| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,158,652 | T→G | 14.7% | V55G (GTG→GGG) | oxyR → | oxidative and nitrosative stress transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,158,652 | 0 | T | G | 14.7% | 248.0 / 10.0 | 124 | V55G (GTG→GGG) | oxyR | oxidative and nitrosative stress transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/58); new base G (17/4); total (62/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.38e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.45e-01 | |||||||||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
AATGCTTGATAGGGATAATCGTTCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTGG > NC_000913/4158414‑4158888 | aaTGCTTGATAGGGATAATCGTTCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGAGGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAgt > 1:462713/1‑239 (MQ=255) tGATAGGGATAATCGTTCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGtgttgt > 1:958317/1‑238 (MQ=255) aTAATCGTTCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGTTGGGCGGGATGTTGCTGGGGGGGAACAGCCGGAAAGGGTGGTTccgcccgg > 2:1235307/1‑232 (MQ=255) tattctttctttttttttttACCTTTCGCCATGAACTTGGGGGGGGGGGGGGGATGGAAAAGGAATTCTCGGGATGTG‑GAGTCCGGGGTGGCATTGGC‑GGAA‑CCCCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGc < 2:1256288/220‑1 (MQ=255) tAATCGTTCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGAACAGCCGTAACGAGGTGTTCACCCAGGc > 1:549588/1‑239 (MQ=255) aaTCGTTCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGGGCTGGGCGTGATGTTGCTGGACGGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTGACCCaaggg > 2:953246/1‑235 (MQ=255) cATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑CCTTACCGGGCAAATTCGTAAGCTTGAAAATGAGCTGGGCGGGATGTTGCTGGTGGGGACCAGCCGAAAAGAGTGTTTCACCCAGGCGGGaaagg > 2:714261/1‑236 (MQ=255) tGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAAATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCCCC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTTGAAGAGTAGCTGGGCGTGACGTTCCTGGAGCGGACCAGCCGTAACGTGTTGTTCCCACAGGGGGGCAtcttgc > 2:263420/1‑234 (MQ=255) ccTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTTCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAACCTGGAAGTTGAGCTGGGCGGGCTGTTGCGGGAGCTGACCCGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGaaaggcggctgggggaca > 2:650147/1‑223 (MQ=255) ccTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGTTCa > 1:709849/1‑239 (MQ=255) ccTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGGGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCAAGGCGGGAATGCTGCGGGTGGagta > 1:344083/1‑236 (MQ=255) ccTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAACTGGGCGGGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATTCTGCTGGTGGGTCa > 1:1266716/1‑239 (MQ=255) aTCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGAGGTTGCTGGAGCGGCCCACCCGTAAAGGGTTGTTCACCCAGGCGGGAAAGTTGGTGGGGGaaaaggg > 2:1260617/1‑233 (MQ=255) cgcgatgacttatggggggggtGGAGGATGTATAATAAAT‑TTGCTGATTTTGGGGTACCTGG‑GGCATTGGG‑TGAACCCCCGCCTTTTTCGGCGTCGGGCGGATCCCTGCCCCGTTAGCCAGCCGGC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGgcgc < 2:450172/218‑1 (MQ=255) cGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGgcgc > 1:1060235/1‑239 (MQ=255) cGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGACGGGAATGCTGCTGGTGGGTCAGgtgc > 1:500580/1‑239 (MQ=255) cGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGACCAgaggc > 1:106157/1‑235 (MQ=255) cGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGATCAGgcgc > 1:1147969/1‑239 (MQ=255) cGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCGGCTGGGGGATCAGgcgc > 1:450172/1‑239 (MQ=255) tGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTAcc > 1:260027/1‑239 (MQ=255) cGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGGGTTGTTCACCCGGGCGGGAATGTGGCTGGGGGGTCAgggggggacagggtcggg > 2:232916/1‑223 (MQ=255) gCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGATCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTTGGGGAT‑AAGCGCGGTACCGGGCGGCGTAAg > 1:229670/1‑239 (MQ=255) gCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGATCAGCCGC‑GTACCGTGCTCCGTggg > 1:1146359/1‑237 (MQ=255) gCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTACTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGACGTAAAGTGTTTTTCACCCAGGCGGGAACGGTGGTGGGGGATCAGGCGG‑GTACCGGgcggcggggg > 2:561504/1‑235 (MQ=255) aTGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGACATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTgggggg > 1:236971/1‑237 (MQ=255) ggcggatggatAATGAATTTTGGTGAATTT‑GGTTACCTGGTGCCTTTGGT‑TGAA‑CCCCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGa < 1:540147/235‑1 (MQ=255) ggaggtTGGATAAGGAATATTGGTGACCTG‑GGTCACCTGGTGGCATGGGC‑TGAA‑CCCCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCAGGTTAGCCAGCCGGC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGaa < 1:602038/239‑1 (MQ=255) ggaggaTGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGCTGTTGCTGGAGCGGACCAACCGCAAAGTGTTGTTCACCCCGGCGGGACAGCTGCGTGTGGATCCAGCGC‑GAACCGGGCGGCGGGAGGGGaa > 2:425628/1‑239 (MQ=255) gaaaaTGAATTTTCGTGATCTT‑GATGCCCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCtt < 1:232916/235‑1 (MQ=255) atAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGGTGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACACAGGCGGGAATTCTGATGGTGGGACAGGAGC‑GATACGTGCTGGGGCAGGGGAAAGGCCTTaa > 2:94512/1‑239 (MQ=255) atAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGGGGTGAAAGGCCTTaa > 1:1301114/1‑239 (MQ=255) atAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGGGTTGTTCACCCAGGCGGGAAGGGTGCTGGGGGACCAGGCGC‑GTACCGGGCTCGGGGGGGGGAAAGGCCTTaa > 2:862619/1‑239 (MQ=255) atAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGCACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGAACAGGGGC‑GGACCGGGCTTCGGAGGGGGAAAAGCCTTaa > 2:1020313/1‑239 (MQ=255) ttgatttttCGTGTTTTT‑GGGT‑CCTGGGGGCAGTGGCGTGAC‑CCCCCCCTTTTCCGGCGGGCGGCAAATTCCTGCACCGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAaga < 2:1168146/232‑1 (MQ=255) aTGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGGGCTGCGGGAGGGGGAAGTCCTTAAaga > 1:569193/1‑239 (MQ=255) gAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGGGATGTTGCTGGAGCGGACAAACCGTAAAGGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATACTGCTGGGGGAACAGGCGC‑GGACCGGGCTGGGGGGGGGGGAAGTCCCTaaaaaaa > 2:421255/1‑235 (MQ=255) atatTCGGGATCTG‑GAGTACCTGGTGGCATGGGC‑GAAC‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGAt < 1:412617/238‑1 (MQ=255) attccgggttttggggTACCTGTGGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTGGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCAAGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATgg < 1:1180043/224‑1 (MQ=255) atTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGGTCAGGCGC‑GTACCGGGCTGCGTGAGGGGAAAGACCTTAAagaaaggga > 2:435841/1‑233 (MQ=255) ggtctttggggcctggggtgaaa‑CCCCGCCTTTTTGGGGGGGGGGCAGTGTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAG‑CCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCGGGGCGGGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGc < 2:236971/218‑1 (MQ=255) ccTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGATCAGGCGC‑GTACCGGGCTCCGGGAGGGGAAAGTCCTTAAAGAGAAGGCAAACCAGCAggggggga > 2:67180/1‑234 (MQ=255) tggtggCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTCAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GGACCGTGCTGCGGGCGGGGAAAAGCCTTAAAGGGATGGAAAGCCACCCGGGGGGGACg > 2:798855/1‑239 (MQ=255) ggtggCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTCACGTGCTGCGTGAGGGGAAGGGCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGGGACGa > 1:554481/1‑239 (MQ=255) ggtggCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GCACCGGGCGTGGTGAGGGGAAAGGCCTTAAAAGGAGGGCAACCCAGCAGGGCGcgacga > 2:363974/1‑239 (MQ=255) ggtggCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAAAGCGGCTGGGGGATCAGGGGC‑GTACCGGTCGGCGTGAGGGGGAAGGCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGGgaggaga > 2:1056553/1‑235 (MQ=255) ggtggCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGCAAAGAGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCGGGTGGGTAAGGCGC‑GGACCGTGCTGCGTGGGGGGAAAGTCCTTAAAGAAGTGGGAGAACAGCAgggggggggaa > 2:94271/1‑231 (MQ=255) cATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGATCAGGCGC‑GTACCGGGCTGCGTGAGGGGAAAGGCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGGGACGTGGTcc > 1:531590/1‑239 (MQ=255) ttGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCTGGCTGCGGGGGGGGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGGGGGACGATGTCggg > 2:1011449/1‑239 (MQ=255) ttGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGGGAGGGGAAAGGCCTTAAAGAGAAGGAAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCg > 2:360115/1‑238 (MQ=255) tGAC‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCg < 1:164205/238‑1 (MQ=255) cGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCGGCGTGAGGGGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCACCAGGGGGAGACAATGGCCGGACCGC‑GGcaaaa > 2:21395/1‑236 (MQ=255) ttgggtgTGCGGCAAGTTCCTGCCCGGGTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGGGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCGGGGCGTGATGTGGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTg < 2:260027/233‑1 (MQ=255) ggaaggTGCGGCAGATTCCTGCCAGGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGttt < 1:812238/232‑1 (MQ=255) ggccGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTcc < 1:421255/235‑1 (MQ=255) gTGGGGAAGATTCCGGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGGGGGCAAATTCGTAAGTTGGAAGCTGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGTAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTcc < 1:754782/238‑1 (MQ=255) caaatcccggCCACTTTAGCCAGCCGAC‑GGTTAGCGGGAAAATTCTGAAGCTGGAAGATTAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑TTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGt < 1:125067/229‑1 (MQ=255) ttCCTGCCACGTTAGCCGGCCGTC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGa < 1:697129/238‑1 (MQ=255) ttCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGa < 1:540918/238‑1 (MQ=255) tCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGGGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGAGGTCCGGACCGC‑GCCACATTGGTTTGATTCCCACAgcgggc > 2:812238/1‑232 (MQ=255) gCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTAc < 1:435841/239‑1 (MQ=255) ccACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGGGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTa > 1:712262/1‑237 (MQ=255) ccACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGAGTTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTa > 1:391656/1‑237 (MQ=255) ccACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGAAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGGTCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGGAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCCGACCGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTGggaccggacc > 2:540918/1‑239 (MQ=255) agccagccGAC‑GCTTAGGGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTAcc < 1:94271/239‑1 (MQ=255) gccagccGGC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCg < 1:561504/239‑1 (MQ=255) gccagccGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCg < 1:1020313/239‑1 (MQ=255) gcaagccGAC‑GCTTAGCGGGCAAGTTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCg < 1:236322/236‑1 (MQ=255) gccgccGACGGCTTGGCGGGAAAATTGGTAAGCGGAAAGAGGGGCTGGGGGGGATGTGGTGGGGGGGGCCCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCg < 2:1147969/236‑1 (MQ=255) cagccGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCg < 1:872294/237‑1 (MQ=255) cggc‑GCTTAGCGGACAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGGTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCatat < 1:913435/235‑1 (MQ=255) cGAC‑GTTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCatat < 1:1235307/238‑1 (MQ=255) cGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCatat < 1:1011449/238‑1 (MQ=255) gAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGGGATGTTGCTGGAGCGGACAAACCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGGGGGGGGAAAGACCTTAAAGAGCTGGCAAGCCAGCCAGGCGGAGCGGGGGCCGGGACGCATGC‑CATTGGGTTGATTCCAACAGTGGGGGCGTACCGGCCACCGcccatt > 2:348761/1‑233 (MQ=255) gCTTAGGGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGAGGAGCTGGGCGTGATGTTGGTGGAGCGGACCAGGCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATcc < 1:314194/239‑1 (MQ=255) tttgcggggCAAGTGCGGAGGCGGGAAGTGGTGCTGGGGTTGTTGTTGCGGGGGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATTCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATcc < 2:106157/232‑1 (MQ=255) gacggggCAAATTCGTAAGGTGGAAGGTGGGCTGGGCGGGATGTTGCGGGGGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATccc < 2:759470/233‑1 (MQ=255) gggCAAAGTCGGAAGCTGGAAGTTGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGGGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGAACGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTAtgc < 1:383312/238‑1 (MQ=255) aaTTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCg < 1:95737/217‑1 (MQ=255) cggaaGGTGGAAGATGAGCGGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGAc < 1:953246/236‑1 (MQ=255) gAAGATGGGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCaa < 1:798855/238‑1 (MQ=255) agttggggtGGGCGTGTTTTTGCGGGGGGGGCCCCGCCGTAAAGGGTTGTTCCCCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAg < 2:712262/230‑1 (MQ=255) aGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGGACGGCCCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGaa < 2:188711/108‑1 (MQ=255) aGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTcc < 1:1017998/177‑1 (MQ=255) ggttGGGCGTTTTGTTTGTGGGGCGGCCCCGCCGTAATGTGTTGTTCACCGAGGAGGAAATGCGGATTGTGGATCCGGCGC‑GTACCGTGCTGCATGAGGTGAAAGTCCTGAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACCATGTCCGGACCGG‑TGCACACTGGTTTGATTCCCACAGTTGGGCCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGaa < 2:647487/236‑1 (MQ=255) ggtgtgggttgtgtttccgggggCGGCCCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGaa < 2:391656/217‑1 (MQ=255) aGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGGGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGGAAGCCAGCAGGGCGAGACGAGGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGGTTGCTTCCCACAGTTGGACCCTACCGGCTCCCGCATATTATCCCTATACTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGaa > 2:787804/1‑239 (MQ=255) ggCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATTCTGCTGGTGGATCAGACGC‑TTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTaaa > 1:188711/1‑108 (MQ=255) ggCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGAc < 1:610711/145‑1 (MQ=255) ggCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGAAGATGTCCGGAc > 2:610711/1‑145 (MQ=255) ggggtttttggggggggggACCAGCGGGAAAGTTTTGTTCCCCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTAt < 2:104990/221‑1 (MQ=255) cGTGTTGTTGCTGGGCGGGACCGGCCGTAAAGGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCATAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTAt < 2:545138/238‑1 (MQ=255) ggtGCTGGAGGGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATg < 1:1365676/237‑1 (MQ=255) gTTGCGGGAGGGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCGCCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGGTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATg < 1:1355406/239‑1 (MQ=255) gtGCTGGAGGGGACCAGCCGTAAAGGGTGGTTCACCCGGGCGGGAATGCTGCGGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATg < 1:787804/237‑1 (MQ=255) gtgggggggACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCCCCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGG‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCCTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGc < 2:189977/232‑1 (MQ=255) ggAGCGGACCAGGCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGTAACAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCAAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGcac < 1:165490/239‑1 (MQ=255) cGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGGGAAAGTCCTTAAAGGGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGCCCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGGACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAACACAGa > 2:1155006/1‑238 (MQ=255) aaGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGAATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTAcgg > 1:936775/1‑237 (MQ=255) aGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTgg < 1:1014891/239‑1 (MQ=255) tgttgtTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTgg < 1:601759/237‑1 (MQ=255) | AATGCTTGATAGGGATAATCGTTCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTT‑GAGTACCTGGTGGCATTGGC‑TGAA‑CACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGAC‑GCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGC‑GTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGC‑TGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTGG > NC_000913/4158414‑4158888 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |