| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 81,736 | A→G | 7.9% | S75P (TCG→CCG) | leuB ← | 3‑isopropylmalate dehydrogenase, NAD(+)‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 81,736 | 0 | A | G | 7.9% | 407.7 / 2.1 | 162 | S75P (TCG→CCG) | leuB | 3‑isopropylmalate dehydrogenase, NAD(+)‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (62/82); new base G (4/12); total (67/95) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.91e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
CCTTCGCGGCCTTTTGGCTGACCGAAATAGATGCCGCCGGTCAGTTCGCGCACACACAGGATGTCGAAGCCGTTTGCGGCAATGTCTGCACGCAGCGGACAGAATGCTTCCAGCCCCTGATACAGTTTTGCCGGGCGCAGGTTGCTGAATAA‑TTTGAAGTGCTTACGCAGAGGCAGCAGCGCGCCGCGTTCTGGTTGCTGGTCTGGTGGTAAATGTT‑CCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGG‑CTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGT‑AATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGC‑ATCCAGCA‑CTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACC‑AATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTT > NC_000913/81498‑81967 | ccTTCGCGGCCTTTTGGCTGACCGAAATAGATGCCGCCGGTCAGTTCGCGCACACACAGGATGTCGAAGCCGTTTGCGGCAATGTCTGCACGCAGCGGACAGAATGCTTCCAGCCCCTGATACAGTTTTGCCGGGCGCAGGTTGCTGAATAA‑TTTGAAGTGCTTACGCAGAGGCAGCAGCGCCCCGCGTTCTGGTTGCTGGGCTTGGGGTAAATGTT‑CCCACTTCGGGCCCCCCACCGa > 2:27783/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |