| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 1,303,527 | G→T | 2.9% | R210L (CGG→CTG) | oppB → | oligopeptide ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,303,527 | 0 | G | T | 2.9% | 498.7 / 3.2 | 141 | R210L (CGG→CTG) | oppB | oligopeptide ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (66/70); new base T (2/2); total (69/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.69e-01 | |||||||||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
GGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTAAATTCATGATATTGCCGATGGTGGCGTTGTCACTCGCTTATATCGCCAGTATTGCGCGTATTACCCGTGGCTCTATGATTGAAGTATTACACTCCAATTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCAC‑GCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCATCCTGGTTGGTGCTTTAACCATTTTGTTTAATGCCATTGTCGATGTGCTATATGCGGTTATCGACCCGAAAATCCG > NC_000913/1303244‑1303812 | ggCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATTGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGATCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGTTTATATTCATGATATTGCCGATGGTGGCGTTGTCACCTGCTTATATCGCCAGTATTGCGTGTATTACCCGTGGCTCTATGATTGCATTATTACACCCCAATTCTATTCGTACTGCCCGGGCGa > 1:953662/1‑289 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |