| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,319,405 | 0 | A | C | 20.1% | 248.3 / 9.0 | 127 | V68G (GTG→GGG) | phnJ | carbon‑phosphorus lyase, SAM‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (55/40); new base C (5/27); total (60/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.02e-05 | |||||||||||
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Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
GCGCGTGCATGGTGCGGGTTTCCGTTTCGCGCGGCTCGATAAAGCGCAGCGGCTCGGGGATTGGCACCTGGAAGATAATTATCTGATCTTCGGTCAGCGGCGTTTCGGGGATGCGGTGACGCGTCTGGATAACCGTCGCATCGTCCGTACGTTCCGTGGTGTTTACCCCGGTCACGCGCTTGAAGAAGTTGCGAATCGACACGGCGTTGGTGGT‑GTCATCCGCGCCCTGGTCAATCACCTTCAGCAC‑GTCGCTTTCGCCAATCACGCTGGCGGTAAGCTGAATGCCGCCGGTTCCCCAGCCGTACG‑GCATCGGCATCTCGCGCCCGCCAA‑ACGGCACCTGATAACCGGGGATCG‑CCACCGCTTTTAAGATGGCGCGGCGGATCATGC‑GTTTGGTCTGCTCGTCGAGGTAGGCAAAGTTGTAGCCGCTCAGATTAGCCATGGTTCTGCTCCTGTTGCAGACGTTTGAGT > NC_000913/4319169‑4319636 | tGCATGGTGCGGGTTTCCGTTTCGCGCGGCTCGATAAAGCGCAGCGGCTCGGGGATTGGCACCTGGAAGATAATTATCTGATCTTCGGTCAGCGGCGTTTCGGGGGTGCGGGGACGCGTCTGGATAACCGTCGCATCGTCCGTCCGTTCCGTGGGGTTTACCCCGGTCACGCCCTTGAAGAAGTTGCGAATCGACACGGCGTTGGTGGT‑GTCCTCCGCCCCCCGGTCAATCACCTTCa > 2:819076/1‑238 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |