| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,605,196 | C→T | 2.8% | F73F (TTC→TTT) | yhhL → | DUF1145 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,605,196 | 0 | C | T | 2.8% | 538.8 / 3.0 | 153 | F73F (TTC→TTT) | yhhL | DUF1145 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (83/65); new base T (3/2); total (86/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
CGGGAAAAAGTGGCGGGTCAGGTGGCTTATCGGCTGTATCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAACGTGGCGCTGATTTTTACCGTGCTGATGCATGGTATGCAGCTGGCGCTATTGAAATCCACTTTACCGAAAGATGGCCCGCAGA‑TGACCACCGCCGAAAAGGTACGGATTTTCCTTTTCGGCGTGTTTGAACTGCTGGCCTGGCAGAAGAAATTTAAAGTTAAAAAATAACCTTATTGTTCGCCTACAAAGCTGACAAAGCGCGTTCCTTTATAGCTCAGCGTACCTTTATCGCCCACTGTCAGGGCGTGGTACTGCTGGGCGTCGAGGCGAAACGTCTGCTCCATTCCTCCGCTTTGCGGTTTGAAGCTTGCCTCATAGCGTATACTGGTGCCTGCCGGAGTCACTTCCTGCTGGCGCGAACGGCGATCGTTAATCGGTTTTTCCCGCTTGTTGCTCAC > NC_000913/3604914‑3605477 | cGGGAAAAAGTGGCGGGTCAGGTGGCTTATCGGCTGTATCAACGCGAAGCACAAGGAGAAAGTGATGCTGATTAATATTGGTCGTTTGTTAATGCTCTGCGTTTGGGGATTTTTAATCCTCAACCTGGTGCATCCCTTCCCACGCCCGCTGAATATCTTCGTTAACGTTGCGCTGATTTTTACCGTGCTGGTGCATGGTATTCAGCTTGCGCTATTGAAATCCACCTTACCGAAAGATTGCCCGCAGATTGACCACC‑CCGGAAAAGTACGGGTTTTCCTTTTTCGCgtg > 2:1232759/1‑289 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |