| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1096961 = | 142 (0.660) | 79 (0.570) | 3/288 | 13.6 | 46.8% | intergenic (+132/+604) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser |
| ? | NC_000913 | = 1097503 | 88 (0.640) | intergenic (+674/+62) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
GCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGA > NC_000913/1096720‑1097211 | gCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTCACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑aa > 1:2149034/1‑251 (MQ=255) ttAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑aaaa > 1:1245100/1‑251 (MQ=255) aTTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGCTTTTATGATGGCATGTGACATGTCTTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGCAGTGACCAGCTAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCGCGCCA‑TAACAGACGTGGGCGTGGCCACCCGGTGTGTGCAATATCCG‑AAAAAAAAGCCCGt > 2:1508750/1‑251 (MQ=255) aTTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGCCAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑CAAAAAAAGCCCGt > 1:1314195/1‑251 (MQ=255) aTTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCgg > 2:566977/1‑222 (MQ=255) aTTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGt > 2:1724046/1‑251 (MQ=255) aTTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGt > 1:746198/1‑251 (MQ=255) aTTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGt > 1:153736/1‑251 (MQ=255) aTTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGt < 2:502930/251‑1 (MQ=255) aTTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGt > 1:1019365/1‑251 (MQ=255) aTTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGGGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGt > 2:785344/1‑251 (MQ=255) aTTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTATGTACTCTCTTGCGTATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCAAGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGAAGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTTTGCAATATCCG‑AAAAAAAAGCCTGt > 2:1103973/1‑251 (MQ=255) tttttCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTAc < 1:13855/251‑1 (MQ=255) tttttCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTAc < 2:746139/251‑1 (MQ=255) cTATTGTCGATTCCGCTGGCATAACGATTTTATGATAGCATGGGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGATGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCg < 2:148708/251‑1 (MQ=255) aTTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTa < 1:1724218/251‑1 (MQ=255) ttGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTAc > 1:1551576/1‑251 (MQ=255) tcgattctgtggtcATAACGATTTTATGAAGGAAGTTGACATGTGTTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAATAGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAg < 2:203064/238‑1 (MQ=255) cggttCCTCTGGCTTAACGATTTTATGTTGGCATGTTACATTTTGTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGGGGAAGTTATAGGAAGTTACCAGATAAAACATCTATGTTCTTTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGATTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGc < 2:1278312/248‑1 (MQ=255) cGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATTGCATGTGAAATTTATTTCCGTTTGGGGAATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGc < 2:1245008/251‑1 (MQ=255) aaTAACGATTTTATCATGGACTGTGAAATGTATTTCCGTTGGGTGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACAAGCTAATAAATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGCCTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAat < 1:1368942/250‑1 (MQ=39) ggCATGTGACATGTATTTCTGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCC‑TAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAggggggg > 1:991479/1‑251 (MQ=255) 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tttCCCCTCGCCA‑CAACGGACGGGGGGGGGGGCACCCGTTGTGTGCAATATACA‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTAc < 1:1356057/251‑1 (MQ=255) tgtCCCCCCGCCCATAAC‑GACGTGGGGGGGGGAACCCTGTGTGTGAAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACCTTCGTACTAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTAc < 2:1285431/249‑1 (MQ=11) ttCCCCTCGCCC‑TAACGGAGGTGGGCGGGGGCACCCGTGGTGTGCAATATACGAAAAAAAAAGCCCGGACTTTCGTCCGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGGGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGTGAAATACACGAAAAAAAAGCCCGTAc < 2:1781238/251‑1 (MQ=14) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |