| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 99,078 | A→T | 12.6% | I226F (ATC→TTC) | ftsW → | putative lipid II flippase, integral membrane protein, FtsZ ring stabilizer |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 99,078 | 0 | A | T | 12.6% | 205.4 / 3.4 | 83 | I226F (ATC→TTC) | ftsW | putative lipid II flippase, integral membrane protein, FtsZ ring stabilizer |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/37); new base T (10/2); total (43/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.79e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCAGCCTGCGGAGCTGACAAAACTGTCGCTGTTTTGCTATATCGCCAACTATCTGGTGCGTAAAGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGCGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTATCGGTATGGGCATTTCAGCGGTTGTG‑TTGC‑TGA‑TACTCGCCGAACCGTACCGTATCCGCC‑GTGTTACCGCATTCTGGAACCCGTGGGAAGA‑TCCCTTTGGCAGCGGCTATCAGTTAACGCAAT‑CGCTG‑ATGGCGTTTGGTCGCGGCGAACTTTGGGGGCAAGGTTTAGGTAACTCGGTACAAAAACTGGAGTATCTGCCGGAAGCGCACACTGACTTTATTTTCGCCATTATCGGCGA > NC_000913/98840‑99316 | ccagccttgtggtcTGACCAAACTGTCGCTTTTTTGCTATATCGCCAACTATCTGGTGCGTAAAGGCGACGAAGTACGTAATAACCTGCGGGGCTTCCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCAC‑AGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCT‑GGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGT‑GGCAGTTCATTGCCATTa < 1:1307881/226‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |