| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 3233221 = | 127 (0.780) | 3 (0.020) | 3/500 | NT | 2.4% | coding (1559/2019 nt) | fadH | 2,4‑dienoyl‑CoA reductase, NADH and FMN‑linked |
| ? | NC_000913 | 3233291 = | 126 (0.800) | coding (1629/2019 nt) | fadH | 2,4‑dienoyl‑CoA reductase, NADH and FMN‑linked | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TTTACGAAACGCTGCGCTATTACCGCCGGATGATCGAAGTGACGGGCGTGACGCTAAAACTCAATCACACCGTGACGGCGGATCAGTTACAGGCTTTCGATGAAACGATCCTCGCCAGTGGGATCGTGCCGCGCACTCCGCCCATCGACGGGATCGATCATCCGAAGGTATTGAGTTATCTCGATGTACTGCGCGACAAAGCGCCGGTTGGCAACAAAGTTGCCATCATCGGTTGTGGC‑GGGATTGGTTTTGATACGGCGATGTATTTAAGTCAGCCGGGCGAATCCACCAGC‑CAGAATATCGCCGGGTTCTGT‑AATGAATGGGGGATCGACAGTAGCCTACAACAGGCT‑GGTGGCTTAAGCCCGCAGGGAATGCAGATCCCCCGTAGCCCACGGCAGATTGTGATGCTCCAGCGCAAAGCCAGCAAACCAGGACAGGGGTTAGGCAAAACCACCGGCTGGATCCATCGCACCACCCTGCTCTCGCGGGGTGTGAAAATGATCCCAGGCGTAAGTTATCAGAAGATTGACGATGACGGGCTGCATGTGGTGATCAACGGCGAAACGCAGGTAT > NC_000913/3232936‑3233508 | tttACGAAACGCTGCGCTATTACCGCCGGATGATCGAAGTGACGGGCGTGACGCTAAAACTCAATCACACCGTGACGGCGGATCAGTTACAGGCTTTCGATGAAACGATCCTCGCCAGTGGGATCTTGCCGTGCACTCCGCCCATCGACGGGATCGATCATCCGAAGGTATTGAGTTATCTCGATGTACTGCGCGTCAAAGCGCCGGTTGGCAACAAAGTTGCCATCATCGGTTGTGGC‑GGGATTGGTTTTGATACGGCGATGTATTTAAGTCAGCCGGGCGAATcca < 1:357090/288‑1 (MQ=255)tttACGAAACGCTGCGCTATTACCGCCGGATGATCGAAGTGACGGGCGTGACGCTAAAACTCAATCACACCGTGACGGCGGATCAGTTACAGGCTTTCGATGAAACGATCCTCGCCAGTGGGATCGTGCCGCGCACTCCGCCCATCGACGGGATCGATCATCCGAAGGTATTGAGTTATCTCGATGTACTGCGCGACAAAGCGCCGGTTGGCAACAAAGTTGCCATCATCGGTTGTGGC‑GGGATTGGTTTTGATACGGCGATGTATTTAAGTCAGCCGGGCGAATcca < 1:1024224/288‑1 (MQ=255)tttACGAAACGCTGCGCTATTACCGCCGGATGATCGAAGTGACGGGCGTGACGCTAAAACTCAATCACACCGTGACGGCGGATCAGTTACAGGCTTTCGATGAAACGATCCTCGCCAGTGGGATCGTGCCGCGCACTCCGCCCATCGACGGGATCGATCATCCGAAGGTATTGAGTTATCTCGATGTACTGCGCGACAAAGCGCCGGTTGGCAACAAAGTTGCCATCATCGGTTGTGGC‑GGGATTGGTTTTGATACGGCGATGTATTTAAGTCAGCCGGGCGAATcca < 1:33755/288‑1 (MQ=255)tttACGAAACGCTGCGCTATTACCGCCGGATGATCGAAGTGACGGGCGTGACGCTAAAACTCAATCACACCGTGACGGCGGATCAGTTACAGGCTTTCGATGAAACGATCCTCGCCAGTGGGATCGTGCCGCGCACTCCGCCCATCGACGGGATCGATCATCCGAAGGTATTGAGTTATCTCGATGTACTGCGCGACAAAGCGCCGGTTGGCAACAAAGTTGCCATCATCGGTTGTGGC‑GGGATTGGTTTTGATACGGCGATGTATTTAAGTCAGCCGGGCGAATcca < 1:371002/288‑1 (MQ=255) atccgcgcttgcgccggcgggcggttgggctcttgccctgcgcagatccccacattgtccactgctaatacctgcgtttcgccgttgatcaccacatgcagcccgtcatcgtcaatcttctgataacttacgcctgggatcattttcacaccccgcgagagcagggtggtgcgatggatccagccggtggttttgcctaacccctgtcctggtttgctggctttgcgctggagcatcacaatctgccgtgggctacgggggatctgcattccctgcgggcttaagccac > 2:1308678‑M1/286‑289 (MQ=255) cagcggttgcgccagcgcgcggtttggctcttgccctgcgcagatcaccacattgtccactgctaatacctgcgtttcgccgttgatcaccacatgcagcccgtcatcgtcaatcttctgataacttacgcctgggatcattttgacaccccgcgagagcagggtggtgcgatggatccagccggtggttttgcctaacccctgtcctggtttgctggctttgcgctggagcatcacaatctgccgtgggctacgggggatctgcattccctgcgggcttaagccacca > 1:770842‑M1/284‑289 (MQ=255) cGAAACGCTGCGCTATTACCGCCGGATGATCGAAGTGACGGGCGTGACGCTAAAACTCAATCACACCGTGACGGCGGATCAGTTACAGGCTTTCGATGAAACGATCCTCGCCAGTGGGATCGTGCCGCGCACTCCGCCCATCGACGGGATCGATCATCCGAAGGTATTGAGTTATCTCGATGTACTGCGCGACAAAGCGCCGGTTGGCAACAAAGTTGCCATCATCGGTTGTGGC‑GGGAATGGTTTTGTTAAGGCGGTGTATTTTAGTCCGGCGGGGGAATCCAccag > 1:478629/1‑288 (MQ=255) cggttgcgccagcgcgcggtttggctcttgccctgcgcagatcaccacattgtccactgctaatacctgcgtttcgccgttgatcaccacatgcagcccgtcatcgtcaatcttctgataacttacgcctgggatcattttcacaccccgcgagagcagggtggtgcgatggatccagccggtggttttgcctaacccctgtcctggtttgctggctttgcgctggagcatcacaatctgccgtgggctacgggggatctgcattccctgcgggcttaagCCAccag < 1:893617‑M1/7‑1 (MQ=255) ggttgcgccagcgcgcggtttggctcttgccctgcgcagatcaccacattgtccactgctaatacctgcgtttcgccgttgatcaccacatgcagcccgtcatcgtcaatcttctgataacttacgcctgggatcattttcacaccccgcgagagcagggtggtgcgatggatccagccggtggttttgcctaacccctgtcctggtttgctggctttgcgctggagcatcacaatctgccgtgggctacgggggatctgcattccctgcgggcttaagCCAccagc > 1:1108619‑M1/280‑287 (MQ=255) ggttgcgccagcgcgcggtttggctcttgccctgcgcagatcaccacattgtccactgctaatacctgcgtttcgccgttgatcaccacatgcagcccgtcatcgtcaatcttctgataacttacgcctgggatcattttcacaccccgcgagagcagggtggtgcgatggatccagccggtggttttgcctaacccctgtcctggtttgctggctttgcgctggagcatcacaatctgccgtgggctacgggggatctgcattccctgcgggcttaagCCAccag > 1:778115‑M1/280‑286 (MQ=255) tgtgtttaagagacgggtttggcgcttgccctccgcagatcaccacatggtccactgctaatacctgcgtttcgcccttgatcaccacatgcagcccgtcatcgtcaatcttctgataacttacgcctgggatcattttcacaccccgcgagagcagggtggtgcgatggatccagccggtggttttgcctaacccctgtcctggtttgctggctttgcgctggagcatcacaatctgccgtgggctacgggggatctgcattccctgcgggcttaagCCAccagc > 2:352477‑M1/279‑286 (MQ=255) gttgcgccagcgcgcggtttggctcttgccctgcgcagatcaccacattgtccactgctaatacctgcgtttcgccgttgatcaccacatgcagcccgtcatcgtcaatcttctgataacttacgcctgggatcattttcacaccccgcgagagcagggtggtgcgatggatccagccggtggttttgcctaacccctgtcctggtttgctggctttgcgctggagcatcacaatctgccgtgggctacgggggatctgcattccctgcgggcttaagCCAccag < 2:742778‑M1/7‑1 (MQ=255) tATTACCTCCGGATGATCGAAGTGACGGGCGTGACGCTAAAACTCAATCACACCGAGACGGCGGATCAGTTACAGGCTTTCGATGAAACGATCCTCGCCAGTGGGATCGTGCCGCGCACTCCGCGCATCGACGGGATCGATCATCCGAAGGTATTGAGTTATCTCGATGTACTGCGCGACAAAGCGCCGGTTGGCAACAAAGTTGCCATCATCGGTTGTGGC‑GGGATTGGTTTTGATACGGCGATGTATTTAAGTCAGCCGGGCGAATCCACCAGC‑CAGAATATCGcc < 2:1185598/288‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |