCTCGCAACAATAACCCGTAGCGCTTCCAGCGTTAATGccc > 2:69965/1‑280 (MQ=255) cGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCATCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCAGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCa < 1:453409/167‑1 (MQ=255) cccAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGTCACACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGTCCCAGCCCATCCGCCGCCGCCGCAAAACTGCCCCGGCGATCGATCGCATCCCTAACCCCTAGTGCTCCCAGCGTTAATCCActttctttt > 2:39696/1‑280 (MQ=255) | GGTTCCGGCTCCTGATGAATCGGGTGATCAGGCGCGGCAACGTAGACGTTCATTAACGTATAGAGCTTGCGCGAGTTGATCTCCGACGAGGAACGAAAATGCATATCCGGCGCGATAACAATATCCGCCCGCCCCTGCTCCAGCCGTTCCCACGCCCCCGCCAGCACTTCTGTGATGATTGCCAGTTGGGTATTGGCTTTTGCCGCCAGTTTGTCGATTAACGGGAAAAAGGCAGGTGTCGGTACCAGCGCTTCGGTCACAA‑TGGTGAGATGCGTTTCCCAACCGCGCGCGAGAGCTTCCGCATCAGTAGTCAGTTTATCTGCGGCTTCCAGCAAAACGCGCCCTCGCTCCAACAACATCCTCCCGACATTGGTGAATTTGGTACGATGGCCCGAGCGGTCAAACAGCACCACATCCAGCTCTTCTTCCAGTTTTTGCATGGTGTAGCTAAGTGCGGAAGGCACGCGTCCCAGCTCATCCGCCGCCGCCGCAAAACTGCCCCGGCGATCGATCGCATCCATAACCCGTAGTGCTTCCAGCGTTAATGCCCTTTCTTTG > NC_000913/3253652‑3254209 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |