| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,697,739 | T→G | 18.1% | V428G (GTG→GGG) | bcsE → | cellulose production protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,697,739 | 0 | T | G | 18.1% | 351.8 / 11.1 | 146 | V428G (GTG→GGG) | bcsE | cellulose production protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (26/85); new base G (32/2); total (59/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.46e-14 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
TATCACTACCTTGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGG‑ATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGT‑ACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑C‑TGGTGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATACCGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCT‑ACTGGCGACATTTTCTC‑AAACCGTAT‑GGTCTGGTTTGAAGATGAT‑CAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGC‑TTG‑CCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCACGATGGTCGCCACTGGCGACG > NC_000913/3697506‑3697976 | tatCACTTCCTTGCTGGCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGG‑ATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTCCCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGT‑ACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGG‑C‑TGGTGCTGt < 1:885217/239‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |