| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 3607577 | 134 (1.020) | 3 (0.020) | 3/486 | NT | 2.4% | coding (1128/2199 nt) | zntA | zinc, cobalt and lead efflux system |
| ? | NC_000913 | = 3607669 | 114 (0.900) | coding (1220/2199 nt) | zntA | zinc, cobalt and lead efflux system | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
TGAAAGCGCCCTGACCGGCGAATCCATTCCGGTGGAGCGCGCAACGGGCGATAAAGTCCCTGCTGGTGCCACCAGCGTAGACCGTCTGGTGACGTTGGAAGTGCTGTCAGAACCGGGAGCCAGCGCCATTGACCGGATTCTGAAACTGATCGAAGAAGCCGAAGAGCGTCGCGCTCCCATTGAGCGGTTTATCGACCGTTTCAGCCGTATCTATACGCCCGCGATTATGGCCGTCGCTCTGCTGGTGACGCTGGTGCCACCGCTGCTGTTTGCCGCCAGCTGGCA‑GGAGTGGATTTATAAAGGGCTGACGCTGCTGCTGATTGGCTGCCCGTGTGCGTTAGTTATCTCAACGCCTGCGGCGATTACCTCCGGGCTGGCGGCGGCAGCGCGTCGTGGGGCGTTGATTAAAGGCGGAGCGGCGCTGGAACAGCTGGGTCGTGTTACTCAGG‑TGGCGTTTGATAAAACCGGTACGCTGACCGTCGGTAAACCGCGCGTTACCGCGATTCATCCGGCAACGGGTATTAGTGAATCTGAACTGCTGACACTGGCGGCGGCGGTCGAGCAA > NC_000913/3607298‑3607862 | tgaAAGCGCCCTGACCGGCGAATCCATTCCGGTGGAGCGCGCAACGGGCGATAAAGTCCCTGCTGGTGCCACCAGCGTAGACCGTCTGGTGACGTTGGAAGTGCTGTCAGAACCGGGAGCCAGCGCCATTGACCGGATTCTGAAACTGATCGAAGAAGCCGAAGAGCGTCGCGCTCCCATTGAGCGGTTTATCGACCGTTTCAGCCGTATCTATACGCCCGCGATTATGGCCGTCGCTCTGCTGGTGACGCTGGTGCCACCGCTGCTGTTTGCCGCCAGCTGGCA‑GGAg < 2:318643/289‑1 (MQ=255)tgaAAGCGCCCTGACCGGCGAATCCATTCCGGTGGAGCGCGCAACGGGCGATAAAGTCCCTGCTGGTGCCACCAGCGTAGACCGTCTGGTGACGTTGGAAGTGCTGTCAGAACCGGGAGCCAGCGCCATTGACCGGATTCTGAAACTGATCGAAGAAGCCGAAGAGCGTCGCGCTCCCATTGAGCGGTTTATCGACCGTTTCAGCCGTATCTATACGCCCGCGATTATGGCCGTCGCTCTGCTGGTGACGCTGGTGCCACCGCTGCTGTTTGCCGCCAGCTGGCA‑GGAg < 1:355976/289‑1 (MQ=255)tgaAAGCGCCCTGACCGGCGAATCCATTCCGGTGGAGCGCGCAACGGGCGATAAAGTCCCTGCTGGTGCCACCAGCGTAGACCGTCTGGTGACGTTGGAAGTGCTGTCAGAACCGGGAGCCAGCGCCATTGACCGGATTCTGAAACTGATCGAAGAAGCCGAAGAGCGTCGCGCTCCCATTGAGCGGTTTATCGACCGTTTCAGCCGTATCTATACGCCCGCGATTATGGCCGTCGCTCTGCTGGTGACGCTGGTGCCACCGCTGCTGTTTGCCGCCAGCTGGCA‑GGAg < 1:271394/289‑1 (MQ=255)tgaAAGCGCCCGGACCGGGGAATCCATTCCGGTGGGGCGGGCAACGGGCGATAAAGTCCCTGCTGGTGCCACCAGCGTAGACCGTCTGGTGACGTTGGAAGTGCTGTCAGAACCGGGAGCCAGCGCCATTGACCGGATTCTGAAACTGATCGAAGAAGCCGAAGAGCGTCGCGCTCCCATTGAGCGGTTTATCGACCGTTTCAGCCGTATCTATACGCCCGCGATTATGGCCGTCGCTCTGCTGGTGACGCTGGTGCCACCGCTGCTGTTTGCCGCCAGCTGGCA‑GGAg < 2:621956/289‑1 (MQ=255) gaaGCGCCCTGACCGGCGAATCCATTCCGGTGGAGCGCGCAACGGGCGATAAAGTCCCTGCTGATGCCACCAGCGTAGACCGTCTGGTGACGTTGGAAGTGCTGTCAGAACCGGGAGCCAGCGCCATTGACCGGATTCTGAAACTGATCGAAGAAGCCGAAGAGCGTCGCGCTCCCATTGAGCGGTTTATCGACCGTTTCAGCCGTATCTATACGCCCGCGATTATGGCCGTCGCTCTGCTGGTGACGCTGGTGCCACCGCTGCTGTTTGCCGCCAGCTGGCA‑GGAGt < 2:778313/287‑1 (MQ=255) ggccTGACCGGCGAATCCAGTCCGGTGGGGCGCGCAACGGGCGATAAAGTCCCTGCTGGTGCGACCAGCGTAGACCGTCTGGTGACGTTGGAAGTGCTGTCAGAACCGGGAGCCAGCGCCATTGACCGGATTCTGAAACTGATCGAAGAAGCCGAAGAGCGTCGCGCTCCCATTGAGCGGTTTATCGACCGTTTCAGCCGTATCTATACGCCCGCGATTATGGCCGTCGCTCTGCTGGTGACGCTGGTGCCACCGCTGCTGTTTGCCGCCAGATGGCA‑GGAGTGGAt < 1:958375/285‑1 (MQ=255) ccTGACCGGCGAATCCATTCCGGTGGAGCGCGCAACGGGCGATAAAGTCCCTGCTGGTGCCACCAGCGTAGACCGTCTGGTGACGTTGGAAGTGCTGTCAGAACCGGGAGCCAGCGCCATTGACCGGATTCTGAAACTGATCGAAGAAGCCGAAGAGCGTCGCGCTCCCATTGAGCTGTTTATCGACCGTTTCAGCCGTATCTATACGCCCGCGATTATGGCCGTCGCTCTGCTGGTGACGCTGGTGCCACCGCTGCTGTTTGCAGCCAGCTGGCA‑GGGGTGGATTtat > 1:703259/1‑289 (MQ=255) tGACCGGCGAATCCATTCCGGTGGAGCGCGCAACGGGCGATAAAGTCCCTGCTGGTGCCACCAGCGTAGACCGTCGGGTGACGTTGGAAGTGCTGTCAGAACCGGGAGCCAGCGCCATTGACCGGATTCTGAAACTGATCGAAGAAGCCGAAGAGCGTCGCGCTCCCATTGAGCGGTTTATCGACCGTTTCAGCCGTATCTATACGCCCGCGATTATGGCCGTCGCTCTGCTGGTGACGCTGGTGCCACCGCTGCTGTTTGCCGCCAGCTGGCA‑GGAGTGGATTTATaa < 1:860167/289‑1 (MQ=255) cGAATCCATTCCGGTGGAGCGCGCAACGGGCGATAAAGTCCCTGCTGGTGCCACCAGCGTAGACCGTCTGGTGACGTTGGAAGTGCTGTCAGAACCGGGAGCCAGCGCCATTGACCGGATTCTGAAACTGATCGAAGAAGCCGAAGAGCGTCGCGCTCCCATTGAGCGGTTTATCGACCGTTTCAGCCGTATCTATACGCCCGCGATTATGGCCGTCGCTCTGCTGGTGACGCTGGTGCCACCGCTGCTGTTTGCCGCCAGCTGGCA‑GGAGTGGATTTATAAAGGGCt < 1:390475/288‑1 (MQ=255) aTTCCGGTGGAGCGCGCAACGGGCGATAAAGTCCCTGCTGGTGCCACCAGCGTAGACCGTCTGGTGACGTTGGAAGTGCTGTCAGAACCGGGAGCCAGCGCCATTGACCGGATTCTGAAACTGATCGAAGAAGCCGAAGAGCGTCGCGCTCCCATTGAGCGGTTTATCGACCGTTTCAGCCGTATCTATACGCCCGCGATTATGGCCGTCGCTCTGCTGGTGACGCTGGTGCCACCGCTGCTGTTTGCCGCCAGCTGGCA‑GGAGTGGATTTATAAAGGGCTGACgctgc < 1:84453/289‑1 (MQ=255) 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gctgGTGCCACCAGCGTAGACCGTCTGGTGACGTTGGAAGTGCTGTCAGAACCGGGAGCCAGCGCCATTGACCGGATTCTGAAACTGATCGAAGAAGCCGAAGAGCGTCGCGCTCCCATTGAGCGGTTTATCGACCGTTTCAGCCGTATCTATACGCCCGCGATTATGGCCGTCGCTCTGCTGGTGACGCTGGTGCCACCGCTGCTGTTTGCCGCCAGCTGGCA‑GGAg > 1:1156225/1‑228 (MQ=255) gctgGTGCCACCAGCGTAGACCGTCTGGTGACGTTGGAAGTGCTGTCAGAACCGGGAGCCAGCGCCATTGACCGGATTCTGAAACTGATCGAAGAAGCCGAAGAGCGTCGCGCTCCCATTGAGCGGTTTATCGACCGTTTCAGCCGTATCTATACGCCCGCGATTATGGCCGTCGCTCTGCTGGTGACGCTGGTGCCACCGCTGCTGTTTGCCGCCAGCTGGCA‑GGAGTGGATTTATAAAGGGCTGACGCTGCTGCTGATTGGCTGCCCGTGTGCGTTAGTTATCTCa > 1:412137/1‑288 (MQ=255) cgccggCGTAGACCGGCTGGTGACGTTGGAAGTGCTGTCAGAACCGGGAGCCAGCGCCATTGACCGGATTCTGAAACTGATCGAAGAAGCCGAAGGGCGTCGCGCTCCCATTGAGCGGTTTATCGACCGTTTCAGCCGTATCTATACGCCCGCGATTATGGCCGTCGCTCTGCTGGTGACGCTGGTGCCACCGCTGCTGTTTGCCGCCAGCTGGCA‑GGAGTGGATTTATAAAGGGCTGACGCTGCTGCTGATTGGCTGCCCGTGTGCGTTAGTTATCTCAACGCCTgcg < 2:559019/284‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |