| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,416,415 | C→T | 14.3% | S462F (TCT→TTT) | acrF → | multidrug efflux system protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,416,415 | 0 | C | T | 14.3% | 247.3 / 9.0 | 118 | S462F (TCT→TTT) | acrF | multidrug efflux system protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/66); new base T (15/3); total (49/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.21e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
CTCCATCAACACACTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCAT‑AGCGTTAACCACTACACCAACAGCGTCGG‑CAAAATCCTCGGATCCACAGGACGAT > NC_000913/3416194‑3416648 | cTCCATCAACACACTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGCCGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGGGGGAATCGCGATGGGGCTTTCCGCGGTTTTTTTTCCTATGGCCTTTTTTGGGGGTTTTTA‑T‑GGGGGCAttttt > 2:950542/1‑236 (MQ=255) ccATCAACACACTAACGATGTTCGGGATGGGGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGTGGGGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGc < 1:5934/239‑1 (MQ=255) cccccacccTATCGGTTTTGGGGGTGGTGCTTGCCCTCGGGCTGCTCGGGGAGGAGGGGATGGGGGGGGGGGAAAACGCGGGGCCGGTGATGATGGAGGATAAGCCCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAg < 2:594780/235‑1 (MQ=255) aaCACACAAAGGATGTGAGGGATGGTGCTTGCAATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGGGGTGGAGAACGTGGAGCGCGTGATGAGGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGtt < 1:873044/239‑1 (MQ=255) tAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGGTTTTC‑T‑GTGGCAAGTTTTTGCCAGtttccttt > 1:645719/1‑232 (MQ=255) aaagctGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGATGCTCGTCGATGATGCGGTAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGATGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATGGATGGCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGGATCGCGAGGGGGCTGTCAGCGGTATTAATTCCGATGGCATTCTTCGGAGGTTCTAC‑G‑TGGGCAAtttttgtcccgtttcttatt > 2:733803/6‑221 (MQ=255) aaCGATGTTCGGGATGGGGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCCCT‑GGGGGGTACCGCGATGGTGCGTGCAGCGGTATTTATTCTGATGGCATTCTTCGGCGGTCTTAC‑T‑GGGGCAAttttttacccgtgttttttca > 2:613091/1‑221 (MQ=255) aTGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGGATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑TGGGGGCAATTT‑TCTCCAGtttcttattacca > 1:1011123/1‑227 (MQ=255) ttCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTTC‑T‑GGGGCCATTTTTCGCCCGTTTTCTATTACCCTCGt > 1:84585/1‑239 (MQ=255) ttCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGAAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTACCGCGATGGGGCTGTCACCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGGGGTGTTCC‑T‑GGGGGAATTTTTCGCCCAGTCTCTTTCAcccccgt > 2:1065621/1‑234 (MQ=255) tggggATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGAAGCGATAGTGGTGGGGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGtt < 1:949896/237‑1 (MQ=255) cGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTTTTC‑T‑CGGGGAATTTTTTGCCCGTTTTTTATCACCATCGctt > 1:568738/1‑239 (MQ=255) cGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTTTCC‑T‑GGGGCCATTTTTCTcccatttttcttcacccacgtt > 1:637314/1‑218 (MQ=255) cGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGAATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTT‑TACAC‑TGGGCAATTTATTCCCAATtcctttttcacctcgct > 1:950032/1‑223 (MQ=255) cGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGAGGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGTCGGTTCGAC‑T‑GGGGCGATTTTTTGCCAGGTTTCTTTCTCCCTCGtt > 1:1033340/1‑238 (MQ=255) ggTGCTTGCCCGCGGGCTTCTCGGCGGTGATGCGGAAGGTGTGGTGGAAAACGTCGAGGTGGGGATGAGGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCa < 2:888433/238‑1 (MQ=255) ggTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAA‑T‑GGGGCAATTTTTTGCCCGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGGaa > 1:186710/1‑239 (MQ=255) tGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTTTAC‑T‑GGGGCAATTTATCTCCAGTTCTCTTTCACCACCGCTT‑CGGCAATg > 1:291731/1‑239 (MQ=255) tGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTTTAC‑C‑TGGGCGATTTTTCGCCCGTTGTTCATTCCCACCGTTT‑TGGCAATg > 1:320181/1‑239 (MQ=255) tttGCCATCGGGCTTTTCGTGGATGAGGCGTTGGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGGGTGAGGATGGGGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGgc < 2:13943/238‑1 (MQ=255) ttGCCATGGGGCGGGCCGCCGATGATGCTAAAGTGGTGGGGGAAAATGTCTAGGGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGgc < 1:1018091/238‑1 (MQ=255) tccattgtgttgttcgtggTTGGTGAGATATGGGGGGGGGAGAAGGTTGAGCCCTTAATGTGGGGGGATAAGCTGCCTCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATGCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGGCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCt < 2:132081/226‑1 (MQ=255) gCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTTTAC‑T‑TGGGCAATTTATCTCCACTTCTCTATCCCCACACTTT‑CGGCCATGgc‑g > 1:274856/1‑237 (MQ=255) cGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGACAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGGATTTATTCCGATGGCATTCTTCGCCGGTTCTAA‑T‑GGGGCAAATTTTCGCCAGTTCTTTATCCCCATACTTT‑CGGCAATGGA‑GCtt > 1:492197/1‑235 (MQ=255) ggttggtgcttttggggtggttgAGAACGTGGGGCGGGTGATGTTGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGGCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCAt < 2:526065/224‑1 (MQ=255) gtgtataaaggacgggggggggggaACGGCGGGCGGGGTATGAGGGGGGAGAAGCTCCAGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAAGCGATGTCGCAAAGTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCAtt < 2:708493/216‑1 (MQ=255) gatggtgcgtatgtgggggtgGAGAACGGTGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCAt < 1:972946/226‑1 (MQ=255) tgaggggATAGGGGGGGTGGAAAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTg < 1:435936/232‑1 (MQ=255) atgCGATAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGGTAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGGTTTAC‑T‑TGGGGCATTTATCGCCCGGTTTCTATCACCCTCGTTT‑TGGCAATGGG‑GCTTTCTGTTTTTGGGGCTTTTAtt > 1:970702/1‑239 (MQ=255) atgCGATAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCCATTTTTCTCCCGTTTTCTTTTACCACCGTTT‑CGGCCATGTG‑GCTTTTTTTTTTGGTGGCAtttgtt > 1:825763/1‑235 (MQ=255) gtgttggtggtggtgGAGATCGGCGAGGGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAAACGATGTCTAAAATTCATGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGGTGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCAGTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑t < 2:199320/233‑1 (MQ=255) gcgttggtgggggtgGAGAAGGTCGAGGGCGGGAAGATGGAGGATAAGCCCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑t < 2:1036431/233‑1 (MQ=255) aggggtgggggAAAACGTCGAGCGGGTGATGATGGAGGATAAGCCCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTAcc < 1:104590/235‑1 (MQ=255) ggtggtggAGAAGGGCGAGGGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCt < 1:131622/238‑1 (MQ=255) gtggAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGGGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGGGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGCTGGCATTCTTCGGCGGTGTTAC‑T‑GGGGCCATTTTTTGCCCGTTTCCTTACACACTCGTTTCCGCCAAGGGC‑G‑TTTTTGTTTTGGGGGGATTTATTCTTTAccccgggga > 2:668807/1‑234 (MQ=255) tggAGAACGTCGGGCGGGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGGCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGtt < 1:35262/238‑1 (MQ=255) tggAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGtt < 1:313315/238‑1 (MQ=255) aCGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCCCT‑GGTGGGTATCGCGGTGGTGCTGTCAGCGGCATTCATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTGTTTC‑T‑CGGGGAGCTTTCGGCCCGGTTTTTCTCCCCCTCGTTT‑CGACCATGGCGGCTTTCTGTCGGGGTGTCATTGTTTT‑TTACCCCTGCTTTATGTGc > 2:742650/1‑239 (MQ=255) cGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑TGGGCAATTTATCGCCAGTTTTCTATCACCCTCGTTT‑CGGCCAAGGC‑GCTTTCTGTTCTGGGGGCATTGATTC‑TTAcc > 1:708493/1‑223 (MQ=255) cGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGGTCTAC‑T‑GGGGGCATTTTTTGCCCGCTGTCTTTTACCCCCCTTT‑TCGCAAAGGG‑GCTTTTTGTTTTGGTGGCTTTTGTTT‑TTTccccccggttattggaaa > 2:1067994/1‑225 (MQ=255) cGAGCGTGTGATGAGGGAGGAAAAGCTGGCGGCAAAAGAAGGGAAGGAAAAATCGATGTCACAAATTCAGGGCGTACT‑GGTGGTTATCGCGATGGTGCTTGCAGCGGTATTTAGTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTAGCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACg < 1:887981/238‑1 (MQ=255) cGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGGCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACg < 1:279333/238‑1 (MQ=255) ggtggtaagggaggaGAGGCCCCCGGCAAAAGGAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGGGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCtt < 1:1065621/229‑1 (MQ=255) gtgtaggggggttaatgtCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTACCGCGATGGTGTGGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTaaa < 2:492197/221‑1 (MQ=255) gtggttggggggaaaccgcccGCCAAAAGGAGCGACGGAAAAATCCAGTTCGCAAATTGAGGGCGGACT‑GGTGGGTATCGGGGTGGTGCTGTCAGCGGTTTTTATTCCGATGGCATTGTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTCCCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTaac < 2:826191/220‑2 (MQ=255) ggtgtggggggaAAAGCCACCGCCAAAAGGAGCGAAGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGGACG‑GGTGGGTATCGGGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTaaa < 2:825763/229‑1 (MQ=255) gatgatGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTaaa < 1:702239/238‑1 (MQ=255) tgGGGGATAAGGCCCGGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCTCTCT‑GGTGGGTATCGCGATTGTGCTTTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCTCCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGt < 1:566942/238‑1 (MQ=255) tgGAGGTAAAGTCCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGt < 1:833767/238‑1 (MQ=255) tAAGCTGCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑G‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTctgct < 1:220/238‑1 (MQ=255) tAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTTC‑T‑TGGGCAATTTTTCTCCCGGTTTCTATCACCATCCTTT‑TGGCACAGGC‑GCTTTTTTTTCTGGGGGGCTTGTATC‑TTCTCCCCGCGGTTTGGGCAAAGCTTCTTAAACCCGGCTctcctt > 2:76010/1‑238 (MQ=255) aGCTCCCGCCAAAAGAAGGTACGGAAAAATCGATTTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAg < 1:391541/239‑1 (MQ=255) cccGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAT‑G‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑c < 1:742650/239‑1 (MQ=255) cGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTTTTGCCAGTTCTCTATCCCCCACGTTT‑CGGCAATAGC‑GCTTTTTGTTCTGGTGGCATTGTTTC‑TTACCCCCGCGTTTTGTGCAACCCGGCTTAAAACCctcttctgtgggcatccc > 2:795469/1‑225 (MQ=255) cggtgtgccAAATTCAGGGCGCATT‑GGGGGGTTTGCGGCTGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCggt < 2:645719/231‑1 (MQ=255) cggtggcGCAAAGTCAGGG‑GCGCTGGGGGGGTAGCGGGATGGTGCTGGCAGGGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTGGCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCggt < 2:637314/233‑1 (MQ=255) cGATGTCGCAAATTCAGGGGGCACT‑GGTGGGTCTCGCGATGGGGCGGTCAGCGTGATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGTCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCggt < 1:733803/239‑1 (MQ=255) cGATGTCCGAAATTGAGGGCGCGCT‑GGATGGTAACGCGGTGGTGATGGCAGCGGTACTTAGTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTAGCGCCAGTTCTCTAACACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCggt < 1:1054787/239‑1 (MQ=255) aTTCAGGGCGCCCT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATac < 1:795469/239‑1 (MQ=255) aTTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATTGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATac < 1:1027361/239‑1 (MQ=255) ggCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATTGCCAGTTTTCTATCACCATCGGTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTAACCCTGCGTTATTTGGCACCCTGCTTAAACCCCTCTCTGTCGGACAT‑CCCGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGCTTGGTTT‑AATACCACCt > 1:147961/1‑238 (MQ=255) gcgcgcT‑GGTGGGTATCGCGGTTGTGTTGTGAGGGTTTTTTTTTCCGATGGAATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCGCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCtt < 2:446450/238‑1 (MQ=255) gcgcACT‑GGGGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATaccacc < 1:544493/236‑1 (MQ=255) ccT‑GGTGGGTATCGCGGTGGGTGTGTCAGGGGTATTTATTGCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCCCCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATc < 2:84585/238‑1 (MQ=255) cT‑GGTGGGTTTCGCGGTTGTGCTGTCGAGGTTTTTTTTTCCGATGGCTTTCTTCGGCGGTTTGAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTTTCCCCATCGTTT‑CGGCAATTGC‑TCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTAGATCa < 2:989187/239‑1 (MQ=255) cT‑GGTGGGTTGCGGGTTGGGGTGGTTAGGGGTTTTTATTCCGGTGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCa < 2:1017048/239‑1 (MQ=255) ggccggTAGCGGGGTGGTGCTGTGCGCTGTTTTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCa < 2:660157/233‑1 (MQ=255) tggGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGGAATTTATCGCCCGTTTTCTATCACCATCGTTT‑CGGCCATGGG‑GCTTTCTGTTCTGGGGGCCTTTATTC‑TTTCCCCTGCGTTATGTGCACAGCCTCTTAAACCCGTCTCTGCTTAGCAT‑CCCAAAAATAAGGGGGGGTTTTTTGGGTGGTTTAAATACCCCCttgataaaaac > 2:802603/1‑230 (MQ=255) tggGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTTTCTTTTACCCTAGTTT‑TGCGCATGGG‑GCTTTTTGTTTTGGGGGCATTTATTT‑TTTCCCCCCCGGTATGTTCTACTATCCTTTAAACCGTGTCTACT‑TGTATCCACGAAAAAACAGGCCGTTTTTTCTGTTGGGTT‑AAAAACACCttagcacataac > 2:755323/1‑229 (MQ=255) ggTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACg < 2:988906/156‑1 (MQ=255) ggTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCCAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGGGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACg > 1:988906/1‑156 (MQ=255) ggTATCGCGATGGTGCGGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCCCCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCCTTGATTC‑TTACCCCTTCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCAT‑AGCg < 1:532751/238‑1 (MQ=255) tttCGCGTTTGTTCTGTCAGTGGTTTTTTTTCCGGTGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCAT‑AGCGtt < 2:320181/236‑1 (MQ=255) tATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCCCCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCAT‑AGCGtt < 1:274927/238‑1 (MQ=255) gaTCGCGAGGGTGCTTTCAGCGGTATTTAGTCCGATGGTATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCGCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGGCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCAT‑AGCGtt < 1:420601/237‑1 (MQ=255) aTCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCCTTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGGAAATAAAGGCGGCTTCTTCGGTTGGGTT‑AATACCACCCTCgtcctatgcgtta > 1:718740/1‑226 (MQ=255) tgcgttttttttggtagtggTTTTTTTTCCGGTTGTCTTTTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCCGTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑ATACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCCGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCAT‑AGCGTTAAcc < 2:438603/221‑1 (MQ=255) cggggtgttgcgttcagtgtttttttttCCGTTGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTTTAGCGCCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTTGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGGTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCAT‑AGCGTTAAcc < 2:585488/217‑1 (MQ=255) cgcgATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAT‑T‑GGGGCCATTTATCGCCAATTTTCTTTCACCCTCGGTT‑CGGCAATGGG‑CCTTTCTGTTTTTGTGGCCTTTATTT‑TTACCCCCGCGTTAGTTGCCACCCTGCTTAAAACCCTCTCTGTTGAGCAC‑TCCGGAAATAAAGCGGGGTTTTTTGGGTGGTTT‑ATTaacaacctctcacaaaaggttaaac > 2:1051711/1‑218 (MQ=255) cgATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCCGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTTTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACACCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTTAACCCCGCTCTTCTGAGCTT‑CACGCAAATAAGGGGGGGTTCTTCGGTTGGGTT‑TATTCACCCTTCGTGCAT‑TGCGGTAAcc > 1:438603/1‑237 (MQ=255) cgATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑C‑GGGGCGATTTTTTCCCCGGTCTTTATTACCAACGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTTTGTTCTTTTGGCTTTGGTTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGACACGCCGCTTTAACCCCTCTCTTCTGTGCAT‑CACGGAAATAAAGGCGGGTTCTTCTGGTGGTTT‑AATaccacccttcaacaaaacgctaaccaa > 2:216501/1‑218 (MQ=255) gATGGTGCTGTCAGGGGTATTTATGCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑G‑GGGGCAATTGAGCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATGC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTGTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCAT‑AGCGTTAACCAc < 1:609507/238‑1 (MQ=255) gTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGGCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTTGGGTGGTTT‑AATACACCCTTCGAGTCT‑ACCGTTAACCCCTacc > 1:27827/1‑237 (MQ=255) gTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTCCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAAACCGTCTCTCCTGAGCAT‑CACGGAAATAAGGGCGGTTTTTTCGGTTTGGTT‑TATCCCACCTTTGATCCT‑ACGGTTAAccctgtc > 1:660157/1‑232 (MQ=255) gcgttttttcttCCGATGGCATTTTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTAGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCAT‑AGCGTTAACCACTACACCAACAGCGt < 2:970702/233‑1 (MQ=255) cGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑CGGGCAATTTATCGCCCATTTTCCTTCACCCACGTTT‑TGGCAATGGC‑GCTTTCTTTTCTTGTGGCATTTATTC‑TTTCCCCTTCGTATTGTCCCAAGCCGCTTAATCCCGTCCCTGCTGTGCCT‑CCCGAAAATAAGGGCGGGTTTTTATGATGGTTT‑AATACACCCTTCGACCAA‑ACCTTTAAACACTCAACCaaacacagt > 2:1020278/1‑232 (MQ=255) ttttattCCGTTTGGTTTCTTGGGCGGTTCTTC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTTTCCCAATCGTTT‑CGGGAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CCCGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCAT‑AGCGTTAACCACTACACCAACAGCGTCGG‑Ca < 2:130486/238‑1 (MQ=255) gATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑TGGGGAATTTATCGGCCGTTATTTATTACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGGTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCCTCGTTTTGGGCAACGCCGCTTAAAACCGTCTCTGCTGTCCAT‑CCCGGAAATAAGGGCCGGGTCTTCCGGTGGGTT‑TATACCACCCTCTATCGT‑AACGTTTAACCCCACACCaaaaaaaacgagaaaaaacccc > 2:67414/1‑219 (MQ=255) gATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCCATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCCGCGTTATGTGCCACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCAT‑ATCGTTAACCCCTAAACCACCAACGTCGG‑CAAAATCCTCg > 1:15688/1‑239 (MQ=255) gATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCCGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGGGGCATTGGTTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACACTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CCCGAAAATAAGGGGGGTTTCTTTCGGTGGTTT‑TATTACACCCTCGATCAT‑AGCGGTAACCACCACACCAAAAGAGACGGACAAAAAcccg > 2:96303/1‑237 (MQ=255) gATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCCTCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CCCGAAAATAAGGGCGGTTTTTTCGGTTGGTTT‑TATACCACCTTCGTACAT‑CGCGTTAACCCCTAACCCACAAGCGTCGG‑CAAAAACCTCg > 1:450683/1‑239 (MQ=255) gATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CTGCCATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTTTGTGCAACCCTGCTTTAAACCGTCTCTGCTGAGCAT‑CCCGAAAATAAAGGCGGGTTCTTTCGTTGGGTT‑TATAACCCCTCCGTTTCT‑AAGGTTAACCACCCCACCAAAAACCTCGG‑CAAAAAccccc > 2:391265/1‑236 (MQ=255) gATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGCAAATAAAGGCGGTTTCTTTGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCCTAAGCG‑TAACCCCCACAccccacgcctcggccaaaaacccc > 1:363662/1‑217 (MQ=255) cgtgtcATTTTTGGGGGGTTTTTC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCATTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGGTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCAT‑AGCGTTAACCACTACACCAACAGCGTCGG‑CAAAATCCTCg < 2:363662/234‑1 (MQ=255) tccgcgtTTCTAT‑T‑GGGGCATTTTTTCGCCCGTTCTCTTTCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTCT‑AATACCACCTTCGATCAT‑AGCGTTAACCACTACACCAACAGCGTCGG‑CAAAATCCTCGGATCCACAGGa < 2:418398/236‑1 (MQ=255) ccggggTTTTAT‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTTCATCCCCATCGTTT‑GGGCAATGGC‑GGTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTTCCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCAT‑AGCGTTAACCACTACACCAACAGCGTCGG‑CAAAATCCTCGGATCCACAGGAc < 2:568738/235‑1 (MQ=255) cggTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGGTTCTTCGGTTGGGTT‑AATACCACCTTCGATCCT‑AGCGTTAACCACTCCACCAACACCGTCGG‑CAAAATCCCCGGATCCCCCGGACGat > 1:629634/1‑239 (MQ=255) ggTTCTTC‑T‑GGGGCATTTTACCGCCAGTTCTTTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCAT‑AGCGTTAACCACTACACCAACAGCGTCGG‑CAAAATCCTCGGATCCACAGGACGat < 1:1067994/238‑1 (MQ=255) ggTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCAT‑AGCGTTAACCACTACACCAACAGCGTCGG‑CAAAATCCTCGGATCCACAGGACGat < 1:96303/238‑1 (MQ=255) ggTTCCAC‑T‑GGGGCAATTTATAGCCGATTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑CCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAACCCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCAT‑AGCGTTAACCACTACACCAACAGCGTCGG‑CAAAATCCTCGGATCCACAGGACGat < 1:659859/238‑1 (MQ=255) | CTCCATCAACACACTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGTGGTGGAGAACGTCGAGCGCGTGATGATGGAGGATAAGCTCCCGCCAAAAGAAGCGACGGAAAAATCGATGTCGCAAATTCAGGGCGCACT‑GGTGGGTATCGCGATGGTGCTGTCAGCGGTATTTATTCCGATGGCATTCTTCGGCGGTTCTAC‑T‑GGGGCAATTTATCGCCAGTTCTCTATCACCATCGTTT‑CGGCAATGGC‑GCTTTCTGTTCTGGTGGCATTGATTC‑TTACCCCTGCGTTATGTGCAACGCTGCTTAAACCCGTCTCTGCTGAGCAT‑CACGAAAATAAGGGCGGTTTCTTCGGTTGGTTT‑AATACCACCTTCGATCAT‑AGCGTTAACCACTACACCAACAGCGTCGG‑CAAAATCCTCGGATCCACAGGACGAT > NC_000913/3416194‑3416648 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |