| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 303,404 | A→T | 11.2% | L138F (TTA→TTT) | yagU → | DUF1440 family inner membrane acid resistance protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 303,404 | 0 | A | T | 11.2% | 336.9 / 7.3 | 122 | L138F (TTA→TTT) | yagU | DUF1440 family inner membrane acid resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/67); new base T (13/2); total (53/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.04e-04 | |||||||||||
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Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GGCTGCAGGCCAAATTGATTGCTCGCGTAATTTTCTCAATCCACCGTATATTTTTCTTCGAGACTGGTTGGGGCTGACAGATCCCAATGCGGCTGTTTATA‑CCTTTGCCGGGCATGTCTTTAACTGGGTTGGTGTTACGCACATTATCTTTTCGATAGTGTTTGCTGTCGGTTATTGTGTGGTCGCTGAAGTATTTCCAAAAATTAAACTCTGGCAGGGCTTACTGGCA‑GGTGCTTTAGCCCAACTTTTTGTTCATA‑TGATTTCATTCCCTCTCATGGGACTGACGCCACCTCTGTTTGATCTCCCGTGG‑TATGAGAATGTTTCTGAAATTTTTGGACATTTAGTCTGGTTCTGGTCTA‑TTGAAATTATTCGCAGAGATTTACGAAACAGAATTACTCATGAGCCAGACCCTGAGATCCCTTTAGGCTCAAACAGATAATGCATTGAATGATAAAAATGGCGCAAATACAGC > NC_000913/303167‑303638 | tGCAGGCCAAATTGATTGCTCGCGTAATTTTCTCAATCCACCGTATATTTTTCTTCGAGACTGGTTGGGGCTGACAGATCCCAATGCGGCTGTTTATA‑CCTTTGCCGGGCATGTCTTTAACTGGGTTGGTGTTACGCACATTATCTTTTCGATAGTGTTTGCTGTCGGTTATTGTGTGGTCGCTGAAGTATTTCCAAAAATTAAACTCTGGCAGGGCTTACTGGCA‑GGGGCTTTAGccc > 1:497188/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |