| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,340,822 | A→T | 15.5% | I184F (ATC→TTC) | yrbG → | putative calcium/sodium:proton antiporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,340,822 | 0 | A | T | 15.5% | 245.2 / 7.3 | 113 | I184F (ATC→TTC) | yrbG | putative calcium/sodium:proton antiporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/60); new base T (17/2); total (51/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.71e-05 | |||||||||||
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Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
AATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGTTAAACTTGCACGTCAGGCTGAACGTCAGGGGACTGACAGCCTGACCAGAGA‑GCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCTC‑GGCATTGCG‑CTTATCATCATGCCAGTGGCCACGCGGATGGTGGTTGATAACGCCACGGTGCTGGCGAATTACTTTGCCATCAGCGAGTTGACGATGGGTCTGA‑CGGCAATTGCTATCGGAACCAGCCTGCCGGAACTGGCAACCGCAATAGCGGGGGTTCGCAAAGGTGAAAACGACATTGCTGTCGGAAATATCATTGGCGCAAACATTTTTAATATTGTCATCGTGTTGGGTTTACCCGCGCTGATAAC > NC_000913/3340593‑3341060 | aaTGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTCCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGTTAAACTTGCACGTCAGGCTGAACGTCAGGGGACTGACAGCCTGACCAGAGA‑GCAGCTTGCAGAGCTGCCGCGTGACGGCGGATTGCCCGTCGCGTTTTTATGGCCC‑GGCATTGCG‑CTTatcctcctt > 1:591790/1‑235 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |